271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1108 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1108  ferredoxin  100 
 
 
83 aa  173  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.78 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2623  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.78 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.123357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2506  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.78 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2519  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.78 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2803  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.28 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697891  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2464  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.78 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.119261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02162  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  44.78 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1423  ferredoxin  44.78 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2533  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.78 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2376  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.78 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02121  hypothetical protein  44.78 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.78 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.100794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3370  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.78 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2616  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.78 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0873  putative iron-sulfur cluster-binding protein  43.28 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0202831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02735  hypothetical protein  43.94 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0117  2Fe-2S-binding domain-containing protein  43.94 
 
 
74 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.781122  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003107  ferredoxin  43.94 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000688265  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2387  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.78 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  46.27 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1772  putative ferredoxin  41.27 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0325703  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4191  ferredoxin  45.83 
 
 
74 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.661673  normal  0.663207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  49.25 
 
 
86 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.42 
 
 
85 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.42 
 
 
85 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1315  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.42 
 
 
85 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  41.79 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  46.27 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.78 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0962  ferredoxin, 2Fe-2S type  48.39 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000314737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.94 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  43.28 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.28 
 
 
86 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2409  ferredoxin  44.44 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000581579  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2475  ferredoxin  40.24 
 
 
90 aa  62  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  44.44 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0384  iron-sulfur cluster binding protein  44.44 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  41.67 
 
 
711 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2075  ferredoxin  40.3 
 
 
151 aa  60.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000572229  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.95 
 
 
336 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2057  ferredoxin  42.86 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2053  ferredoxin  42.86 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262921  unclonable  0.00000000000106292 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3052  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.9 
 
 
329 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.9 
 
 
329 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.158036  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2896  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.9 
 
 
329 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00679398  normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  39.39 
 
 
676 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.13 
 
 
678 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  47.17 
 
 
678 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  47.17 
 
 
678 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2998  ferredoxin  40.98 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.28 
 
 
681 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  40.32 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1914  ferredoxin  39.68 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318435  hitchhiker  0.0000000631262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2064  ferredoxin  39.68 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103253  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  39.68 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  45.28 
 
 
675 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  36 
 
 
590 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  36.51 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2135  ferredoxin  38.1 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2062  ferredoxin  41.27 
 
 
136 aa  53.5  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.51 
 
 
676 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.51 
 
 
690 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  34.67 
 
 
368 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  34.67 
 
 
368 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1726  iron-sulfur cluster-binding protein  35.94 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.347237  hitchhiker  0.00725733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  34.67 
 
 
368 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.35 
 
 
445 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.77 
 
 
341 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.38 
 
 
687 aa  52  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  37.66 
 
 
581 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.46 
 
 
346 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.27 
 
 
370 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3505  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
291 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  38.27 
 
 
369 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.27 
 
 
370 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  37.31 
 
 
367 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  37.88 
 
 
586 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  37.31 
 
 
367 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.12 
 
 
354 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  40 
 
 
674 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  37.66 
 
 
367 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2301  ferredoxin  36.51 
 
 
125 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12598  normal  0.0821826 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  33.33 
 
 
662 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.71 
 
 
380 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40 
 
 
700 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  38.36 
 
 
616 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.88 
 
 
752 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.11 
 
 
374 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  32.93 
 
 
605 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.35 
 
 
691 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.23 
 
 
687 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  29.73 
 
 
1070 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.82 
 
 
353 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.95 
 
 
357 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  38.81 
 
 
369 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  38.81 
 
 
369 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  38.81 
 
 
369 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  38.81 
 
 
369 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.38 
 
 
686 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>