241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02735 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02735  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  191  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003107  ferredoxin  93.41 
 
 		 93 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000688265  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0873  putative iron-sulfur cluster-binding protein  73.91 
 
 		 92 aa  147  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0202831  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1772  putative ferredoxin  46.07 
 
 		 91 aa  98.2  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0325703  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1108  ferredoxin  43.94 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02162  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  38.46 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1423  ferredoxin  38.46 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02121  hypothetical protein  38.46 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2616  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.46 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3370  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.46 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2376  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.46 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.46 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.100794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2533  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.46 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  45.95 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2464  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.46 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2519  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.46 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460389 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  39.51 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.46 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2623  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.46 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.123357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2506  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.46 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2387  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.94 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0962  ferredoxin, 2Fe-2S type  42.62 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000314737  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  41.98 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2803  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.18 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697891  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.75 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1315  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.75 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.75 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  35.44 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.79 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  40.3 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0117  2Fe-2S-binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.781122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.79 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  44.07 
 
 		 711 aa  57.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.86 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2062  ferredoxin  34.48 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.55 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  41.27 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  38.36 
 
 		 373 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2301  ferredoxin  33.33 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12598  normal  0.0821826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.59 
 
 		 687 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  40 
 
 		 367 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2475  ferredoxin  36.23 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.59 
 
 		 678 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  40 
 
 		 367 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  48.53 
 
 		 374 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0384  iron-sulfur cluster binding protein  35.38 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.44 
 
 		 687 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  34.67 
 
 		 366 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2793  putative reductase component of monooxygenase  35.8 
 
 		 365 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  38.57 
 
 		 371 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1507  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.8 
 
 		 365 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  41.79 
 
 		 367 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.55 
 
 		 370 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.55 
 
 		 370 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  38.55 
 
 		 369 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2135  ferredoxin  32.63 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1691  oxidoreductase FAD-binding region  37.5 
 
 		 327 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2896  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.79 
 
 		 329 aa  50.8  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00679398  normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  43.66 
 
 		 365 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.79 
 
 		 329 aa  50.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.158036  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1726  iron-sulfur cluster-binding protein  34.12 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.347237  hitchhiker  0.00725733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3052  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.79 
 
 		 329 aa  50.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  40.74 
 
 		 678 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.74 
 
 		 678 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  37.31 
 
 		 549 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4191  ferredoxin  36.11 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.661673  normal  0.663207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.03 
 
 		 341 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  38.1 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  52.78 
 
 		 674 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.06 
 
 		 376 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.06 
 
 		 380 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.59 
 
 		 686 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2308  ferredoxin  37.1 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  hitchhiker  0.0000241513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  37.04 
 
 		 350 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  44.23 
 
 		 675 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  50 
 
 		 681 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2998  ferredoxin  32.05 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1914  ferredoxin  34.15 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318435  hitchhiker  0.0000000631262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2064  ferredoxin  34.15 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103253  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  37.31 
 
 		 367 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  32.93 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  39.66 
 
 		 586 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1051  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.78 
 
 		 337 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.328018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  41.79 
 
 		 325 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0545  ferredoxin  32.35 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2409  ferredoxin  37.1 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000581579  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.66 
 
 		 585 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.59 
 
 		 380 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  29.27 
 
 		 356 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40 
 
 		 700 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.42 
 
 		 361 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1944  ferredoxin  33.33 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.241389  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  37.68 
 
 		 691 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  37.33 
 
 		 120 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.62 
 
 		 376 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  35.21 
 
 		 368 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  37.1 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  45.24 
 
 		 353 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2057  ferredoxin  37.1 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  31.08 
 
 		 351 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>