More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5567 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  51.65 
 
 
678 aa  661    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  52.56 
 
 
678 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  58.55 
 
 
691 aa  783    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  55.15 
 
 
676 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  54.39 
 
 
681 aa  701    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  51.58 
 
 
678 aa  660    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  55.47 
 
 
675 aa  727    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  73.66 
 
 
691 aa  1042    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  63.16 
 
 
687 aa  827    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  57.47 
 
 
668 aa  748    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.935867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  65.42 
 
 
687 aa  885    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  100 
 
 
690 aa  1402    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  63.62 
 
 
686 aa  804    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  49.21 
 
 
676 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  44.27 
 
 
711 aa  588  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.99 
 
 
700 aa  548  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  45.66 
 
 
684 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  43.95 
 
 
682 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  45.6 
 
 
684 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  44.1 
 
 
692 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  44.1 
 
 
692 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.51 
 
 
689 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  36.55 
 
 
674 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4730  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  60.6 
 
 
311 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115122  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  61.84 
 
 
310 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300031  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4050  hypothetical protein  57.56 
 
 
330 aa  360  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0911  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  58.75 
 
 
317 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  57.7 
 
 
307 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4124  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  55.29 
 
 
306 aa  324  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  47.32 
 
 
713 aa  308  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4488  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  54.58 
 
 
305 aa  299  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  54.39 
 
 
306 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1905  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  47.48 
 
 
321 aa  280  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.203473  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  52.54 
 
 
308 aa  278  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  0.460279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  48.61 
 
 
323 aa  277  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0646  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  51.24 
 
 
316 aa  277  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43312  predicted protein  31.63 
 
 
627 aa  262  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0408  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  45.42 
 
 
820 aa  246  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2103  hypothetical protein  45.03 
 
 
310 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5039  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  45.79 
 
 
321 aa  238  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24820  hypothetical protein  45.48 
 
 
310 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.447452  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1307  hypothetical protein  40 
 
 
305 aa  228  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.68 
 
 
445 aa  217  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2244  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.03 
 
 
313 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.856574  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  43.53 
 
 
307 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.83 
 
 
353 aa  212  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.66 
 
 
412 aa  211  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1070  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  42.99 
 
 
714 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.09 
 
 
390 aa  208  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  45.12 
 
 
414 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2668  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  45.12 
 
 
399 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0108  hypothetical protein  43.32 
 
 
410 aa  203  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1269  hypothetical protein  43.32 
 
 
419 aa  203  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  33.26 
 
 
581 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  36.68 
 
 
596 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3093  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.49 
 
 
304 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0622009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  34.92 
 
 
586 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  37.14 
 
 
586 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  35.71 
 
 
590 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  34.34 
 
 
586 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  36.76 
 
 
411 aa  178  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  35.75 
 
 
588 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1223  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  39.25 
 
 
314 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.0162302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  35.33 
 
 
414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1874  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.8 
 
 
284 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  34.45 
 
 
411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  39.52 
 
 
403 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  36.97 
 
 
414 aa  164  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4621  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  34.65 
 
 
305 aa  163  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  34.43 
 
 
409 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  35.67 
 
 
413 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.95 
 
 
403 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1914  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  38.99 
 
 
293 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  33.58 
 
 
394 aa  158  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  35.71 
 
 
394 aa  158  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.75 
 
 
408 aa  157  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  34.19 
 
 
402 aa  156  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  33.46 
 
 
402 aa  156  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  33.15 
 
 
1138 aa  155  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0969  nitric oxide dioxygenase  37.55 
 
 
423 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.137694  normal  0.0138657 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.85 
 
 
403 aa  153  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  34.49 
 
 
414 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252799 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  32.61 
 
 
402 aa  152  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  33.95 
 
 
403 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  33.45 
 
 
394 aa  151  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  33.46 
 
 
402 aa  151  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  33.46 
 
 
402 aa  151  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  35.85 
 
 
400 aa  151  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  33.09 
 
 
402 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  33.09 
 
 
402 aa  151  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  35.66 
 
 
396 aa  150  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0909  nitric oxide dioxygenase  36.36 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357631  normal  0.205289 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  32.72 
 
 
402 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  32.72 
 
 
402 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  32.72 
 
 
402 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  37.3 
 
 
403 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  34.44 
 
 
402 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  37.8 
 
 
397 aa  146  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  37.8 
 
 
397 aa  146  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  36.51 
 
 
402 aa  146  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>