More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43312 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43312  predicted protein  100 
 
 
627 aa  1296    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.41 
 
 
681 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  34.78 
 
 
676 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.23 
 
 
687 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.21 
 
 
675 aa  284  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.82 
 
 
687 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.07 
 
 
678 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  34.69 
 
 
678 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.71 
 
 
684 aa  281  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.65 
 
 
678 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.69 
 
 
700 aa  276  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  32.03 
 
 
674 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.11 
 
 
686 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.27 
 
 
690 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.07 
 
 
684 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.48 
 
 
689 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  31.47 
 
 
691 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.6 
 
 
676 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.48 
 
 
691 aa  259  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.9 
 
 
692 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  30.29 
 
 
711 aa  258  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.9 
 
 
692 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.26 
 
 
682 aa  257  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.75 
 
 
668 aa  257  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.935867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1905  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.59 
 
 
321 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.203473  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0408  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  36.59 
 
 
820 aa  188  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.65 
 
 
307 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.71 
 
 
713 aa  183  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0646  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.85 
 
 
316 aa  180  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5039  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.65 
 
 
321 aa  178  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.69 
 
 
323 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24820  hypothetical protein  35.66 
 
 
310 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.447452  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2244  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.05 
 
 
313 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.856574  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.81 
 
 
308 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  0.460279 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1070  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  37.11 
 
 
714 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2668  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  37.11 
 
 
399 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  37.11 
 
 
414 aa  170  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2103  hypothetical protein  36.4 
 
 
310 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0911  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.54 
 
 
317 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0108  hypothetical protein  36.88 
 
 
410 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.92 
 
 
310 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300031  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1269  hypothetical protein  36.88 
 
 
419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4124  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.66 
 
 
306 aa  163  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4488  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.08 
 
 
305 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.41 
 
 
306 aa  163  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4730  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.56 
 
 
311 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115122  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.08 
 
 
307 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1307  hypothetical protein  31.72 
 
 
305 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4050  hypothetical protein  31.19 
 
 
330 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  38.18 
 
 
596 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.75 
 
 
445 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1223  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  33.44 
 
 
314 aa  137  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.0162302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1892  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.98 
 
 
294 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.955311  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  34.69 
 
 
586 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3093  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.81 
 
 
304 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0622009 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  36.8 
 
 
397 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  36.94 
 
 
397 aa  128  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  36.09 
 
 
397 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  36.74 
 
 
586 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  35.11 
 
 
411 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  37.02 
 
 
397 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  34.63 
 
 
402 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  36.6 
 
 
397 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  36.09 
 
 
397 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  34.28 
 
 
402 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1914  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  31.25 
 
 
293 aa  124  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4621  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  32.38 
 
 
305 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1874  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.8 
 
 
284 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0756  flavohemoprotein  32.25 
 
 
248 aa  122  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000736085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  34.46 
 
 
397 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  33.92 
 
 
402 aa  120  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  32.86 
 
 
402 aa  120  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  33.92 
 
 
402 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  32.75 
 
 
586 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  33.92 
 
 
402 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  32.72 
 
 
393 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  34.91 
 
 
581 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  33.57 
 
 
402 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0780  oxidoreductase, FAD-binding  31.88 
 
 
248 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00269433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  33.57 
 
 
402 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  33.57 
 
 
402 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  33.8 
 
 
402 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  33.22 
 
 
402 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  32.47 
 
 
588 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  32.61 
 
 
393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  34.58 
 
 
396 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.13 
 
 
353 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.67 
 
 
403 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  33.45 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.58 
 
 
393 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  33.74 
 
 
394 aa  115  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  32.72 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  32.6 
 
 
392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  31.14 
 
 
394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  31.64 
 
 
590 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  32.6 
 
 
392 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06023  oxidoreductase, FAD-binding, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07600)  32.25 
 
 
640 aa  114  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0324685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  31.25 
 
 
393 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  31.99 
 
 
393 aa  113  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  32.6 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.824868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>