More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_1828 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_1828  predicted protein  100 
 
 
506 aa  1045    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0572  N-acetylglutamate synthase  40.91 
 
 
447 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0465  N-acetylglutamate synthase  31.02 
 
 
436 aa  157  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.135467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1103  N-acetylglutamate synthase  38.91 
 
 
440 aa  157  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.540979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2722  N-acetylglutamate synthase  34.5 
 
 
448 aa  157  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0354  N-acetylglutamate synthase  33.83 
 
 
432 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2066  N-acetylglutamate synthase  40.27 
 
 
477 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0254  N-acetylglutamate synthase  33.14 
 
 
432 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2070  N-acetylglutamate synthase  33.33 
 
 
478 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0324  N-acetylglutamate synthase  32.46 
 
 
448 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1170  N-acetylglutamate synthase  41.18 
 
 
465 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1078  N-acetylglutamate synthase  41.18 
 
 
465 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1373  N-acetylglutamate synthase  33.04 
 
 
446 aa  150  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1250  N-acetylglutamate synthase  39.64 
 
 
451 aa  150  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676607  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5419  N-acetylglutamate synthase  33.14 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2252  XRE family transcriptional regulator  41.26 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000906633  unclonable  0.000000183294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2397  N-acetylglutamate synthase  31.75 
 
 
449 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.989062  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0154  N-acetylglutamate synthase  38.43 
 
 
442 aa  146  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04920  N-acetylglutamate synthase  32.22 
 
 
432 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651162  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2105  N-acetylglutamate synthase  32.35 
 
 
451 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350775  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4573  N-acetylglutamate synthase  32.35 
 
 
448 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447777  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2084  N-acetylglutamate synthase  36.65 
 
 
448 aa  144  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.212235  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5949  N-acetylglutamate synthase  31.91 
 
 
432 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2177  N-acetylglutamate synthase  35.43 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68740  N-acetylglutamate synthase  31.91 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5185  N-acetylglutamate synthase  31.91 
 
 
432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610315  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5092  N-acetylglutamate synthase  31.91 
 
 
432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2228  N-acetylglutamate synthase  32.27 
 
 
446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2327  N-acetylglutamate synthase  31.47 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0278  N-acetylglutamate synthase  31.44 
 
 
432 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5245  N-acetylglutamate synthase  31.91 
 
 
432 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.987249  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2013  N-acetylglutamate synthase  32.74 
 
 
460 aa  140  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0977  N-acetylglutamate synthase  30.42 
 
 
436 aa  140  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0813  N-acetylglutamate synthase  44.38 
 
 
435 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0664  N-acetylglutamate synthase  44.38 
 
 
435 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1530  N-acetylglutamate synthase  31.18 
 
 
448 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0363  N-acetylglutamate synthase  39.82 
 
 
444 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00936818  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2295  amino-acid N-acetyltransferase  36.24 
 
 
456 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0223326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00527  N-acetylglutamate synthase  36.36 
 
 
436 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2250  N-acetylglutamate synthase  34.58 
 
 
440 aa  138  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190116  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2405  N-acetylglutamate synthase  30.63 
 
 
440 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0871  N-acetylglutamate synthase  36.65 
 
 
448 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2553  N-acetylglutamate synthase  30.52 
 
 
448 aa  136  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0145729  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2046  N-acetylglutamate synthase  36.89 
 
 
444 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.398173  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2089  N-acetylglutamate synthase  31.31 
 
 
440 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03295  N-acetylglutamate synthase  30.32 
 
 
448 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002688  N-acetylglutamate synthase  29.62 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0713  N-acetylglutamate synthase  35.37 
 
 
437 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0872  N-acetylglutamate synthase  42.42 
 
 
444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0598  N-acetylglutamate synthase  31.11 
 
 
453 aa  131  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00244264  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1901  N-acetylglutamate synthase  31.07 
 
