112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0196 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0244  GCN5-related N-acetyltransferase  69.18 
 
 		 147 aa  213  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02981  hypothetical protein  43.84 
 
 		 149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.553777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6122  GCN5-related N-acetyltransferase  43.15 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5968  GCN5-related N-acetyltransferase  48.18 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4620  GCN5-related N-acetyltransferase  46.61 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1818  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 		 148 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.148545 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6298  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.708322  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5712  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.593412  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6566  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6012  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.70045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575757 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  32.39 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  33.8 
 
 		 299 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2877  GCN5-related N-acetyltransferase  36.8 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  31.39 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5348  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692382 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3824  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114693  normal  0.354709 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3937  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0217  N-acetylglutamate synthase  34.59 
 
 		 196 aa  67.4  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145354 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1412  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.20692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6009  cytoplasmic peptidoglycan synthetase domain protein  30.94 
 
 		 631 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  33.61 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2311  GCN5-related N-acetyltransferase  33.6 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25180  N-acetylglutamate synthase  35.25 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1708  acetyltransferase  32.28 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0209  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  29.06 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0946  acetyltransferase  32.28 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  28.68 
 
 		 624 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  30.69 
 
 		 624 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0949  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.509006  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  28.23 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2946  acetyltransferase  32.81 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3092  acetyltransferase  32.61 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0220833  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3584  N-acetylglutamate synthase  29.63 
 
 		 439 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.591835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2443  acetyltransferase  30.71 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.034532  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0596  N-acetylglutamate synthase  30.71 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0558798  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2061  acetyltransferase  30.71 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1774  acetyltransferase  30.71 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000016365 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2471  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 		 193 aa  50.4  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4794  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3419  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 		 189 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2325  acetyltransferase  30.21 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000933187  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4156  N-acetylglutamate synthase  28.72 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2646  acetyltransferase  30.71 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000217972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0560  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0166  acetyltransferase  26.32 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.903096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0170  N-acetylglutamate synthase  31.01 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0253  acetyltransferase  29.1 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2196  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4479  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2284  acetyltransferase  29.13 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.786273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  28.28 
 
 		 626 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4989  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8374  N-acetylglutamate synthase  31.54 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2444  acetyltransferase  31.19 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1870  acetyltransferase  27.21 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  27.13 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2122  N-acetylglutamate synthase  34.04 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2168  N-acetylglutamate synthase  34.04 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121288  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2109  N-acetylglutamate synthase  34.04 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0656379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  27.72 
 
 		 624 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0941  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 		 196 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.92096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9151  N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferase-like protein  35.16 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0051  N-acetylglutamate synthase  27.56 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0668  GCN5-related N-acetyltransferase  28.42 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0388  N-acetylglutamate synthase  26.39 
 
 		 439 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0404545  hitchhiker  0.000000193555 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0111  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1405  GCN5-related N-acetyltransferase  29.84 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2295  amino-acid N-acetyltransferase  27.86 
 
 		 456 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0223326 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1994  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 		 200 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0334  N-acetylglutamate synthase  29.6 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3287  N-acetylglutamate synthase  31.96 
 
 		 184 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0592405  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2486  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0134  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1522  N-acetylglutamate synthase  29.71 
 
 		 438 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1675  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2077  acetyltransferase  24.63 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2252  XRE family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 476 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000906633  unclonable  0.000000183294 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2405  N-acetylglutamate synthase  28.18 
 
 		 440 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0711  acetyltransferase  23.19 
 
 		 167 aa  42.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3825  N-acetylglutamate synthase  24.66 
 
 		 439 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1546  acetyltransferase  31.01 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3990  N-acetylglutamate synthase  32.98 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266966  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5801  N-acetylglutamate synthase  28.24 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.505653  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1344  amino-acid N-acetyltransferase  29.93 
 
 		 440 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.18548  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12760  N-acetylglutamate synthase  31.43 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.246029  normal  0.121736 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3189  N-acetylglutamate synthase  27.97 
 
 		 441 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0533084  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0771  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3834  N-acetylglutamate synthase  25.5 
 
 		 440 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14894  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2649  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 		 169 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4558  N-acetylglutamate synthase  26.71 
 
 		 439 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108665  hitchhiker  0.0000557237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2394  N-acetylglutamate synthase  29.01 
 
 		 173 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  30.7 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.11668 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>