247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2443 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2443  acetyltransferase  100 
 
 
149 aa  302  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.034532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1774  acetyltransferase  97.32 
 
 
149 aa  292  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000016365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1708  acetyltransferase  83.22 
 
 
150 aa  266  8.999999999999999e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2061  acetyltransferase  79.87 
 
 
149 aa  257  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0946  acetyltransferase  78.52 
 
 
150 aa  256  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2646  acetyltransferase  77.18 
 
 
149 aa  251  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000217972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2946  acetyltransferase  74.67 
 
 
150 aa  237  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2325  acetyltransferase  62.42 
 
 
149 aa  202  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000933187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1203  GCN5-related N-acetyltransferase  57.62 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.181413 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_399  acetyltransferase, GNAT family  54.67 
 
 
160 aa  180  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00235227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0457  acetyltransferase  54.36 
 
 
158 aa  179  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0949  GCN5-related N-acetyltransferase  56.38 
 
 
149 aa  179  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.509006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0434  acetyltransferase  53.69 
 
 
158 aa  175  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000409483  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0115  GCN5-related N-acetyltransferase  52.7 
 
 
151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019226  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0587  acetyltransferase  47.26 
 
 
159 aa  169  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3092  acetyltransferase  50 
 
 
150 aa  166  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0220833  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  51.39 
 
 
152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2898  acetyltransferase  46.98 
 
 
151 aa  163  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.230698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0134  GCN5-related N-acetyltransferase  51.68 
 
 
152 aa  163  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2370  acetyltransferase  49.66 
 
 
157 aa  160  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0051  N-acetylglutamate synthase  49.66 
 
 
150 aa  158  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1142  acetyltransferase  48.3 
 
 
151 aa  157  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0474  acetyltransferase  48.67 
 
 
155 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0416407 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1857  acetyltransferase  50.33 
 
 
155 aa  152  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2113  acetyltransferase  50.67 
 
 
153 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1546  acetyltransferase  49.33 
 
 
154 aa  150  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00318584  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1225  GCN5-related N-acetyltransferase  48.28 
 
 
162 aa  148  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0861  acetyltransferase  47.33 
 
 
159 aa  141  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00507665  normal  0.131026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  46.21 
 
 
173 aa  138  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.11668 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0926  acetyltransferase  44.83 
 
 
151 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.3472299999999997e-49 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0995  acetyltransferase  44.83 
 
 
151 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0727  acetyltransferase  44.83 
 
 
151 aa  130  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000686887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0921  acetyltransferase  44.14 
 
 
151 aa  129  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0791  acetyltransferase  44.83 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000699744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0831  acetyltransferase  44.83 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000546377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0740  acetyltransferase  44.14 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000824265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4451  acetyltransferase  43.45 
 
 
151 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346737  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2358  GCN5-related N-acetyltransferase  42.67 
 
 
180 aa  126  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0884  acetyltransferase  42.76 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0173017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0741  acetyltransferase  42.76 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.296931  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0668  GCN5-related N-acetyltransferase  40.97 
 
 
152 aa  125  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1675  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
182 aa  123  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2701  GCN5-related N-acetyltransferase  40.67 
 
 
181 aa  122  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.905415 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2061  acetyltransferase  42.48 
 
 
176 aa  120  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.145777 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1075  acetyltransferase  40.27 
 
 
153 aa  120  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.353935  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0217  N-acetylglutamate synthase  41.67 
 
 
196 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145354 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2308  acetyltransferase  38.51 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000335687  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0307  acetyltransferase  39.46 
 
 
152 aa  115  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18063  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3419  GCN5-related N-acetyltransferase  40.6 
 
 
189 aa  114  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1184  acetyltransferase  38.51 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2284  acetyltransferase  38.93 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.786273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25180  N-acetylglutamate synthase  44.53 
 
 
189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2077  acetyltransferase  35.14 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2879  N-acetylglutamate synthase  37.75 
 
 
191 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00976241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4479  GCN5-related N-acetyltransferase  37.16 
 
 
186 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4156  N-acetylglutamate synthase  36.81 
 
 
174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0452  acetyltransferase  38.26 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5801  N-acetylglutamate synthase  38.93 
 
 
166 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.505653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0893  N-acetylglutamate synthase  38.81 
 
 
170 aa  104  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.038377  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01560  N-acetylglutamate synthase  37.75 
 
 
171 aa  104  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0836  N-acetylglutamate synthase  37.04 
 
 
170 aa  103  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2196  GCN5-related N-acetyltransferase  40.94 
 
 
172 aa  103  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  35.14 
 
 
624 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0170  N-acetylglutamate synthase  37.04 
 
 
169 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9151  N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferase-like protein  37.12 
 
 
195 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2444  acetyltransferase  40.77 
 
 
155 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06840  N-acetylglutamate synthase  34.87 
 
 
176 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  34.46 
 
 
624 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0334  N-acetylglutamate synthase  37.78 
 
 
169 aa  100  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1774  GCN5-related N-acetyltransferase  36.43 
 
 
168 aa  100  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0253  acetyltransferase  35.81 
 
 
155 aa  99.4  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3990  N-acetylglutamate synthase  39.06 
 
 
161 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266966  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13050  N-acetylglutamate synthase  37.58 
 
 
169 aa  99.8  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0392  GCN5-related N-acetyltransferase  34.42 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0166  acetyltransferase  35.81 
 
 
165 aa  98.2  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.903096 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  36.49 
 
 
626 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2122  N-acetylglutamate synthase  39.37 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2168  N-acetylglutamate synthase  39.37 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121288  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2109  N-acetylglutamate synthase  39.37 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0656379 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0489  N-acetylglutamate synthase  33.77 
 
 
174 aa  97.1  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114688  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2394  N-acetylglutamate synthase  37.5 
 
 
173 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0108428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0596  N-acetylglutamate synthase  34.33 
 
 
188 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0558798  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1870  acetyltransferase  33.99 
 
 
165 aa  95.5  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  33.11 
 
 
624 aa  95.5  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3360  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
171 aa  94.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12760  N-acetylglutamate synthase  39.83 
 
 
174 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.246029  normal  0.121736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4054  GCN5-related N-acetyltransferase  35.57 
 
 
171 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.236772  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4989  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
212 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4141  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0464  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  33.33 
 
 
645 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2806  N-acetylglutamate synthase  38.52 
 
 
173 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000042501  hitchhiker  0.0000370361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3287  N-acetylglutamate synthase  33.33 
 
 
184 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0592405  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8374  N-acetylglutamate synthase  34 
 
 
172 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0562  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501587 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0382  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.327168  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2089  N-acetylglutamate synthase  34.68 
 
 
440 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2405  N-acetylglutamate synthase  33.87 
 
 
440 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2250  N-acetylglutamate synthase  32.26 
 
 
440 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190116  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2252  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 
476 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000906633  unclonable  0.000000183294 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2070  N-acetylglutamate synthase  31.2 
 
 
478 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>