More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4685 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  53.36 
 
 
678 aa  677    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  53.05 
 
 
678 aa  679    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  57.48 
 
 
676 aa  722    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  59.53 
 
 
675 aa  779    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  65.42 
 
 
690 aa  885    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  64.11 
 
 
691 aa  879    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  75.55 
 
 
686 aa  962    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  53.81 
 
 
678 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  100 
 
 
687 aa  1377    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  52.67 
 
 
676 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  58.69 
 
 
668 aa  748    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.935867  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  59.74 
 
 
691 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  75.84 
 
 
687 aa  1016    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  56.09 
 
 
681 aa  720    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  44.77 
 
 
711 aa  598  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  46.83 
 
 
684 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.47 
 
 
700 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  45.41 
 
 
682 aa  525  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  46.53 
 
 
684 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  45.43 
 
 
689 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  45.61 
 
 
692 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  45.61 
 
 
692 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  37.02 
 
 
674 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  61.51 
 
 
310 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300031  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0911  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  57.89 
 
 
317 aa  356  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4730  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  60.54 
 
 
311 aa  350  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4050  hypothetical protein  56.45 
 
 
330 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  56.76 
 
 
307 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4124  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  55.03 
 
 
306 aa  321  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  50 
 
 
713 aa  317  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  55.25 
 
 
306 aa  289  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4488  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  54.36 
 
 
305 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  53.74 
 
 
308 aa  282  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  0.460279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0646  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  50.31 
 
 
316 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43312  predicted protein  33.23 
 
 
627 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  47.83 
 
 
323 aa  274  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0408  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  49.66 
 
 
820 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1905  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  47.3 
 
 
321 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.203473  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5039  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  47.49 
 
 
321 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2103  hypothetical protein  45.7 
 
 
310 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1070  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  50.92 
 
 
714 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2668  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  50.92 
 
 
399 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  50.92 
 
 
414 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  46.88 
 
 
307 aa  226  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1307  hypothetical protein  39.47 
 
 
305 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0108  hypothetical protein  50.55 
 
 
410 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1269  hypothetical protein  50.55 
 
 
419 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.39 
 
 
412 aa  221  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24820  hypothetical protein  43.34 
 
 
310 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.447452  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.43 
 
 
445 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3093  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.84 
 
 
304 aa  213  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0622009 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  39.83 
 
 
596 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2244  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.61 
 
 
313 aa  211  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.856574  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.38 
 
 
353 aa  204  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.36 
 
 
390 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  35.99 
 
 
586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  36.54 
 
 
581 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  36.57 
 
 
586 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1223  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  40.27 
 
 
314 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.0162302 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  35.51 
 
 
586 aa  167  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.6 
 
 
403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  33.43 
 
 
590 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  39.53 
 
 
409 aa  163  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4621  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  34.98 
 
 
305 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1914  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  36 
 
 
293 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  35.54 
 
 
588 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  37.15 
 
 
411 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1874  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.73 
 
 
284 aa  162  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  38.15 
 
 
403 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.18 
 
 
403 aa  154  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  36.5 
 
 
402 aa  153  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  33.99 
 
 
402 aa  152  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06023  oxidoreductase, FAD-binding, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07600)  27.76 
 
 
640 aa  151  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0324685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  33.2 
 
 
402 aa  151  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  35.97 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.89 
 
 
408 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  33.6 
 
 
402 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 
402 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  33.2 
 
 
402 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  34.65 
 
 
414 aa  148  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  33.2 
 
 
402 aa  147  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  33.71 
 
 
394 aa  147  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  32.81 
 
 
402 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  34.92 
 
 
402 aa  146  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  33.09 
 
 
394 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  31.62 
 
 
402 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  32.81 
 
 
402 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  34.08 
 
 
1138 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  32.81 
 
 
402 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0756  flavohemoprotein  31.6 
 
 
248 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000736085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  33.43 
 
 
411 aa  145  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  33.46 
 
 
426 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  34.94 
 
 
396 aa  144  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0780  oxidoreductase, FAD-binding  31.6 
 
 
248 aa  144  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00269433  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  38.37 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  38.37 
 
 
402 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  35.14 
 
 
394 aa  143  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  30.4 
 
 
627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  38.37 
 
 
399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  37.3 
 
 
414 aa  142  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>