194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1818 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1818  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 148 aa  296  9e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.148545 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5348  GCN5-related N-acetyltransferase  83.56 
 
 		 147 aa  220  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692382 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3937  GCN5-related N-acetyltransferase  51.85 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3824  GCN5-related N-acetyltransferase  51.85 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114693  normal  0.354709 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  47.59 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.593412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.77 
 
 		 299 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  46.48 
 
 		 299 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  46.1 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  42.14 
 
 		 184 aa  107  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575757 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1412  GCN5-related N-acetyltransferase  41.3 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6566  GCN5-related N-acetyltransferase  41.96 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6298  GCN5-related N-acetyltransferase  41.26 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.708322  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5712  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.70045  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0209  GCN5-related N-acetyltransferase  36.09 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0111  GCN5-related N-acetyltransferase  43.31 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2311  GCN5-related N-acetyltransferase  44.66 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  40.77 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  36.92 
 
 		 276 aa  77  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6009  cytoplasmic peptidoglycan synthetase domain protein  34.92 
 
 		 631 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2877  GCN5-related N-acetyltransferase  38.52 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02981  hypothetical protein  34.31 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.553777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  36.92 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.20692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0244  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6012  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1405  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2553  N-acetylglutamate synthase  29.69 
 
 		 448 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0145729  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3584  N-acetylglutamate synthase  30.77 
 
 		 439 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.591835 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0572  N-acetylglutamate synthase  34.09 
 
 		 447 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1828  predicted protein  42.5 
 
 		 506 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1774  acetyltransferase  33.33 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000016365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2646  acetyltransferase  32.69 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000217972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1522  N-acetylglutamate synthase  38.89 
 
 		 438 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0474  acetyltransferase  30.67 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0416407 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2252  XRE family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 476 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000906633  unclonable  0.000000183294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2325  acetyltransferase  30.77 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000933187  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2443  acetyltransferase  36.47 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.034532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4573  N-acetylglutamate synthase  27.74 
 
 		 448 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2946  acetyltransferase  34.65 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0115  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019226  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1512  N-acetylglutamate synthase  31.5 
 
 		 462 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.374367 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2623  N-acetylglutamate synthase  31.5 
 
 		 462 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1901  N-acetylglutamate synthase  28.57 
 
 		 456 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  32.06 
 
 		 435 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0154  N-acetylglutamate synthase  30.6 
 
 		 442 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5465  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 		 459 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1837  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 		 458 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148151  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0363  N-acetylglutamate synthase  35.59 
 
 		 444 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00936818  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2066  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 		 459 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0872  N-acetylglutamate synthase  27.91 
 
 		 444 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2174  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 		 459 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5921  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 		 459 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2193  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 		 459 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533662  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2156  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 		 459 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.67226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1708  acetyltransferase  31.82 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2444  acetyltransferase  30.43 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2177  N-acetylglutamate synthase  31.46 
 
 		 450 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0740  acetyltransferase  30.08 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000824265  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1489  N-acetylglutamate synthase  30.71 
 
 		 459 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00249644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0921  acetyltransferase  29.27 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788056  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0324  N-acetylglutamate synthase  30.65 
 
 		 448 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0791  acetyltransferase  30.08 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000699744  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1751  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 		 458 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0254  N-acetylglutamate synthase  30.65 
 
 		 432 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2777  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 		 458 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0831  acetyltransferase  30.08 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000546377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2722  N-acetylglutamate synthase  28.74 
 
 		 448 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2260  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 		 458 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3059  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 		 458 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265876  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2643  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 		 458 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2699  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 		 458 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1532  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 		 458 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.392031  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2250  N-acetylglutamate synthase  32.18 
 
 		 440 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0334  N-acetylglutamate synthase  31.34 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1344  amino-acid N-acetyltransferase  29.93 
 
 		 440 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.18548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0995  acetyltransferase  29.27 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0946  acetyltransferase  31.76 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0355  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2284  acetyltransferase  29.77 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.786273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2061  acetyltransferase  31.87 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450214  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13050  N-acetylglutamate synthase  30.71 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2295  amino-acid N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 456 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0223326 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1103  N-acetylglutamate synthase  30.83 
 
 		 440 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.540979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0253  acetyltransferase  29.58 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.445128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2327  N-acetylglutamate synthase  30.23 
 
 		 448 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1530  N-acetylglutamate synthase  30.23 
 
 		 448 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03295  N-acetylglutamate synthase  25.6 
 
 		 448 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3812  N-acetylglutamate synthase  30 
 
 		 441 aa  48.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119295  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2013  N-acetylglutamate synthase  29.13 
 
 		 460 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1115  N-acetylglutamate synthase  29.66 
 
 		 459 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383123  normal  0.718299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0170  N-acetylglutamate synthase  28.06 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0871  N-acetylglutamate synthase  29.07 
 
 		 448 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04920  N-acetylglutamate synthase  37.38 
 
 		 432 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>