277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2998 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2998  ferredoxin  100 
 
 
98 aa  202  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02162  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  50.7 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1423  ferredoxin  50.7 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2623  2Fe-2S ferredoxin YfaE  50.7 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.123357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2616  2Fe-2S ferredoxin YfaE  50.7 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2506  2Fe-2S ferredoxin YfaE  50.7 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3370  2Fe-2S ferredoxin YfaE  50.7 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2464  2Fe-2S ferredoxin YfaE  50.7 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02121  hypothetical protein  50.7 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  50.7 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2519  2Fe-2S ferredoxin YfaE  50.7 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460389 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2533  2Fe-2S ferredoxin YfaE  50.7 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2376  2Fe-2S ferredoxin YfaE  50.7 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  50.7 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.100794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2803  2Fe-2S ferredoxin YfaE  48 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697891  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2387  2Fe-2S ferredoxin YfaE  51.43 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0962  ferredoxin, 2Fe-2S type  47.3 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000314737  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1315  2Fe-2S ferredoxin YfaE  52.38 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  52.38 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  52.38 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1116  ferredoxin  43.59 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.0940812 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1269  ferrodoxin  43.59 
 
 
86 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000193504  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  49.21 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0117  2Fe-2S-binding domain-containing protein  41.18 
 
 
74 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.781122  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  36.9 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  47.54 
 
 
86 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.25 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.66 
 
 
86 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.33 
 
 
86 aa  62.8  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.67 
 
 
86 aa  62.8  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1579  ferredoxin  42.31 
 
 
85 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0150219 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0384  iron-sulfur cluster binding protein  41.18 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  37.31 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4191  ferredoxin  42.86 
 
 
74 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.661673  normal  0.663207 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1108  ferredoxin  40.98 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  41.79 
 
 
390 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  47.37 
 
 
675 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  44.26 
 
 
711 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  33.68 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2057  ferredoxin  33.68 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2053  ferredoxin  33.68 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262921  unclonable  0.00000000000106292 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  36.84 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1726  iron-sulfur cluster-binding protein  37.08 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.347237  hitchhiker  0.00725733 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2075  ferredoxin  36.84 
 
 
151 aa  53.9  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000572229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  45.16 
 
 
367 aa  53.9  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2409  ferredoxin  31.63 
 
 
163 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000581579  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  46.88 
 
 
366 aa  53.9  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2301  ferredoxin  33.33 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12598  normal  0.0821826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.89 
 
 
341 aa  52.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2062  ferredoxin  35.96 
 
 
136 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1914  ferredoxin  35.53 
 
 
136 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318435  hitchhiker  0.0000000631262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2064  ferredoxin  35.53 
 
 
136 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103253  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  35.53 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1944  ferredoxin  32.05 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.241389  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  30 
 
 
605 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  40.32 
 
 
369 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  40.32 
 
 
369 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  40.32 
 
 
369 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  40.32 
 
 
369 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.68 
 
 
688 aa  50.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  40.32 
 
 
369 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  40.32 
 
 
369 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  40.32 
 
 
369 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  34.12 
 
 
367 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.11 
 
 
331 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003107  ferredoxin  33.33 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000688265  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  33.66 
 
 
616 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  42.65 
 
 
585 aa  50.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  29.79 
 
 
369 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  38.71 
 
 
369 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  30.95 
 
 
678 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  32.1 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  29.79 
 
 
369 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.29 
 
 
687 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0873  putative iron-sulfur cluster-binding protein  37.7 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0202831  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  29.79 
 
 
369 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  36.07 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  39.34 
 
 
369 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.95 
 
 
678 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.36 
 
 
346 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.11 
 
 
343 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  46.15 
 
 
368 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  34.52 
 
 
367 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  40.98 
 
 
371 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2308  ferredoxin  34.43 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  hitchhiker  0.0000241513 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02735  hypothetical protein  32.05 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  46.15 
 
 
368 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.89 
 
 
681 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.59 
 
 
678 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.55 
 
 
380 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  46.15 
 
 
368 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09631  ferredoxin, petF-like protein  35.14 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  39.34 
 
 
369 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09611  ferredoxin, petF-like protein  33.8 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.511459  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  34.25 
 
 
605 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  28.72 
 
 
369 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2475  ferredoxin  45 
 
 
90 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.57 
 
 
380 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  32.5 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1772  putative ferredoxin  33.78 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0325703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>