More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5676 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 		 408 aa  828    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  69.46 
 
 		 411 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  69.63 
 
 		 414 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  67.16 
 
 		 414 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  67.73 
 
 		 413 aa  552  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  66.18 
 
 		 403 aa  548  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  66.75 
 
 		 414 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.252799 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0969  nitric oxide dioxygenase  66.75 
 
 		 423 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.137694  normal  0.0138657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0909  nitric oxide dioxygenase  65.27 
 
 		 413 aa  531  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357631  normal  0.205289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  63.97 
 
 		 403 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  62.5 
 
 		 409 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  61.27 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  58.31 
 
 		 409 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  53.92 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  53.92 
 
 		 397 aa  428  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  53.66 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1514  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  53.32 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.156255 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  48.4 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  45.61 
 
 		 403 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  47.37 
 
 		 403 aa  352  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  44.17 
 
 		 402 aa  333  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  43.92 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  42.93 
 
 		 402 aa  329  7e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  43.42 
 
 		 402 aa  328  9e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  43.42 
 
 		 402 aa  328  9e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  43.42 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  43.18 
 
 		 402 aa  326  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  43.18 
 
 		 402 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  43.18 
 
 		 402 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  44.64 
 
 		 426 aa  325  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  42.43 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  42.93 
 
 		 402 aa  322  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  41.69 
 
 		 397 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  41.69 
 
 		 397 aa  319  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.55 
 
 		 399 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  42.18 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  42.18 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  41.69 
 
 		 397 aa  311  9e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  43.84 
 
 		 411 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  41.69 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  41.94 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  41.44 
 
 		 397 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  46.78 
 
 		 393 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  45.79 
 
 		 392 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  45.54 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  45.54 
 
 		 393 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1079  nitric oxide dioxygenase  44.17 
 
 		 408 aa  307  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  41.44 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  45.3 
 
 		 392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  44.8 
 
 		 393 aa  305  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  41.19 
 
 		 397 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  43.28 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3408  nitric oxide dioxygenase  46.29 
 
 		 393 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  43.52 
 
 		 393 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4378  nitric oxide dioxygenase  45.05 
 
 		 392 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4652  nitric oxide dioxygenase  45.34 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.6 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  42.96 
 
 		 393 aa  299  5e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  41.25 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  41.36 
 
 		 400 aa  298  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  41.85 
 
 		 400 aa  296  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.79 
 
 		 402 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  41.79 
 
 		 402 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  41.54 
 
 		 402 aa  292  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.04 
 
 		 402 aa  292  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.9 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  42.04 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  43.18 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1895  nitric oxide dioxygenase  46.68 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00231107  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  42.29 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  41.1 
 
 		 396 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.1 
 
 		 396 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  41.1 
 
 		 396 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  41.1 
 
 		 396 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  41.1 
 
 		 396 aa  290  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  41.1 
 
 		 396 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  41.1 
 
 		 396 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  41.1 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  41.1 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  41.79 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  42.04 
 
 		 402 aa  289  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  40.75 
 
 		 394 aa  289  7e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  41.75 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  41.09 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.79 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  41.54 
 
 		 402 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  41.54 
 
 		 402 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  41.54 
 
 		 402 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  41.54 
 
 		 402 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  40.94 
 
 		 396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  42.12 
 
 		 393 aa  286  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  39.85 
 
 		 396 aa  286  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  42.26 
 
 		 393 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  39 
 
 		 394 aa  282  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  39.42 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  38.25 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  39.76 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  40.6 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  40.6 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  40.6 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>