269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2075 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2075  ferredoxin  100 
 
 
151 aa  310  5.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000572229  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2409  ferredoxin  87.63 
 
 
163 aa  188  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000581579  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  84 
 
 
140 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2053  ferredoxin  72 
 
 
140 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262921  unclonable  0.00000000000106292 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1914  ferredoxin  76.23 
 
 
136 aa  184  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318435  hitchhiker  0.0000000631262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2064  ferredoxin  76.23 
 
 
136 aa  184  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103253  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2057  ferredoxin  72 
 
 
140 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  82.24 
 
 
136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  80.61 
 
 
144 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2135  ferredoxin  60.68 
 
 
133 aa  147  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2062  ferredoxin  61.06 
 
 
136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1726  iron-sulfur cluster-binding protein  67.71 
 
 
117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.347237  hitchhiker  0.00725733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2301  ferredoxin  65.62 
 
 
125 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12598  normal  0.0821826 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  51.22 
 
 
137 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2308  ferredoxin  63.92 
 
 
116 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  hitchhiker  0.0000241513 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1944  ferredoxin  61 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.241389  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  51.39 
 
 
86 aa  88.2  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  48.75 
 
 
86 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  50 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  48.44 
 
 
86 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2464  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.06 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2387  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.44 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2506  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.06 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2623  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.06 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.123357 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  46.48 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.06 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.44 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.100794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3370  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.44 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2519  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.06 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460389 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02162  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  43.06 
 
 
84 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1423  ferredoxin  43.06 
 
 
84 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2616  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.06 
 
 
84 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2533  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.06 
 
 
84 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2376  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.06 
 
 
84 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02121  hypothetical protein  43.06 
 
 
84 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2803  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.06 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697891  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  40.48 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  46.77 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.65 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0384  iron-sulfur cluster binding protein  50 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1315  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.19 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.19 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.19 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0962  ferredoxin, 2Fe-2S type  47.62 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000314737  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4191  ferredoxin  42.03 
 
 
74 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.661673  normal  0.663207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  39.44 
 
 
549 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2475  ferredoxin  48.28 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.11 
 
 
687 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3505  GCN5-related N-acetyltransferase  36.62 
 
 
291 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.79 
 
 
686 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1108  ferredoxin  40.3 
 
 
83 aa  60.8  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  37.93 
 
 
675 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.07 
 
 
690 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1772  putative ferredoxin  38.75 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0325703  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.43 
 
 
353 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.64 
 
 
322 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.12 
 
 
681 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.13 
 
 
713 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.64 
 
 
322 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  35.64 
 
 
322 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  40.24 
 
 
367 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.64 
 
 
322 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0117  2Fe-2S-binding domain-containing protein  38.1 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.781122  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.64 
 
 
322 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  42.31 
 
 
367 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.64 
 
 
322 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.64 
 
 
322 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  35.64 
 
 
322 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  41.18 
 
 
676 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.64 
 
 
322 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.64 
 
 
322 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  38.98 
 
 
691 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0545  ferredoxin  35.37 
 
 
83 aa  55.1  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.7 
 
 
390 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  38.57 
 
 
590 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2998  ferredoxin  36.84 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  37.29 
 
 
711 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  39.06 
 
 
588 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.46 
 
 
689 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  45.76 
 
 
682 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.92 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.92 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.31 
 
 
370 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.29 
 
 
691 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.11 
 
 
700 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.31 
 
 
370 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  37.31 
 
 
369 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.92 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.92 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32 
 
 
687 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.91 
 
 
346 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.92 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  37.14 
 
 
596 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.8 
 
 
412 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  38.98 
 
 
678 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.06 
 
 
684 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  34.88 
 
 
371 aa  51.2  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  30.69 
 
 
586 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  38.96 
 
 
1155 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.71 
 
 
678 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>