More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3668 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  100 
 
 		 368 aa  743    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  56.58 
 
 		 376 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  56.58 
 
 		 376 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  58.01 
 
 		 379 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  56.86 
 
 		 376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  53.59 
 
 		 371 aa  388  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  55.07 
 
 		 385 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  54.97 
 
 		 380 aa  391  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  53.33 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  52.08 
 
 		 381 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  52.38 
 
 		 360 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  52.26 
 
 		 357 aa  324  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  53.41 
 
 		 760 aa  318  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  44.96 
 
 		 366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  50.68 
 
 		 372 aa  309  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  51.99 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  44.72 
 
 		 360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  44.72 
 
 		 360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  50.7 
 
 		 366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  49.04 
 
 		 363 aa  282  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.08 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.24 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.68 
 
 		 367 aa  275  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.5 
 
 		 374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  44.17 
 
 		 375 aa  265  5.999999999999999e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  44.17 
 
 		 350 aa  249  7e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.16 
 
 		 376 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  43.92 
 
 		 247 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.6 
 
 		 368 aa  176  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.38 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.46 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.16 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  34.16 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.16 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.26 
 
 		 380 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.57 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  34.88 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  33.85 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.88 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.57 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.44 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.44 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.57 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.57 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.83 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  34.16 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4815  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.26 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  36 
 
 		 366 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0360  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.95 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  34.48 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.79 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03879  oxidoreductase  34.84 
 
 		 358 aa  149  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938155  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.87 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  34.75 
 
 		 355 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  29.82 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.15 
 
 		 369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.43 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  33.61 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.61 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  28.21 
 
 		 355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  30.37 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  30 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  32.75 
 
 		 362 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.83 
 
 		 375 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.96 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  31.05 
 
 		 353 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  30.03 
 
 		 366 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.76 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.43 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  29.11 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  27.69 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  27.69 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.11 
 
 		 390 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.65 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.96 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  28.2 
 
 		 355 aa  132  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  31.96 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.66 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  28.26 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.22 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  28.57 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.79 
 
 		 363 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.22 
 
 		 366 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.95 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  27.7 
 
 		 365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  32.99 
 
 		 662 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.5 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.89 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  28.77 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.93 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.3 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  28.14 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.3 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.72 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  29.79 
 
 		 605 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  29.2 
 
 		 356 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.31 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02772  putative Oxidoreductase  26.24 
 
 		 327 aa  124  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684144  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  28.48 
 
 		 605 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>