128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5348 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5348  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 147 aa  294  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1818  GCN5-related N-acetyltransferase  83.56 
 
 		 148 aa  239  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.148545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3937  GCN5-related N-acetyltransferase  52.59 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3824  GCN5-related N-acetyltransferase  52.59 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114693  normal  0.354709 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  46.81 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1412  GCN5-related N-acetyltransferase  42.03 
 
 		 147 aa  106  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.320001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.26 
 
 		 299 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  46.48 
 
 		 299 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  45.14 
 
 		 151 aa  103  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.593412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  40.58 
 
 		 184 aa  97.4  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575757 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 		 149 aa  95.9  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.70045  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6298  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.708322  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5712  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6566  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0111  GCN5-related N-acetyltransferase  40.44 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2877  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0209  GCN5-related N-acetyltransferase  34.13 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  38.69 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  34.85 
 
 		 276 aa  74.7  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2311  GCN5-related N-acetyltransferase  40.19 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  36.15 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  36.15 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.20692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6009  cytoplasmic peptidoglycan synthetase domain protein  35.2 
 
 		 631 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02981  hypothetical protein  31.21 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.553777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0244  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1405  GCN5-related N-acetyltransferase  37.32 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6012  GCN5-related N-acetyltransferase  36.51 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2325  acetyltransferase  29.37 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000933187  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1142  acetyltransferase  29.2 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3584  N-acetylglutamate synthase  30.33 
 
 		 439 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.591835 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0949  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.509006  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1870  acetyltransferase  27.81 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2284  acetyltransferase  31.65 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.786273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 		 173 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.11668 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0861  acetyltransferase  31.72 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00507665  normal  0.131026 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0253  acetyltransferase  30.46 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0474  acetyltransferase  29.33 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0416407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0572  N-acetylglutamate synthase  35.56 
 
 		 447 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0363  N-acetylglutamate synthase  35.59 
 
 		 444 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00936818  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2444  acetyltransferase  29.84 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0596  N-acetylglutamate synthase  33.62 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0558798  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0334  N-acetylglutamate synthase  35.04 
 
 		 169 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25180  N-acetylglutamate synthase  33.64 
 
 		 189 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  31.9 
 
 		 435 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2946  acetyltransferase  32.38 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0166  acetyltransferase  30.07 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.903096 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2370  acetyltransferase  28.07 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1546  acetyltransferase  29.25 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1857  acetyltransferase  31 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13050  N-acetylglutamate synthase  30.71 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0170  N-acetylglutamate synthase  32.48 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2394  N-acetylglutamate synthase  29.53 
 
 		 173 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108428 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1828  predicted protein  40 
 
 		 506 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1522  N-acetylglutamate synthase  37.04 
 
 		 438 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1774  acetyltransferase  32.95 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000016365 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.445128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1203  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.181413 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0489  N-acetylglutamate synthase  30.65 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114688  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0921  acetyltransferase  30.3 
 
 		 151 aa  43.9  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0791  acetyltransferase  28.85 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000699744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0831  acetyltransferase  28.85 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000546377  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0115  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0740  acetyltransferase  28.85 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000824265  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2358  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2443  acetyltransferase  32.95 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.034532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0995  acetyltransferase  30.3 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0457  acetyltransferase  27.55 
 
 		 158 aa  43.5  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0587  acetyltransferase  28.44 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2646  acetyltransferase  29.81 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000217972  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0434  acetyltransferase  28.57 
 
 		 158 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000409483  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0727  acetyltransferase  29.29 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000686887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2701  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.905415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3990  N-acetylglutamate synthase  27.52 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266966  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0355  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  27.03 
 
 		 624 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  27.97 
 
 		 624 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0003  GCN5-related N-acetyltransferase  30.7 
 
 		 320 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1512  N-acetylglutamate synthase  32.2 
 
 		 462 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.374367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2070  N-acetylglutamate synthase  31.25 
 
 		 478 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1708  acetyltransferase  29.67 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0307  acetyltransferase  26.95 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.18063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2623  N-acetylglutamate synthase  32.2 
 
 		 462 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00527  N-acetylglutamate synthase  31.4 
 
 		 436 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0926  acetyltransferase  29.29 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.3472299999999997e-49 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04920  N-acetylglutamate synthase  34.83 
 
 		 432 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  27.03 
 
 		 624 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3612  GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 		 160 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.601769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2066  N-acetylglutamate synthase  32.5 
 
 		 477 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5419  N-acetylglutamate synthase  34.83 
 
 		 432 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8374  N-acetylglutamate synthase  33.33 
 
 		 172 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2553  N-acetylglutamate synthase  26.26 
 
 		 448 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0145729  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0598  N-acetylglutamate synthase  28.46 
 
 		 453 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00244264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2260  N-acetylglutamate synthase  30.51 
 
 		 458 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2643  N-acetylglutamate synthase  30.51 
 
 		 458 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2699  N-acetylglutamate synthase  30.51 
 
 		 458 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>