More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6438 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  57.14 
 
 		 590 aa  641    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  64.33 
 
 		 596 aa  750    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  57.48 
 
 		 581 aa  697    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  74.74 
 
 		 586 aa  900    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  69.62 
 
 		 588 aa  812    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  100 
 
 		 586 aa  1194    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  34.24 
 
 		 549 aa  304  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  31.13 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.31 
 
 		 353 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.95 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.81 
 
 		 445 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  33.62 
 
 		 674 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.7 
 
 		 687 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.92 
 
 		 690 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.67 
 
 		 681 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  42.25 
 
 		 411 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  32.89 
 
 		 691 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  34.71 
 
 		 676 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  39.76 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.57 
 
 		 687 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.74 
 
 		 402 aa  180  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.28 
 
 		 676 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.26 
 
 		 678 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.19 
 
 		 684 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  39.76 
 
 		 402 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  39.76 
 
 		 399 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  39.76 
 
 		 402 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.31 
 
 		 678 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  38.34 
 
 		 402 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  39.37 
 
 		 402 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  39.37 
 
 		 402 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  39.37 
 
 		 402 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  39.37 
 
 		 402 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  35.06 
 
 		 678 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  35.16 
 
 		 1138 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  38.74 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  38.74 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  36.89 
 
 		 396 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.07 
 
 		 412 aa  174  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  37.3 
 
 		 396 aa  174  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2397  hypothetical protein  39.53 
 
 		 229 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  37.94 
 
 		 402 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3596  MOSC domain containing protein  40.19 
 
 		 211 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.564722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.94 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2936  hypothetical protein  39.53 
 
 		 229 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0245783  hitchhiker  0.00000764985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.24 
 
 		 700 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.34 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2471  hypothetical protein  38.6 
 
 		 228 aa  171  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.69 
 
 		 682 aa  170  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.79 
 
 		 684 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2246  MOSC domain-containing protein  40.1 
 
 		 229 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00173443  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.23 
 
 		 713 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.36 
 
 		 403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  37.45 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.45 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  37.45 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  37.45 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  36.36 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.8 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  37.45 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  37.45 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  37.45 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.48 
 
 		 686 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  34.78 
 
 		 402 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  37.45 
 
 		 396 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2272  hypothetical protein  37.67 
 
 		 228 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.762242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2232  hypothetical protein  37.67 
 
 		 228 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00032832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2456  hypothetical protein  37.67 
 
 		 228 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2440  hypothetical protein  37.67 
 
 		 228 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  34.78 
 
 		 402 aa  163  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  37.04 
 
 		 396 aa  163  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2189  hypothetical protein  37.67 
 
 		 228 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.108105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2534  hypothetical protein  37.67 
 
 		 228 aa  163  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100661  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  36.21 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  36.63 
 
 		 396 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  35.66 
 
 		 394 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  35.57 
 
 		 402 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  34.57 
 
 		 396 aa  161  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  34.57 
 
 		 396 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  37.86 
 
 		 396 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  34.57 
 
 		 396 aa  161  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  37.45 
 
 		 396 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  37.45 
 
 		 396 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  37.45 
 
 		 396 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  35.25 
 
 		 396 aa  160  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  37.45 
 
 		 396 aa  160  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.22 
 
 		 691 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  35.57 
 
 		 402 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  35.57 
 
 		 402 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  36.99 
 
 		 395 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.08 
 
 		 692 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.08 
 
 		 692 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  35.18 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  35.18 
 
 		 402 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2475  MOSC domain containing protein  40.09 
 
 		 215 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  35.18 
 
 		 402 aa  156  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.82 
 
 		 675 aa  156  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  37.4 
 
 		 397 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  37.4 
 
 		 397 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  36.55 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>