54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6012 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6012  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
161 aa  314  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6566  GCN5-related N-acetyltransferase  46.27 
 
 
142 aa  95.5  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5712  GCN5-related N-acetyltransferase  44.03 
 
 
142 aa  94  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6298  GCN5-related N-acetyltransferase  44.03 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.708322  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3937  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3824  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114693  normal  0.354709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  37.3 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2877  GCN5-related N-acetyltransferase  37.4 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0244  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  34.11 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1818  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.148545 
 
 
-
 
NC_003296  RS02981  hypothetical protein  29.73 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.553777  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.593412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  33.59 
 
 
299 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
149 aa  61.2  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.70045  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5348  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.692382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6009  cytoplasmic peptidoglycan synthetase domain protein  31.85 
 
 
631 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2311  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1412  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.320001  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2806  N-acetylglutamate synthase  25.95 
 
 
173 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000042501  hitchhiker  0.0000370361 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000139718 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0111  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
140 aa  51.2  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2061  acetyltransferase  25.2 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1774  acetyltransferase  24.39 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000016365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2646  acetyltransferase  26.83 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000217972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2443  acetyltransferase  24.39 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.034532  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 
184 aa  48.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0575757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1708  acetyltransferase  23.58 
 
 
150 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
147 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.20692 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1857  acetyltransferase  29.23 
 
 
155 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1839  GNAT family acetyltransferase  32.09 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003043  acetyltransferase GNAT family  27.5 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0628  GCN5-related N-acetyltransferase  32.09 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0836  N-acetylglutamate synthase  27.04 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4620  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
147 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1522  N-acetylglutamate synthase  31.25 
 
 
438 aa  44.3  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  25.26 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0488  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
161 aa  43.9  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.364845  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3419  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2946  acetyltransferase  25 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2013  N-acetylglutamate synthase  25.18 
 
 
460 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6122  GCN5-related N-acetyltransferase  25.78 
 
 
147 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0363  N-acetylglutamate synthase  29.77 
 
 
444 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00936818  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0572  N-acetylglutamate synthase  28.12 
 
 
447 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0946  acetyltransferase  21.95 
 
 
150 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0893  N-acetylglutamate synthase  26.42 
 
 
170 aa  41.2  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.038377  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  29.31 
 
 
276 aa  40.8  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2370  acetyltransferase  22.95 
 
 
157 aa  40.8  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4479  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
186 aa  40.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>