184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3937 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3937  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 140 aa  271  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3824  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 140 aa  271  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114693  normal  0.354709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1818  GCN5-related N-acetyltransferase  51.85 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.148545 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5348  GCN5-related N-acetyltransferase  53.28 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692382 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6566  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  43.31 
 
 		 184 aa  90.1  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575757 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.41 
 
 		 299 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6298  GCN5-related N-acetyltransferase  41.35 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.708322  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6009  cytoplasmic peptidoglycan synthetase domain protein  41.13 
 
 		 631 aa  87  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  44.19 
 
 		 299 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5712  GCN5-related N-acetyltransferase  39.85 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  39.85 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1412  GCN5-related N-acetyltransferase  36.5 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  41.73 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.593412  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2877  GCN5-related N-acetyltransferase  40.65 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.70045  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6012  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  37.69 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  42.5 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2311  GCN5-related N-acetyltransferase  40.54 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02981  hypothetical protein  33.58 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.553777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0111  GCN5-related N-acetyltransferase  40.22 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0209  GCN5-related N-acetyltransferase  38.02 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4573  N-acetylglutamate synthase  34.33 
 
 		 448 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0244  GCN5-related N-acetyltransferase  32.81 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0253  acetyltransferase  34.96 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2444  acetyltransferase  36.56 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1546  acetyltransferase  34.06 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  37.29 
 
 		 276 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0587  acetyltransferase  34.74 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2284  acetyltransferase  32.03 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.786273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2325  acetyltransferase  36.05 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000933187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0166  acetyltransferase  35.66 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.903096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1857  acetyltransferase  34.56 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2113  acetyltransferase  35.34 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2205  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2553  N-acetylglutamate synthase  31.34 
 
 		 448 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0145729  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1522  N-acetylglutamate synthase  31.88 
 
 		 438 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0861  acetyltransferase  36.3 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00507665  normal  0.131026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0363  N-acetylglutamate synthase  31.06 
 
 		 444 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00936818  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0871  N-acetylglutamate synthase  34.04 
 
 		 448 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0474  acetyltransferase  33.83 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0416407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2722  N-acetylglutamate synthase  31.25 
 
 		 448 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2077  acetyltransferase  33.06 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2358  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 		 180 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2062  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1203  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 		 172 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.181413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1373  N-acetylglutamate synthase  31.34 
 
 		 446 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3584  N-acetylglutamate synthase  34.68 
 
 		 439 aa  50.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.591835 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1075  acetyltransferase  29.75 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.353935  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1870  acetyltransferase  33.33 
 
 		 165 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.20692 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2177  N-acetylglutamate synthase  31.25 
 
 		 450 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0154  N-acetylglutamate synthase  35.05 
 
 		 442 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2066  N-acetylglutamate synthase  33.83 
 
 		 459 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5465  N-acetylglutamate synthase  33.83 
 
 		 459 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1512  N-acetylglutamate synthase  34.59 
 
 		 462 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.374367 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5921  N-acetylglutamate synthase  33.83 
 
 		 459 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2193  N-acetylglutamate synthase  33.83 
 
 		 459 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533662  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2156  N-acetylglutamate synthase  33.83 
 
 		 459 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.67226  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2623  N-acetylglutamate synthase  34.59 
 
 		 462 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2174  N-acetylglutamate synthase  33.83 
 
 		 459 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0134  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490566  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1530  N-acetylglutamate synthase  31.91 
 
 		 448 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2228  N-acetylglutamate synthase  30.85 
 
 		 446 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4451  acetyltransferase  32.56 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346737  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2327  N-acetylglutamate synthase  31.91 
 
 		 448 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1489  N-acetylglutamate synthase  34.59 
 
 		 459 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00249644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2123  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1837  N-acetylglutamate synthase  33.83 
 
 		 458 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0884  acetyltransferase  33.72 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0173017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2397  N-acetylglutamate synthase  30.85 
 
 		 449 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_399  acetyltransferase, GNAT family  31.03 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00235227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0457  acetyltransferase  29.89 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1115  N-acetylglutamate synthase  34.11 
 
 		 459 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383123  normal  0.718299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0995  acetyltransferase  32.56 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  26.88 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0921  acetyltransferase  32.56 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0740  acetyltransferase  32.56 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000824265  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1751  N-acetylglutamate synthase  33.08 
 
 		 458 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2777  N-acetylglutamate synthase  33.08 
 
 		 458 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2260  N-acetylglutamate synthase  33.08 
 
 		 458 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3059  N-acetylglutamate synthase  33.08 
 
 		 458 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265876  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2643  N-acetylglutamate synthase  33.08 
 
 		 458 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2699  N-acetylglutamate synthase  33.08 
 
 		 458 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1532  N-acetylglutamate synthase  33.08 
 
 		 458 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.392031  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0434  acetyltransferase  31.03 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000409483  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2701  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.905415 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0727  acetyltransferase  31.4 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000686887  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2066  N-acetylglutamate synthase  34.41 
 
 		 477 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216561  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2178  Amino-acid N-acetyltransferase  34.07 
 
 		 352 aa  45.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3155  N-acetylglutamate synthase  27.74 
 
 		 443 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3138  N-acetylglutamate synthase  27.74 
 
 		 443 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3991  GCN5-related N-acetyltransferase  23.71 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3812  N-acetylglutamate synthase  33.72 
 
 		 441 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119295  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3505  GCN5-related N-acetyltransferase  44.12 
 
 		 291 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>