229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0893 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0893  N-acetylglutamate synthase  100 
 
 		 170 aa  337  4e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.038377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0836  N-acetylglutamate synthase  90 
 
 		 170 aa  306  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4479  GCN5-related N-acetyltransferase  70.73 
 
 		 186 aa  225  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0217  N-acetylglutamate synthase  67.46 
 
 		 196 aa  224  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3419  GCN5-related N-acetyltransferase  70.91 
 
 		 189 aa  223  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2879  N-acetylglutamate synthase  66.47 
 
 		 191 aa  220  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00976241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9151  N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferase-like protein  72.73 
 
 		 195 aa  219  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4989  GCN5-related N-acetyltransferase  59.6 
 
 		 212 aa  213  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5801  N-acetylglutamate synthase  67.68 
 
 		 166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.505653  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1774  GCN5-related N-acetyltransferase  65.29 
 
 		 168 aa  208  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25180  N-acetylglutamate synthase  67.48 
 
 		 189 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12760  N-acetylglutamate synthase  64.85 
 
 		 174 aa  200  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.246029  normal  0.121736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2394  N-acetylglutamate synthase  61.31 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2196  GCN5-related N-acetyltransferase  64.63 
 
 		 172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06840  N-acetylglutamate synthase  59.66 
 
 		 176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3990  N-acetylglutamate synthase  63.8 
 
 		 161 aa  193  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266966  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0596  N-acetylglutamate synthase  61.08 
 
 		 188 aa  191  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0558798  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2122  N-acetylglutamate synthase  61.73 
 
 		 160 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2168  N-acetylglutamate synthase  61.73 
 
 		 160 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121288  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2109  N-acetylglutamate synthase  61.73 
 
 		 160 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0656379 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0392  GCN5-related N-acetyltransferase  59.17 
 
 		 171 aa  188  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0562  GCN5-related N-acetyltransferase  64.81 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0170  N-acetylglutamate synthase  58.13 
 
 		 169 aa  184  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8374  N-acetylglutamate synthase  60.24 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0334  N-acetylglutamate synthase  56.88 
 
 		 169 aa  180  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0489  N-acetylglutamate synthase  55.76 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01560  N-acetylglutamate synthase  54.39 
 
 		 171 aa  171  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13050  N-acetylglutamate synthase  57.86 
 
 		 169 aa  170  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3287  N-acetylglutamate synthase  53.18 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0592405  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2806  N-acetylglutamate synthase  55.62 
 
 		 173 aa  163  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000042501  hitchhiker  0.0000370361 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1675  GCN5-related N-acetyltransferase  39.72 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0946  acetyltransferase  39.47 
 
 		 150 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2946  acetyltransferase  40.44 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1774  acetyltransferase  40 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000016365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2370  acetyltransferase  37.5 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2443  acetyltransferase  38.81 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.034532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2061  acetyltransferase  38.67 
 
 		 149 aa  104  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1225  GCN5-related N-acetyltransferase  40.15 
 
 		 162 aa  104  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1708  acetyltransferase  36.42 
 
 		 150 aa  104  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0134  GCN5-related N-acetyltransferase  39.69 
 
 		 152 aa  101  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.11668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0587  acetyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1203  GCN5-related N-acetyltransferase  38.16 
 
 		 172 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.181413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2646  acetyltransferase  39.69 
 
 		 149 aa  97.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000217972  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2898  acetyltransferase  37.88 
 
 		 151 aa  97.4  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.230698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2325  acetyltransferase  35.56 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000933187  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1142  acetyltransferase  41.35 
 
 		 151 aa  96.7  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0949  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 149 aa  93.6  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.509006  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0051  N-acetylglutamate synthase  37.21 
 
 		 150 aa  93.6  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0115  GCN5-related N-acetyltransferase  34.33 
 
 		 151 aa  92.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3092  acetyltransferase  35.82 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0220833  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_399  acetyltransferase, GNAT family  28.15 
 
 		 160 aa  91.7  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00235227  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  33.08 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0457  acetyltransferase  27.61 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0434  acetyltransferase  28.36 
 
 		 158 aa  87.8  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000409483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1857  acetyltransferase  34.56 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2701  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.905415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2358  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 		 180 aa  84  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0740  acetyltransferase  36.72 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000824265  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0861  acetyltransferase  35.92 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00507665  normal  0.131026 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0727  acetyltransferase  35.94 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000686887  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0995  acetyltransferase  35.94 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0926  acetyltransferase  35.94 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.3472299999999997e-49 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0791  acetyltransferase  35.94 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000699744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0831  acetyltransferase  35.94 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000546377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0921  acetyltransferase  35.16 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788056  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2113  acetyltransferase  33.82 
 
 		 153 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0741  acetyltransferase  35.71 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.296931  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1546  acetyltransferase  31.85 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4451  acetyltransferase  35.94 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346737  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0884  acetyltransferase  34.92 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0173017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0474  acetyltransferase  30.71 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0416407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4156  N-acetylglutamate synthase  32.26 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0464  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  33.87 
 
 		 645 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0668  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2061  acetyltransferase  28.99 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.145777 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2308  acetyltransferase  34.31 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000335687  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0307  acetyltransferase  28.69 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18063  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2284  acetyltransferase  32.56 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.786273  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2077  acetyltransferase  33.85 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0253  acetyltransferase  33.85 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  33.59 
 
 		 626 aa  65.5  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1184  acetyltransferase  25.4 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  28.87 
 
 		 624 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1870  acetyltransferase  32.43 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  29.93 
 
 		 624 aa  64.3  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0166  acetyltransferase  31.62 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.903096 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1075  acetyltransferase  26.98 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.353935  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2405  N-acetylglutamate synthase  32.8 
 
 		 440 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2089  N-acetylglutamate synthase  30.94 
 
 		 440 aa  61.6  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3360  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  30 
 
 		 624 aa  60.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4054  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.236772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1901  N-acetylglutamate synthase  30.94 
 
 		 456 aa  58.2  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2250  N-acetylglutamate synthase  29.6 
 
 		 440 aa  57.4  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0452  acetyltransferase  26.98 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  35.16 
 
 		 435 aa  54.3  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0685  N-acetylglutamate synthase  31.39 
 
 		 449 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.98957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4141  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0598  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 		 453 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00244264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>