More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5689 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  55.67 
 
 
687 aa  692    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  58.97 
 
 
678 aa  779    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  58.09 
 
 
678 aa  772    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  100 
 
 
676 aa  1368    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  54.36 
 
 
668 aa  653    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.935867  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  54.37 
 
 
675 aa  660    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  56.41 
 
 
691 aa  730    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  57.48 
 
 
687 aa  737    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  57.12 
 
 
676 aa  723    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  54.29 
 
 
691 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  55.15 
 
 
690 aa  708    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  57.94 
 
 
678 aa  739    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  54.85 
 
 
686 aa  661    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  62.04 
 
 
681 aa  815    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  44.24 
 
 
711 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.25 
 
 
700 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  44.48 
 
 
684 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.43 
 
 
684 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  43.97 
 
 
692 aa  482  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  43.97 
 
 
692 aa  482  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  43.29 
 
 
689 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.93 
 
 
682 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  35.37 
 
 
674 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4050  hypothetical protein  54.49 
 
 
330 aa  326  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  58.31 
 
 
310 aa  321  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300031  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  52.47 
 
 
323 aa  317  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4730  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  56.27 
 
 
311 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115122  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0911  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  54.92 
 
 
317 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  52.22 
 
 
307 aa  301  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  56.61 
 
 
306 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4488  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  55.63 
 
 
305 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0646  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  50.62 
 
 
316 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43312  predicted protein  34.29 
 
 
627 aa  282  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1905  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  50.16 
 
 
321 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.203473  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  52.2 
 
 
308 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  0.460279 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  43.1 
 
 
713 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4124  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  49.32 
 
 
306 aa  266  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0408  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  47.21 
 
 
820 aa  266  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5039  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  47.97 
 
 
321 aa  259  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2103  hypothetical protein  48.48 
 
 
310 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24820  hypothetical protein  50.17 
 
 
310 aa  250  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.447452  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3093  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  48.2 
 
 
304 aa  246  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0622009 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.69 
 
 
307 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1070  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  44.62 
 
 
714 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2668  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  44.62 
 
 
399 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  44.62 
 
 
414 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0108  hypothetical protein  43.54 
 
 
410 aa  211  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1269  hypothetical protein  43.54 
 
 
419 aa  211  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1307  hypothetical protein  44.57 
 
 
305 aa  208  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  40.72 
 
 
596 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2244  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.57 
 
 
313 aa  193  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.856574  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  35.45 
 
 
588 aa  189  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.75 
 
 
353 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.7 
 
 
445 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  34.74 
 
 
581 aa  186  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.01 
 
 
412 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1223  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  40.82 
 
 
314 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.0162302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  34.71 
 
 
586 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  31.26 
 
 
586 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  34.63 
 
 
590 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1874  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.28 
 
 
284 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  35.23 
 
 
605 aa  172  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1914  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  37.23 
 
 
293 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.06 
 
 
390 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 
586 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  35.73 
 
 
605 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  34.36 
 
 
402 aa  157  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1892  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.18 
 
 
294 aa  156  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.955311  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  33.59 
 
 
402 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0780  oxidoreductase, FAD-binding  35.86 
 
 
248 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00269433  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4621  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  34.56 
 
 
305 aa  152  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0756  flavohemoprotein  35.46 
 
 
248 aa  151  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000736085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  33.72 
 
 
402 aa  150  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  42.17 
 
 
393 aa  150  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  33.8 
 
 
402 aa  150  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  32.76 
 
 
616 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  33.05 
 
 
662 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 
402 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  32.95 
 
 
402 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  32.95 
 
 
402 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  32.95 
 
 
402 aa  147  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  34.11 
 
 
402 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  32.95 
 
 
402 aa  147  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  28.33 
 
 
373 aa  146  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  32.95 
 
 
402 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  35.21 
 
 
411 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06023  oxidoreductase, FAD-binding, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07600)  28.59 
 
 
640 aa  144  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0324685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.6 
 
 
351 aa  143  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07160  response to stress-related protein, putative  35.19 
 
 
504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  30.34 
 
 
627 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5761  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:oxidoreductase FAD-binding region  29.76 
 
 
1142 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.17 
 
 
394 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.96 
 
 
402 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  30.08 
 
 
1148 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  41.34 
 
 
393 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.51 
 
 
585 aa  138  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3637  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.61 
 
 
365 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.52 
 
 
362 aa  137  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  34.25 
 
 
402 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1895  nitric oxide dioxygenase  37.65 
 
 
419 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00231107  normal  0.14211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>