More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0756 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0756  flavohemoprotein  100 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000736085  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0780  oxidoreductase, FAD-binding  99.19 
 
 		 248 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00269433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  42.06 
 
 		 402 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  41.27 
 
 		 402 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  41.67 
 
 		 402 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  40.87 
 
 		 402 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  40.87 
 
 		 402 aa  198  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  40.48 
 
 		 402 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  40.08 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  40.08 
 
 		 402 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  40.08 
 
 		 402 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  40.08 
 
 		 402 aa  195  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  40.48 
 
 		 402 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  35.83 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  35.74 
 
 		 411 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  31.58 
 
 		 403 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.41 
 
 		 403 aa  171  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  37.55 
 
 		 581 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.39 
 
 		 408 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  33.6 
 
 		 402 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  35.95 
 
 		 394 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0969  nitric oxide dioxygenase  34.52 
 
 		 423 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.137694  normal  0.0138657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0909  nitric oxide dioxygenase  34.13 
 
 		 413 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357631  normal  0.205289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  34.54 
 
 		 414 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.252799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  34.13 
 
 		 414 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.8 
 
 		 393 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  36.59 
 
 		 392 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  34.57 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  34.57 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2596  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 		 414 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  36.18 
 
 		 392 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  32.94 
 
 		 403 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  34.55 
 
 		 394 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  36.18 
 
 		 392 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  37.04 
 
 		 393 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4652  nitric oxide dioxygenase  38.02 
 
 		 393 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.08 
 
 		 394 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  34.15 
 
 		 393 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  34.57 
 
 		 393 aa  158  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  33.74 
 
 		 393 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  34.16 
 
 		 397 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  38.46 
 
 		 393 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  36.18 
 
 		 397 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  35.37 
 
 		 397 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  33.2 
 
 		 403 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  31.17 
 
 		 396 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4378  nitric oxide dioxygenase  36.36 
 
 		 392 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  35.37 
 
 		 397 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  30.77 
 
 		 396 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 		 394 aa  154  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  32 
 
 		 396 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1895  nitric oxide dioxygenase  35.1 
 
 		 419 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00231107  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  36.55 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.33 
 
 		 700 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  32.94 
 
 		 411 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  35.37 
 
 		 397 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  32.52 
 
 		 409 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.79 
 
 		 353 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1079  nitric oxide dioxygenase  34.27 
 
 		 408 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  35.46 
 
 		 676 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  31.92 
 
 		 410 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  33.2 
 
 		 586 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  32.38 
 
 		 397 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.43 
 
 		 403 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.38 
 
 		 402 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  33.2 
 
 		 393 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.51 
 
 		 412 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  35.34 
 
 		 674 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  31.97 
 
 		 397 aa  148  8e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  33.6 
 
 		 402 aa  148  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  32.39 
 
 		 395 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3408  nitric oxide dioxygenase  33.88 
 
 		 393 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  31.3 
 
 		 393 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  32.81 
 
 		 402 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  34.4 
 
 		 396 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.6 
 
 		 687 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  32.81 
 
 		 402 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  34.57 
 
 		 393 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.94 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  30.16 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  32.94 
 
 		 402 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  34.3 
 
 		 393 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1514  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.23 
 
 		 402 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.156255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.32 
 
 		 406 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  33.46 
 
 		 402 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  32.69 
 
 		 586 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  33.46 
 
 		 402 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  33.88 
 
 		 596 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  32 
 
 		 393 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.41 
 
 		 402 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.98 
 
 		 681 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  33.46 
 
 		 399 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  33.74 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  32.11 
 
 		 396 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.27 
 
 		 390 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  32.11 
 
 		 396 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  32.11 
 
 		 396 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  30.92 
 
 		 395 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  33.07 
 
 		 402 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  33.07 
 
 		 402 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>