More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2763 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  55.47 
 
 
690 aa  729    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  53.1 
 
 
668 aa  638    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.935867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  54.52 
 
 
676 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  100 
 
 
675 aa  1352    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  58.47 
 
 
691 aa  758    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  58.86 
 
 
687 aa  761    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  59.53 
 
 
687 aa  784    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  60.32 
 
 
686 aa  756    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  54.2 
 
 
691 aa  672    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  52.28 
 
 
681 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  52.46 
 
 
678 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  51.56 
 
 
678 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  50.52 
 
 
678 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  49.93 
 
 
676 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  44.49 
 
 
711 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  46.09 
 
 
684 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  46.68 
 
 
684 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  45.28 
 
 
682 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  45.51 
 
 
692 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  45.51 
 
 
692 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  45.03 
 
 
689 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.16 
 
 
700 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  36.2 
 
 
674 aa  429  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4050  hypothetical protein  56.91 
 
 
330 aa  349  8e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4730  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  59.32 
 
 
311 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115122  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  56.91 
 
 
310 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300031  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0911  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  55.26 
 
 
317 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  54.03 
 
 
307 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  47.81 
 
 
713 aa  302  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  51.88 
 
 
323 aa  294  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  55.18 
 
 
306 aa  293  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4124  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  54.64 
 
 
306 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4488  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  54.64 
 
 
305 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0646  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  52.4 
 
 
316 aa  283  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  53.49 
 
 
308 aa  282  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  0.460279 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43312  predicted protein  34.37 
 
 
627 aa  279  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1905  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  49.21 
 
 
321 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.203473  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0408  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  48.99 
 
 
820 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5039  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  48.83 
 
 
321 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2103  hypothetical protein  46.42 
 
 
310 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  43.77 
 
 
307 aa  227  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3093  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  45.07 
 
 
304 aa  221  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0622009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24820  hypothetical protein  44.71 
 
 
310 aa  216  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.447452  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1070  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  46.33 
 
 
714 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2244  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.25 
 
 
313 aa  208  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.856574  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2668  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  46.33 
 
 
399 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.89 
 
 
412 aa  207  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  46.33 
 
 
414 aa  207  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0108  hypothetical protein  47.81 
 
 
410 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1269  hypothetical protein  47.81 
 
 
419 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1307  hypothetical protein  37 
 
 
305 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.61 
 
 
445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.66 
 
 
353 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1223  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  40.27 
 
 
314 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.0162302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.55 
 
 
390 aa  182  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1874  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.73 
 
 
284 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  36.08 
 
 
596 aa  170  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  34.68 
 
 
586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4621  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  34.65 
 
 
305 aa  165  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  39.06 
 
 
403 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  33.24 
 
 
581 aa  160  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  37.8 
 
 
411 aa  160  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  32.66 
 
 
627 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06023  oxidoreductase, FAD-binding, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07600)  28.94 
 
 
640 aa  158  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0324685 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  34.51 
 
 
586 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  30.82 
 
 
586 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1914  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  35.25 
 
 
293 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  34.75 
 
 
409 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  39.92 
 
 
402 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.4 
 
 
403 aa  151  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  28.53 
 
 
373 aa  148  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  32.31 
 
 
590 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  33.87 
 
 
414 aa  147  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1892  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.04 
 
 
294 aa  147  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.955311  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.95 
 
 
383 aa  146  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 
402 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  32.24 
 
 
366 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  32.24 
 
 
366 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  32.75 
 
 
1138 aa  145  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  32.22 
 
 
588 aa  145  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  36.61 
 
 
402 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  33.24 
 
 
364 aa  144  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0969  nitric oxide dioxygenase  34.75 
 
 
423 aa  144  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.137694  normal  0.0138657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  34.51 
 
 
625 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  35.77 
 
 
400 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  40.87 
 
 
393 aa  143  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.51 
 
 
585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  33.11 
 
 
411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  32.94 
 
 
402 aa  142  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  33.77 
 
 
414 aa  142  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252799 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  38.76 
 
 
402 aa  142  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  33.01 
 
 
414 aa  142  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.33 
 
 
367 aa  140  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  32.55 
 
 
402 aa  140  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  33.2 
 
 
402 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  32.05 
 
 
1148 aa  140  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  33.55 
 
 
605 aa  140  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  34.6 
 
 
605 aa  140  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  35.84 
 
 
409 aa  140  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  32.47 
 
 
402 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>