More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2070 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2066  N-acetylglutamate synthase  70.33 
 
 
459 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1250  N-acetylglutamate synthase  77.95 
 
 
451 aa  733    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676607  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2699  N-acetylglutamate synthase  73.78 
 
 
458 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1751  N-acetylglutamate synthase  73.78 
 
 
458 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1532  N-acetylglutamate synthase  73.78 
 
 
458 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.392031  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2260  N-acetylglutamate synthase  73.78 
 
 
458 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437606  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2066  N-acetylglutamate synthase  85.06 
 
 
477 aa  837    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2643  N-acetylglutamate synthase  73.78 
 
 
458 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1078  N-acetylglutamate synthase  73.01 
 
 
465 aa  715    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2777  N-acetylglutamate synthase  73.78 
 
 
458 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5465  N-acetylglutamate synthase  72.85 
 
 
459 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2174  N-acetylglutamate synthase  70.11 
 
 
459 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1837  N-acetylglutamate synthase  73.78 
 
 
458 aa  641    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3059  N-acetylglutamate synthase  73.78 
 
 
458 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265876  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1115  N-acetylglutamate synthase  71.21 
 
 
459 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383123  normal  0.718299 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2070  N-acetylglutamate synthase  100 
 
 
478 aa  975    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5921  N-acetylglutamate synthase  70.11 
 
 
459 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1170  N-acetylglutamate synthase  74.57 
 
 
465 aa  719    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2193  N-acetylglutamate synthase  70.11 
 
 
459 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533662  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2156  N-acetylglutamate synthase  70.11 
 
 
459 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.67226  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1489  N-acetylglutamate synthase  71.93 
 
 
459 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00249644  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2623  N-acetylglutamate synthase  71.43 
 
 
462 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1512  N-acetylglutamate synthase  71.72 
 
 
462 aa  631  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.374367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2105  N-acetylglutamate synthase  60.91 
 
 
451 aa  556  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1373  N-acetylglutamate synthase  60.36 
 
 
446 aa  554  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2722  N-acetylglutamate synthase  59.77 
 
 
448 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2553  N-acetylglutamate synthase  60.23 
 
 
448 aa  548  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0145729  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2177  N-acetylglutamate synthase  59.55 
 
 
450 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1262  N-acetylglutamate synthase  63.45 
 
 
454 aa  546  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0481247  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2397  N-acetylglutamate synthase  59.32 
 
 
449 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.989062  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0871  N-acetylglutamate synthase  60.32 
 
 
448 aa  545  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2228  N-acetylglutamate synthase  59.23 
 
 
446 aa  541  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4573  N-acetylglutamate synthase  59.09 
 
 
448 aa  541  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447777  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0688  N-acetylglutamate synthase  61.37 
 
 
454 aa  541  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.127329  normal  0.447208 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1530  N-acetylglutamate synthase  58.41 
 
 
448 aa  535  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2327  N-acetylglutamate synthase  58.64 
 
 
448 aa  537  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0154  N-acetylglutamate synthase  52.95 
 
 
442 aa  458  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2252  XRE family transcriptional regulator  50.68 
 
 
476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000906633  unclonable  0.000000183294 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0572  N-acetylglutamate synthase  50.93 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3584  N-acetylglutamate synthase  51.15 
 
 
439 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.591835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1522  N-acetylglutamate synthase  52.55 
 
 
438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2013  N-acetylglutamate synthase  51.97 
 
 
460 aa  443  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0380  N-acetylglutamate synthase  50.68 
 
 
442 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2084  N-acetylglutamate synthase  51.03 
 
 
448 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.212235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0977  N-acetylglutamate synthase  46.39 
 
 
436 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04920  N-acetylglutamate synthase  47.36 
 
 
432 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0278  N-acetylglutamate synthase  47.56 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2046  N-acetylglutamate synthase  47.83 
 
 
444 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.398173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0363  N-acetylglutamate synthase  49.2 
 
 
444 aa  405  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00936818  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5185  N-acetylglutamate synthase  47.1 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610315  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0465  N-acetylglutamate synthase  43.65 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.135467  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5092  N-acetylglutamate synthase  47.1 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5419  N-acetylglutamate synthase  46.08 
 
 
432 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1103  N-acetylglutamate synthase  46.87 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.540979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5245  N-acetylglutamate synthase  47.1 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.987249  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02666  N-acetylglutamate synthase  44.85 
 
 
443 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.939553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0873  amino-acid N-acetyltransferase  44.85 
 
 
443 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0897  N-acetylglutamate synthase  44.85 
 
 
443 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.763096  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3812  N-acetylglutamate synthase  45.06 
 
 
441 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119295  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0354  N-acetylglutamate synthase  45.29 
 
 
432 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1045  N-acetylglutamate synthase  45.31 
 
 
441 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2965  N-acetylglutamate synthase  45.08 
 
 
443 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.80689 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3138  N-acetylglutamate synthase  44.85 
 
 
443 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02627  hypothetical protein  44.85 
 
 
443 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3044  N-acetylglutamate synthase  44.85 
 
 
443 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0993  N-acetylglutamate synthase  45.31 
 
 
441 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3229  N-acetylglutamate synthase  45.31 
 
 
441 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.781275 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2964  N-acetylglutamate synthase  44.85 
 
 
443 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00527  N-acetylglutamate synthase  44.63 
 
 
436 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0324  N-acetylglutamate synthase  44.7 
 
 
448 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0254  N-acetylglutamate synthase  44.7 
 
 
432 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4083  N-acetylglutamate synthase  44.62 
 
 
443 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5949  N-acetylglutamate synthase  45.96 
 
 
432 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3261  N-acetylglutamate synthase  44.37 
 
 
443 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68740  N-acetylglutamate synthase  45.96 
 
 
432 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3318  N-acetylglutamate synthase  43.94 
 
 
443 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3218  N-acetylglutamate synthase  43.94 
 
 
443 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3005  N-acetylglutamate synthase  44.83 
 
 
441 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3138  N-acetylglutamate synthase  43.94 
 
 
443 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3385  N-acetylglutamate synthase  44.37 
 
 
441 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3155  N-acetylglutamate synthase  43.94 
 
 
443 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3204  N-acetylglutamate synthase  43.94 
 
 
443 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0919  N-acetylglutamate synthase  44.37 
 
 
441 aa  388  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3189  N-acetylglutamate synthase  44.37 
 
 
441 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0533084  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2295  amino-acid N-acetyltransferase  45.83 
 
 
456 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0223326 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0872  N-acetylglutamate synthase  42.92 
 
 
444 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  44.55 
 
 
435 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4245  N-acetylglutamate synthase  43.98 
 
 
445 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2089  N-acetylglutamate synthase  44.55 
 
 
440 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0465  N-acetylglutamate synthase  43.75 
 
 
439 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000881657  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3767  N-acetylglutamate synthase  43.62 
 
 
445 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.078519  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2405  N-acetylglutamate synthase  44.55 
 
 
440 aa  377  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3594  N-acetylglutamate synthase  43.39 
 
 
445 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40133  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0362  N-acetylglutamate synthase  43.39 
 
 
445 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3834  N-acetylglutamate synthase  43.55 
 
 
440 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0380  N-acetylglutamate synthase  42.92 
 
 
439 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000181036  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3478  N-acetylglutamate synthase  44.08 
 
 
440 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03295  N-acetylglutamate synthase  42.99 
 
 
448 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0685  N-acetylglutamate synthase  43.61 
 
 
449 aa  375  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.98957  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4558  N-acetylglutamate synthase  43.88 
 
 
439 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108665  hitchhiker  0.0000557237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>