97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5597 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
142 aa  284  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5712  GCN5-related N-acetyltransferase  55.4 
 
 
142 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6298  GCN5-related N-acetyltransferase  56.12 
 
 
142 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.708322  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6566  GCN5-related N-acetyltransferase  54.68 
 
 
142 aa  147  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  39.72 
 
 
149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  39.57 
 
 
151 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.593412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  38.13 
 
 
299 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1818  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 
148 aa  90.1  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.148545 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.69 
 
 
299 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2877  GCN5-related N-acetyltransferase  38.93 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  36.76 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.70045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2311  GCN5-related N-acetyltransferase  39.83 
 
 
164 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1412  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.320001  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  38.35 
 
 
184 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0575757 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6012  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3824  GCN5-related N-acetyltransferase  37.69 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114693  normal  0.354709 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3937  GCN5-related N-acetyltransferase  37.69 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.20692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0244  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02981  hypothetical protein  28.87 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.553777  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5348  GCN5-related N-acetyltransferase  38.41 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.692382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
168 aa  63.5  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1405  GCN5-related N-acetyltransferase  37.68 
 
 
147 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5065  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  33.61 
 
 
276 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0209  GCN5-related N-acetyltransferase  35.07 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0111  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6009  cytoplasmic peptidoglycan synthetase domain protein  33.58 
 
 
631 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  28.46 
 
 
624 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  29.13 
 
 
624 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 
154 aa  53.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000139718 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0217  N-acetylglutamate synthase  33.07 
 
 
196 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4479  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
186 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  28.46 
 
 
624 aa  51.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6122  GCN5-related N-acetyltransferase  25.2 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0166  acetyltransferase  29.93 
 
 
165 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.903096 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0334  N-acetylglutamate synthase  32.61 
 
 
169 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3419  GCN5-related N-acetyltransferase  38.14 
 
 
189 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0134  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490566  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1225  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0489  N-acetylglutamate synthase  30.33 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114688  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2394  N-acetylglutamate synthase  31.25 
 
 
173 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0108428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  29.63 
 
 
435 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1675  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
182 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06840  N-acetylglutamate synthase  40.3 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2471  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
193 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1708  acetyltransferase  27.42 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0170  N-acetylglutamate synthase  34.48 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3990  N-acetylglutamate synthase  29.17 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266966  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2443  acetyltransferase  30.08 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.034532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1142  acetyltransferase  30.16 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  28.35 
 
 
626 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2444  acetyltransferase  27.35 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5801  N-acetylglutamate synthase  30.25 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.505653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2061  acetyltransferase  29.84 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2168  N-acetylglutamate synthase  29.45 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121288  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2122  N-acetylglutamate synthase  29.45 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2284  acetyltransferase  26.5 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.786273  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2109  N-acetylglutamate synthase  29.45 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0656379 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0115  GCN5-related N-acetyltransferase  23.48 
 
 
151 aa  43.5  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019226  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0253  acetyltransferase  26.5 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25180  N-acetylglutamate synthase  31.2 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1774  acetyltransferase  30.08 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000016365 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21101  GNAT family acetyltransferase  39.62 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2879  N-acetylglutamate synthase  40.28 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00976241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2646  acetyltransferase  26.61 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000217972  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0668  GCN5-related N-acetyltransferase  24.62 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.25 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1733  GNAT family acetyltransferase  32.73 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.804122  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0949  GCN5-related N-acetyltransferase  25.2 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.509006  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2046  N-acetylglutamate synthase  27.89 
 
 
444 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.398173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0723  amino-acid acetyltransferase  29.31 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2946  acetyltransferase  30.4 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0946  acetyltransferase  26.19 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2062  GCN5-related N-acetyltransferase  25.53 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0836  N-acetylglutamate synthase  33.07 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0861  acetyltransferase  28.36 
 
 
159 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00507665  normal  0.131026 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2156  N-acetylglutamate synthase  36.84 
 
 
459 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.67226  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5921  N-acetylglutamate synthase  36.84 
 
 
459 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2193  N-acetylglutamate synthase  36.84 
 
 
459 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533662  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2174  N-acetylglutamate synthase  36.84 
 
 
459 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2066  N-acetylglutamate synthase  36.84 
 
 
459 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5465  N-acetylglutamate synthase  36.84 
 
 
459 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12760  N-acetylglutamate synthase  33.06 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.246029  normal  0.121736 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1512  N-acetylglutamate synthase  36.84 
 
 
462 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.374367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1489  N-acetylglutamate synthase  36.84 
 
 
459 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00249644  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1837  N-acetylglutamate synthase  36.84 
 
 
458 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148151  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2623  N-acetylglutamate synthase  36.84 
 
 
462 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2893  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
194 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304071  normal  0.979139 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0941  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
196 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.92096 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2077  acetyltransferase  27.34 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1857  acetyltransferase  27.66 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18501  GNAT family acetyltransferase  25 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.715879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0474  acetyltransferase  27.15 
 
 
155 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0416407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>