More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1101 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  86.38 
 
 
369 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  86.65 
 
 
369 aa  677    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  86.65 
 
 
369 aa  677    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  98.92 
 
 
369 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  99.19 
 
 
369 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  98.92 
 
 
369 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  86.65 
 
 
369 aa  677    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  100 
 
 
369 aa  764    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  99.46 
 
 
369 aa  760    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  86.65 
 
 
369 aa  677    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  86.65 
 
 
369 aa  677    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  86.65 
 
 
369 aa  678    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  86.38 
 
 
369 aa  675    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  86.92 
 
 
369 aa  680    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  80 
 
 
371 aa  622  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  68.39 
 
 
367 aa  552  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  67.57 
 
 
369 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  67.4 
 
 
370 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  67.4 
 
 
370 aa  534  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  66.49 
 
 
367 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  66.12 
 
 
367 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  64.4 
 
 
367 aa  511  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  64.58 
 
 
367 aa  501  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  41.32 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  39.73 
 
 
366 aa  275  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2174  MOSC domain-containing protein  44.85 
 
 
280 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.160462 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  44.61 
 
 
662 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  44.65 
 
 
605 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  43.7 
 
 
605 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  44.4 
 
 
616 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  41.95 
 
 
266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  41.64 
 
 
268 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  36.84 
 
 
267 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3078  MOSC domain containing protein  38.08 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.558728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  35.5 
 
 
265 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  39.78 
 
 
268 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0697  MOSC domain-containing protein  37.31 
 
 
283 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.722913  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1456  hypothetical protein  36.59 
 
 
283 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  35.66 
 
 
269 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  38.29 
 
 
268 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  37.97 
 
 
267 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  38.29 
 
 
268 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  37.97 
 
 
267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  37.31 
 
 
267 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1825  MOSC domain containing protein  33.58 
 
 
276 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013397  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  36.23 
 
 
267 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3776  MOSC domain-containing protein  34.78 
 
 
275 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0195  MOSC domain containing protein  36.17 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0141  MOSC domain containing protein  35.36 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  34.81 
 
 
269 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4133  MOSC domain containing protein  37.31 
 
 
293 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1157  MOSC domain containing protein  35.64 
 
 
285 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2402  MOSC domain-containing protein  35.27 
 
 
289 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1005  MOSC domain protein beta barrel domain protein  35.36 
 
 
285 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0446745  normal  0.3827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  33.09 
 
 
291 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1596  MOSC domain-containing protein  32.69 
 
 
264 aa  135  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1980  MOSC domain protein beta barrel domain protein  34.15 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.446271  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0886  MOSC domain-containing protein  36.23 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0982763  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2929  MOSC domain protein beta barrel domain protein  36.23 
 
 
289 aa  133  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3619  MOSC domain-containing protein  36.23 
 
 
289 aa  133  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0465  MOSC domain-containing protein  33.45 
 
 
290 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3268  MOSC domain-containing protein  34.28 
 
 
288 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.545549 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  34.18 
 
 
283 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7473  hypothetical protein  34.02 
 
 
269 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2217  hypothetical protein  34.74 
 
 
291 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704942  hitchhiker  0.00711608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0270  MOSC domain-containing protein  34.88 
 
 
290 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184524 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4117  MOSC-like beta barrel  33.8 
 
 
288 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4249  MOSC domain-containing protein  33.8 
 
 
288 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270492  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4642  MOSC domain protein beta barrel domain protein  33.1 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  32.73 
 
 
277 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1762  uncharacterized Fe-S protein  31.32 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553736 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  32.21 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0954  mosc domain-containing protein  30.5 
 
 
289 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0292187  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2279  MOSC domain-containing protein  30.5 
 
 
289 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1722  MOSC domain-containing protein  31.97 
 
 
416 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0687765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1125  MOSC domain-containing protein  30.5 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1126  MOSC-like beta barrel  31.79 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3673  MOSC domain-containing protein  32.99 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614742  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1041  mosc domain-containing protein  30.14 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3365  MOSC domain-containing protein  32.03 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03942  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08160)  28.79 
 
 
367 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4341  MOSC domain-containing protein  34.42 
 
 
314 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1002  MOSC domain-containing protein  34.4 
 
 
272 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  33.22 
 
 
272 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1533  MOSC domain-containing protein  29.18 
 
 
288 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.134662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4182  MOSC domain containing protein  32.87 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440376  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  31.25 
 
 
264 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18206  predicted protein  28.78 
 
 
342 aa  92  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.602779  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46641  predicted protein  27.02 
 
 
1036 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0116  MOSC domain-containing protein  31.38 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1499  MOSC domain-containing protein  31.38 
 
 
259 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06729  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05900)  25.07 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  27.04 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  46.27 
 
 
106 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  26.16 
 
 
264 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  27.02 
 
 
245 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  26.71 
 
 
264 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  27.02 
 
 
264 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  46.48 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0545  ferredoxin  40.54 
 
 
83 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>