More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1434 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  100 
 
 
586 aa  1191    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  31.96 
 
 
581 aa  273  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  31.64 
 
 
590 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  31.74 
 
 
586 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  30.53 
 
 
586 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  32.28 
 
 
596 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  30.76 
 
 
588 aa  248  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  31.93 
 
 
674 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.59 
 
 
445 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  30 
 
 
549 aa  190  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.13 
 
 
678 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.53 
 
 
700 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.99 
 
 
687 aa  185  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.44 
 
 
678 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  35.44 
 
 
678 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  34.44 
 
 
691 aa  181  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  31.28 
 
 
711 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.46 
 
 
676 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.34 
 
 
690 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.51 
 
 
681 aa  174  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.68 
 
 
675 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.25 
 
 
687 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
676 aa  165  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.02 
 
 
353 aa  160  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.69 
 
 
691 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5761  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:oxidoreductase FAD-binding region  31.82 
 
 
1142 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.72 
 
 
682 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31 
 
 
412 aa  152  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.96 
 
 
713 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.15 
 
 
686 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.87 
 
 
684 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  32.84 
 
 
426 aa  147  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.01 
 
 
668 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.935867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  31.43 
 
 
396 aa  144  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  35.85 
 
 
411 aa  144  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0756  flavohemoprotein  32.69 
 
 
248 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000736085  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0780  oxidoreductase, FAD-binding  32.69 
 
 
248 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00269433  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  29.73 
 
 
1148 aa  140  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.82 
 
 
390 aa  140  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.09 
 
 
408 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.86 
 
 
684 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  35.85 
 
 
414 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  32.14 
 
 
397 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  31.68 
 
 
396 aa  137  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  31.79 
 
 
397 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  30.36 
 
 
396 aa  137  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  28.67 
 
 
394 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  30.71 
 
 
396 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  30.36 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  31.79 
 
 
397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  30.71 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  30.36 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  30.36 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4652  nitric oxide dioxygenase  32.1 
 
 
393 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  31.43 
 
 
397 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.31 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  28.21 
 
 
394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  34.62 
 
 
393 aa  134  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 
414 aa  134  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252799 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  32.71 
 
 
402 aa  133  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  30.36 
 
 
396 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0909  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 
413 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357631  normal  0.205289 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  30.36 
 
 
396 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  30.36 
 
 
396 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  31.6 
 
 
402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  36.15 
 
 
409 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0969  nitric oxide dioxygenase  32.01 
 
 
423 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.137694  normal  0.0138657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  33.46 
 
 
402 aa  132  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  29.64 
 
 
396 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  32.96 
 
 
414 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  31.07 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.07 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  30.66 
 
 
402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  31.07 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  31.07 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  31.07 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  31.07 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  30.29 
 
 
402 aa  130  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  34.23 
 
 
403 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  29.49 
 
 
351 aa  130  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  31.07 
 
 
396 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.08 
 
 
402 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 
1155 aa  130  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  31.56 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  30.71 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  32.25 
 
 
1138 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  30.91 
 
 
403 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1079  nitric oxide dioxygenase  34.2 
 
 
408 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  30.71 
 
 
396 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  30.36 
 
 
397 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  30.36 
 
 
397 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  34.2 
 
 
402 aa  128  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  30.86 
 
 
402 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  30.86 
 
 
402 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  32.09 
 
 
399 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.32 
 
 
402 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  30.86 
 
 
402 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  33.46 
 
 
393 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  30.86 
 
 
402 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  28.98 
 
 
394 aa  126  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>