250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1423 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02162  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  100 
 
 		 84 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1423  ferredoxin  100 
 
 		 84 aa  174  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2533  2Fe-2S ferredoxin YfaE  100 
 
 		 84 aa  174  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2616  2Fe-2S ferredoxin YfaE  100 
 
 		 84 aa  174  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2376  2Fe-2S ferredoxin YfaE  100 
 
 		 84 aa  174  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02121  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3370  2Fe-2S ferredoxin YfaE  98.81 
 
 		 84 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  98.81 
 
 		 84 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.100794 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2387  2Fe-2S ferredoxin YfaE  97.62 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2506  2Fe-2S ferredoxin YfaE  96.43 
 
 		 84 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  96.43 
 
 		 84 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2623  2Fe-2S ferredoxin YfaE  96.43 
 
 		 84 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.123357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2464  2Fe-2S ferredoxin YfaE  96.43 
 
 		 84 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2519  2Fe-2S ferredoxin YfaE  96.43 
 
 		 84 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2803  2Fe-2S ferredoxin YfaE  79.76 
 
 		 84 aa  144  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697891  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  61.9 
 
 		 86 aa  107  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  62.96 
 
 		 86 aa  107  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  61.45 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  61.45 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1315  2Fe-2S ferredoxin YfaE  61.45 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 		 86 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0384  iron-sulfur cluster binding protein  54.79 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2475  ferredoxin  53.85 
 
 		 90 aa  84.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0962  ferredoxin, 2Fe-2S type  54.41 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000314737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  51.56 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2135  ferredoxin  44.44 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  46.99 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1914  ferredoxin  44.44 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318435  hitchhiker  0.0000000631262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2064  ferredoxin  44.44 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103253  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  44.44 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2075  ferredoxin  43.06 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000572229  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0117  2Fe-2S-binding domain-containing protein  46.38 
 
 		 74 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.781122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2301  ferredoxin  43.06 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12598  normal  0.0821826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  43.06 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1108  ferredoxin  44.78 
 
 		 83 aa  73.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2409  ferredoxin  41.67 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000581579  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  50.79 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  41.67 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2998  ferredoxin  50.7 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2053  ferredoxin  41.67 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262921  unclonable  0.00000000000106292 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2308  ferredoxin  43.06 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  hitchhiker  0.0000241513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2062  ferredoxin  41.67 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2057  ferredoxin  41.67 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1772  putative ferredoxin  42.5 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0325703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  40.28 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1944  ferredoxin  43.06 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.241389  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02735  hypothetical protein  38.46 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0873  putative iron-sulfur cluster-binding protein  38.46 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0202831  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003107  ferredoxin  38.27 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000688265  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1116  ferredoxin  41.46 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.0940812 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1726  iron-sulfur cluster-binding protein  41.67 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.347237  hitchhiker  0.00725733 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1269  ferrodoxin  41.46 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000193504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4191  ferredoxin  40.58 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.661673  normal  0.663207 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1579  ferredoxin  41.56 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3052  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  42.42 
 
 		 329 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  42.42 
 
 		 329 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.158036  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2896  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  42.42 
 
 		 329 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00679398  normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  42.62 
 
 		 320 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.8 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.5 
 
 		 700 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2372  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  41.54 
 
 		 335 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2272  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  46.03 
 
 		 335 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3505  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  45.28 
 
 		 711 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  36.59 
 
 		 588 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.47 
 
 		 445 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 		 596 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.39 
 
 		 687 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35 
 
 		 390 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.11 
 
 		 713 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  34.57 
 
 		 586 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  43.33 
 
 		 678 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.23 
 
 		 682 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.57 
 
 		 412 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  45 
 
 		 681 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  42.59 
 
 		 678 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  33.33 
 
 		 586 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1706  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  45.16 
 
 		 347 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  44.83 
 
 		 351 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.14 
 
 		 692 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.14 
 
 		 692 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.55 
 
 		 370 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.55 
 
 		 370 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  43.55 
 
 		 369 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.32 
 
 		 684 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  43.55 
 
 		 341 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.33 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  38.98 
 
 		 676 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.33 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0545  ferredoxin  36.76 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  38.46 
 
 		 334 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.33 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.72 
 
 		 343 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.98 
 
 		 684 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.33 
 
 		 343 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  36.59 
 
 		 369 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.74 
 
 		 678 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.05 
 
 		 343 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>