More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4652 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  78.12 
 
 
392 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4652  nitric oxide dioxygenase  100 
 
 
393 aa  800    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  77.61 
 
 
392 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4378  nitric oxide dioxygenase  77.35 
 
 
392 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  77.86 
 
 
392 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  71.5 
 
 
393 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  70.74 
 
 
393 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3408  nitric oxide dioxygenase  69.72 
 
 
393 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  68.96 
 
 
393 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  68.45 
 
 
393 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  67.94 
 
 
393 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  69.21 
 
 
393 aa  545  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  69.21 
 
 
393 aa  544  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1079  nitric oxide dioxygenase  67.18 
 
 
408 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1895  nitric oxide dioxygenase  66.92 
 
 
419 aa  521  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00231107  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  65.14 
 
 
393 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  58.78 
 
 
393 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  53.54 
 
 
394 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  48.22 
 
 
393 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  46.08 
 
 
414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  44.05 
 
 
393 aa  319  6e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  45.77 
 
 
397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  45.14 
 
 
397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0969  nitric oxide dioxygenase  47.28 
 
 
423 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.137694  normal  0.0138657 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  44.89 
 
 
397 aa  309  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  45.02 
 
 
397 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  45.73 
 
 
411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  47.03 
 
 
414 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  43.6 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  47.47 
 
 
409 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  45.27 
 
 
397 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  44.14 
 
 
396 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  45.02 
 
 
397 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  46.48 
 
 
411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  43.1 
 
 
402 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  42.61 
 
 
402 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  42.12 
 
 
402 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  42.86 
 
 
402 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  42.86 
 
 
402 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  42.86 
 
 
402 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  42.86 
 
 
402 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  42.86 
 
 
402 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  42.86 
 
 
402 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.56 
 
 
402 aa  299  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  45.79 
 
 
413 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.22 
 
 
403 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  45.19 
 
 
414 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  41.94 
 
 
400 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  43.39 
 
 
397 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  44.55 
 
 
402 aa  295  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  43.1 
 
 
402 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  42.04 
 
 
426 aa  293  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0909  nitric oxide dioxygenase  44.55 
 
 
413 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357631  normal  0.205289 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  43.35 
 
 
402 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  43.35 
 
 
402 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  42.86 
 
 
402 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.35 
 
 
402 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.61 
 
 
402 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  42.61 
 
 
402 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  42.07 
 
 
396 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  41.27 
 
 
394 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  42.07 
 
 
396 aa  290  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  43.14 
 
 
402 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  42.07 
 
 
396 aa  289  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  42.89 
 
 
402 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.18 
 
 
403 aa  289  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  42.89 
 
 
399 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  42.89 
 
 
402 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  43.25 
 
 
403 aa  288  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.34 
 
 
408 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  43.28 
 
 
395 aa  287  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.85 
 
 
428 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  42.65 
 
 
402 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  42.65 
 
 
402 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  42.65 
 
 
402 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  42.65 
 
 
402 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  40.51 
 
 
394 aa  285  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  41.1 
 
 
394 aa  285  9e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  43.36 
 
 
403 aa  282  7.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  41.25 
 
 
394 aa  282  9e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  40.66 
 
 
396 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88330  flavohemoglobin  38.01 
 
 
401 aa  278  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.408575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  42.86 
 
 
409 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.97 
 
 
399 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  42 
 
 
400 aa  275  7e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  42.43 
 
 
403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  41.71 
 
 
395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  40.15 
 
 
396 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.690195 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  40.4 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.4 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  40.4 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  40.4 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  40.4 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  40.4 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  40.4 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  40.4 
 
 
396 aa  269  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  40.4 
 
 
396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  40.9 
 
 
396 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  40.9 
 
 
396 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  40.9 
 
 
396 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>