More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2544 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  100 
 
 
411 aa  850    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  62.78 
 
 
402 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  62.78 
 
 
402 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  62.28 
 
 
402 aa  502  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  62.28 
 
 
402 aa  501  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  61.79 
 
 
402 aa  498  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  62.03 
 
 
402 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  61.79 
 
 
402 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  62.03 
 
 
402 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  62.28 
 
 
402 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  61.79 
 
 
402 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  61.54 
 
 
402 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  49.12 
 
 
403 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  46.63 
 
 
426 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.47 
 
 
428 aa  360  2e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  48.62 
 
 
403 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  46.75 
 
 
396 aa  352  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  44.91 
 
 
397 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  44.91 
 
 
397 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  45.36 
 
 
396 aa  349  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  45.36 
 
 
396 aa  349  5e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  46.62 
 
 
400 aa  348  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0969  nitric oxide dioxygenase  46.84 
 
 
423 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.137694  normal  0.0138657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  46.93 
 
 
414 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  45.95 
 
 
414 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  45.11 
 
 
396 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  45.11 
 
 
396 aa  345  7e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  46.5 
 
 
396 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.5 
 
 
396 aa  345  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  46.5 
 
 
396 aa  345  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  46.5 
 
 
396 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  46.5 
 
 
396 aa  345  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  46.5 
 
 
396 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  46.5 
 
 
396 aa  345  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  46.5 
 
 
396 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  45.55 
 
 
396 aa  343  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  47.01 
 
 
394 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  46.5 
 
 
396 aa  344  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  45.05 
 
 
397 aa  344  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  45.32 
 
 
396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.73 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  45.57 
 
 
411 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  46.25 
 
 
396 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  44.55 
 
 
397 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  46.25 
 
 
396 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  46.25 
 
 
396 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  46.25 
 
 
396 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.47 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  44.55 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  46.88 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  46.25 
 
 
396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  44.55 
 
 
397 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  49.38 
 
 
393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  43.42 
 
 
400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  47 
 
 
395 aa  336  5e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  44.36 
 
 
396 aa  336  5e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  44.06 
 
 
397 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  43.93 
 
 
410 aa  335  5.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0909  nitric oxide dioxygenase  44.47 
 
 
413 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357631  normal  0.205289 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  47.13 
 
 
402 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  47.65 
 
 
393 aa  333  4e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  46.88 
 
 
402 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  48.08 
 
 
399 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  44.23 
 
 
414 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  47.83 
 
 
402 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  46.13 
 
 
409 aa  331  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  46.88 
 
 
402 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  46.88 
 
 
402 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  48.87 
 
 
393 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  46.88 
 
 
402 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  46.88 
 
 
402 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  47.31 
 
 
402 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.57 
 
 
402 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  43.81 
 
 
398 aa  328  7e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.89 
 
 
402 aa  328  9e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  46.38 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  46.38 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  43.86 
 
 
396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  45.54 
 
 
413 aa  327  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  44.67 
 
 
396 aa  327  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  43.11 
 
 
394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  43.61 
 
 
394 aa  326  6e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.13 
 
 
402 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3408  nitric oxide dioxygenase  47.36 
 
 
393 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  44.25 
 
 
395 aa  324  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  47.62 
 
 
393 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  44.84 
 
 
394 aa  323  5e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.57 
 
 
393 aa  322  9.000000000000001e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  45.23 
 
 
393 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  43.35 
 
 
409 aa  319  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  44.11 
 
 
394 aa  319  6e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  45.23 
 
 
393 aa  317  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  46.98 
 
 
393 aa  316  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0714  globin  43.28 
 
 
399 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.757687  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1895  nitric oxide dioxygenase  46.94 
 
 
419 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00231107  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  48.37 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  44.14 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  46.23 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4652  nitric oxide dioxygenase  46.48 
 
 
393 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.84 
 
 
408 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>