More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3505 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3505  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  42.5 
 
 
590 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.84 
 
 
687 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.76 
 
 
412 aa  69.3  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.8 
 
 
445 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  41.25 
 
 
596 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  40 
 
 
586 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  43.84 
 
 
675 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  42.17 
 
 
390 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  41.25 
 
 
586 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  39.02 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1772  putative ferredoxin  47.62 
 
 
91 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0325703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.92 
 
 
678 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  39.76 
 
 
676 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.47 
 
 
682 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  38.75 
 
 
581 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40 
 
 
353 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.1 
 
 
686 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2053  ferredoxin  38.03 
 
 
140 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262921  unclonable  0.00000000000106292 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  40 
 
 
86 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.82 
 
 
86 aa  63.5  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2057  ferredoxin  38.03 
 
 
140 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  32.32 
 
 
711 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.92 
 
 
678 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  35.92 
 
 
678 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  34 
 
 
363 aa  62.8  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.1 
 
 
676 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2075  ferredoxin  36.62 
 
 
151 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000572229  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  39.51 
 
 
588 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  40.96 
 
 
713 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  39.73 
 
 
691 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.53 
 
 
681 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  36.62 
 
 
140 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0408  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  41.1 
 
 
820 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2409  ferredoxin  36.62 
 
 
163 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000581579  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.73 
 
 
687 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2803  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.27 
 
 
84 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697891  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.1 
 
 
700 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2135  ferredoxin  37.68 
 
 
133 aa  60.1  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  37.8 
 
 
549 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.58 
 
 
363 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.29 
 
 
383 aa  59.3  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  36.62 
 
 
136 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1914  ferredoxin  36.62 
 
 
136 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318435  hitchhiker  0.0000000631262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2064  ferredoxin  36.62 
 
 
136 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103253  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  36.62 
 
 
144 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  37.04 
 
 
1138 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36 
 
 
690 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.88 
 
 
467 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.29 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.67 
 
 
691 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  35.29 
 
 
86 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  36.47 
 
 
418 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.89 
 
 
692 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.89 
 
 
692 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.44 
 
 
689 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  35.29 
 
 
86 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  34.78 
 
 
137 aa  56.6  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.73 
 
 
684 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3949  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.82 
 
 
361 aa  56.2  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.75 
 
 
86 aa  56.2  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.44 
 
 
684 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2623  2Fe-2S ferredoxin YfaE  34.57 
 
 
84 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.123357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2519  2Fe-2S ferredoxin YfaE  34.57 
 
 
84 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2464  2Fe-2S ferredoxin YfaE  34.57 
 
 
84 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  34.57 
 
 
84 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2506  2Fe-2S ferredoxin YfaE  34.57 
 
 
84 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3690  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.21 
 
 
468 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.68 
 
 
414 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02162  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  34.57 
 
 
84 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1423  ferredoxin  34.57 
 
 
84 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  34.88 
 
 
382 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2376  2Fe-2S ferredoxin YfaE  34.57 
 
 
84 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2616  2Fe-2S ferredoxin YfaE  34.57 
 
 
84 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2062  ferredoxin  36.76 
 
 
136 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  26.77 
 
 
674 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.65 
 
 
381 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1315  2Fe-2S ferredoxin YfaE  33.75 
 
 
85 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02121  hypothetical protein  34.57 
 
 
84 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  41.07 
 
 
90 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3370  2Fe-2S ferredoxin YfaE  34.57 
 
 
84 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  34.57 
 
 
84 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.100794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  33.75 
 
 
85 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2533  2Fe-2S ferredoxin YfaE  34.57 
 
 
84 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  33.75 
 
 
85 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2301  ferredoxin  33.8 
 
 
125 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12598  normal  0.0821826 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3824  GCN5-related N-acetyltransferase  44.78 
 
 
140 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114693  normal  0.354709 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3569  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.58 
 
 
362 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3937  GCN5-related N-acetyltransferase  44.78 
 
 
140 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  36.47 
 
 
364 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.47 
 
 
375 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  36.36 
 
 
139 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.65 
 
 
375 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  36.14 
 
 
382 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.14 
 
 
382 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2387  2Fe-2S ferredoxin YfaE  34.57 
 
 
84 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.47 
 
 
375 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.14 
 
 
382 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0384  iron-sulfur cluster binding protein  48.08 
 
 
88 aa  54.3  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.56 
 
 
350 aa  53.9  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>