More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3322 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  58.55 
 
 
690 aa  789    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  58.06 
 
 
686 aa  692    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  59.77 
 
 
687 aa  738    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  54.29 
 
 
676 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
691 aa  1395    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  69.15 
 
 
668 aa  909    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.935867  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  54.4 
 
 
675 aa  674    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  59.37 
 
 
691 aa  803    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  59.74 
 
 
687 aa  776    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  51.75 
 
 
681 aa  651    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  51.17 
 
 
678 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  51.4 
 
 
678 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  51.3 
 
 
678 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  50.43 
 
 
676 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  43.08 
 
 
711 aa  535  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.67 
 
 
682 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.71 
 
 
700 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  44.98 
 
 
684 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  45.78 
 
 
684 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.22 
 
 
689 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  44.7 
 
 
692 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  44.7 
 
 
692 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  35.81 
 
 
674 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  63.96 
 
 
310 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300031  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4730  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  61.44 
 
 
311 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115122  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0911  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  60.71 
 
 
317 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  61.26 
 
 
307 aa  363  8e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4050  hypothetical protein  58.04 
 
 
330 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4124  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  56.25 
 
 
306 aa  327  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  57.19 
 
 
306 aa  313  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4488  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  58.53 
 
 
305 aa  310  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  56.63 
 
 
308 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  0.460279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  50.15 
 
 
323 aa  290  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1905  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  50.16 
 
 
321 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.203473  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0646  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  50.78 
 
 
316 aa  265  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43312  predicted protein  32.17 
 
 
627 aa  251  4e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  48.01 
 
 
713 aa  250  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0408  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  45.82 
 
 
820 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5039  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  47.04 
 
 
321 aa  243  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  43.75 
 
 
307 aa  223  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1070  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  45.21 
 
 
714 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2668  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  45.21 
 
 
399 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  45.21 
 
 
414 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2103  hypothetical protein  44.3 
 
 
310 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24820  hypothetical protein  45.48 
 
 
310 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.447452  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0108  hypothetical protein  44.64 
 
 
410 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1269  hypothetical protein  44.64 
 
 
419 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.94 
 
 
412 aa  210  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3093  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.38 
 
 
304 aa  204  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0622009 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.15 
 
 
445 aa  203  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1307  hypothetical protein  37.75 
 
 
305 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2244  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.5 
 
 
313 aa  196  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.856574  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.28 
 
 
390 aa  188  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  39.38 
 
 
596 aa  187  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.64 
 
 
353 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1223  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  39.87 
 
 
314 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.0162302 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  35 
 
 
586 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  32.22 
 
 
586 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  35.9 
 
 
581 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  37.07 
 
 
588 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  33.88 
 
 
586 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  35.61 
 
 
590 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4621  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  35.98 
 
 
305 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  37.36 
 
 
411 aa  153  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1874  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.67 
 
 
284 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  37.96 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  34.38 
 
 
411 aa  146  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.98 
 
 
403 aa  146  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1914  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  36.23 
 
 
293 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  35.32 
 
 
409 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  32.97 
 
 
1148 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  41.13 
 
 
393 aa  140  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06023  oxidoreductase, FAD-binding, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07600)  28.03 
 
 
640 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0324685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  38.96 
 
 
403 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  30.36 
 
 
400 aa  138  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  34.95 
 
 
414 aa  137  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  32.64 
 
 
414 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.94 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  31.13 
 
 
1155 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  36.79 
 
 
393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  29.86 
 
 
402 aa  133  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.85 
 
 
702 aa  133  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.19 
 
 
402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0969  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 
423 aa  131  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.137694  normal  0.0138657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.56 
 
 
403 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  30.7 
 
 
605 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  32.27 
 
 
625 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  33.47 
 
 
397 aa  131  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  33.47 
 
 
397 aa  130  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  32.87 
 
 
1138 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  30.21 
 
 
402 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  29.51 
 
 
402 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  30.21 
 
 
402 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0756  flavohemoprotein  31.23 
 
 
248 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000736085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  30.21 
 
 
402 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  30.59 
 
 
402 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  32.64 
 
 
414 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252799 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  29.82 
 
 
402 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  35.02 
 
 
402 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  31.27 
 
 
400 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>