 
456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1489  N-acetylglutamate synthase  37.56 
 
 
459 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00249644  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1512  N-acetylglutamate synthase  34.25 
 
 
462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.374367 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1344  amino-acid N-acetyltransferase  36.94 
 
 
440 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.18548  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0685  N-acetylglutamate synthase  31.49 
 
 
449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.98957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3834  N-acetylglutamate synthase  29.88 
 
 
440 aa  128  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14894  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5921  N-acetylglutamate synthase  38.01 
 
 
459 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2156  N-acetylglutamate synthase  38.01 
 
 
459 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.67226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2174  N-acetylglutamate synthase  38.01 
 
 
459 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4245  N-acetylglutamate synthase  33.64 
 
 
445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0360  N-acetylglutamate synthase  33.03 
 
 
439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5465  N-acetylglutamate synthase  37.56 
 
 
459 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1115  N-acetylglutamate synthase  37.56 
 
 
459 aa  127  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383123  normal  0.718299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2193  N-acetylglutamate synthase  37.56 
 
 
459 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2066  N-acetylglutamate synthase  37.56 
 
 
459 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3229  N-acetylglutamate synthase  42.77 
 
 
441 aa  126  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.781275 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0329  N-acetylglutamate synthase  34.03 
 
 
439 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.758778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1522  N-acetylglutamate synthase  35.81 
 
 
438 aa  126  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0993  N-acetylglutamate synthase  42.77 
 
 
441 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1045  N-acetylglutamate synthase  42.77 
 
 
441 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1751  N-acetylglutamate synthase  34.98 
 
 
458 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2699  N-acetylglutamate synthase  34.98 
 
 
458 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3005  N-acetylglutamate synthase  29.76 
 
 
441 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2777  N-acetylglutamate synthase  34.98 
 
 
458 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3059  N-acetylglutamate synthase  34.98 
 
 
458 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265876  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2643  N-acetylglutamate synthase  34.98 
 
 
458 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1837  N-acetylglutamate synthase  34.98 
 
 
458 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148151  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1532  N-acetylglutamate synthase  34.98 
 
 
458 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.392031  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2260  N-acetylglutamate synthase  34.98 
 
 
458 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4558  N-acetylglutamate synthase  29.59 
 
 
439 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108665  hitchhiker  0.0000557237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2623  N-acetylglutamate synthase  33.79 
 
 
462 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0391  N-acetylglutamate synthase  32.72 
 
 
439 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00634801  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0380  N-acetylglutamate synthase  32.72 
 
 
439 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000181036  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3594  N-acetylglutamate synthase  32.72 
 
 
445 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40133  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0379  N-acetylglutamate synthase  32.72 
 
 
439 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0107482  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0405  N-acetylglutamate synthase  32.72 
 
 
439 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104668  hitchhiker  0.00000000018898 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3767  N-acetylglutamate synthase  32.72 
 
 
445 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.078519  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2965  N-acetylglutamate synthase  29.88 
 
 
443 aa  124  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.80689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0362  N-acetylglutamate synthase  32.72 
 
 
445 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3825  N-acetylglutamate synthase  33.48 
 
 
439 aa  124  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3044  N-acetylglutamate synthase  29.59 
 
 
443 aa  124  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3385  N-acetylglutamate synthase  32.72 
 
 
441 aa  123  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  37.5 
 
 
435 aa  123  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02666  N-acetylglutamate synthase  29.59 
 
 
443 aa  123  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.939553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0873  amino-acid N-acetyltransferase  29.59 
 
 
443 aa  123  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3138  N-acetylglutamate synthase  29.59 
 
 
443 aa  123  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02627  hypothetical protein  29.59 
 
 
443 aa  123  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2964  N-acetylglutamate synthase  29.59 
 
 
443 aa  123  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0897  N-acetylglutamate synthase  29.59 
 
 
443 aa  123  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.763096  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3155  N-acetylglutamate synthase  42.68 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>