More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1346 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  52.97 
 
 
678 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  59.13 
 
 
668 aa  726    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.935867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  53.1 
 
 
681 aa  672    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  54.85 
 
 
676 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  60.7 
 
 
675 aa  782    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  64.81 
 
 
691 aa  866    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  53.53 
 
 
678 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  63.62 
 
 
690 aa  855    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  75.55 
 
 
687 aa  1032    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  100 
 
 
686 aa  1342    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  58.06 
 
 
691 aa  730    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  75.55 
 
 
687 aa  989    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  52.97 
 
 
678 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  52.83 
 
 
676 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  44.04 
 
 
711 aa  585  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  48.84 
 
 
684 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  48.1 
 
 
684 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  45.34 
 
 
682 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.15 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  48.2 
 
 
692 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  48.2 
 
 
692 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  47.38 
 
 
689 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  36.16 
 
 
674 aa  449  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4730  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  64.75 
 
 
311 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115122  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  63.09 
 
 
310 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300031  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4050  hypothetical protein  58.77 
 
 
330 aa  353  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0911  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  57.88 
 
 
317 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  57.77 
 
 
307 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4124  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  57.73 
 
 
306 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  49.14 
 
 
713 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4488  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  58.25 
 
 
305 aa  297  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  57.38 
 
 
306 aa  296  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  55.89 
 
 
308 aa  290  9e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  0.460279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  49.84 
 
 
323 aa  279  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0646  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  51.58 
 
 
316 aa  279  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0408  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  52.65 
 
 
820 aa  276  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1905  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  48.72 
 
 
321 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.203473  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43312  predicted protein  32.27 
 
 
627 aa  268  2.9999999999999995e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5039  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  49.49 
 
 
321 aa  254  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2103  hypothetical protein  48.8 
 
 
310 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1070  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  53.43 
 
 
714 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2668  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  53.43 
 
 
399 aa  231  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  53.43 
 
 
414 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0108  hypothetical protein  53.05 
 
 
410 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1269  hypothetical protein  53.05 
 
 
419 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24820  hypothetical protein  47.59 
 
 
310 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.447452  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  47.59 
 
 
307 aa  221  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3093  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.8 
 
 
304 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0622009 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.78 
 
 
412 aa  216  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1307  hypothetical protein  39.14 
 
 
305 aa  213  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2244  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  43.05 
 
 
313 aa  212  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.856574  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.15 
 
 
445 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  38.08 
 
 
390 aa  207  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  40.69 
 
 
596 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34 
 
 
353 aa  198  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  32.75 
 
 
581 aa  187  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  32.97 
 
 
586 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1223  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  40.89 
 
 
314 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.0162302 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1874  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.9 
 
 
284 aa  182  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  38.59 
 
 
588 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4621  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  34.87 
 
 
305 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  36.21 
 
 
586 aa  173  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  37.64 
 
 
411 aa  170  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  34.66 
 
 
590 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.37 
 
 
403 aa  165  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  37.8 
 
 
409 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  34.07 
 
 
586 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  35.51 
 
 
400 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  35.69 
 
 
1138 aa  155  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.6 
 
 
399 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1914  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  34.51 
 
 
293 aa  154  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  32.4 
 
 
426 aa  153  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.63 
 
 
403 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  32.23 
 
 
1155 aa  150  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06023  oxidoreductase, FAD-binding, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07600)  26.99 
 
 
640 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0324685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1892  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.44 
 
 
294 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.955311  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  34.18 
 
 
414 aa  146  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  30.74 
 
 
402 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  32.44 
 
 
410 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  31.11 
 
 
402 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  30.74 
 
 
402 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  31.55 
 
 
1148 aa  144  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  38.31 
 
 
403 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  29.63 
 
 
402 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  30.74 
 
 
402 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  37.27 
 
 
403 aa  143  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  28.67 
 
 
394 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  35.04 
 
 
403 aa  142  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.69 
 
 
402 aa  142  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  30.6 
 
 
396 aa  142  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  30.37 
 
 
402 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  33.86 
 
 
411 aa  140  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  30.37 
 
 
402 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  34.71 
 
 
625 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  28.85 
 
 
373 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  35.02 
 
 
402 aa  140  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  31.75 
 
 
394 aa  140  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  32.22 
 
 
402 aa  140  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.11 
 
 
408 aa  140  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  36.19 
 
 
402 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>