More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1489 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1250  N-acetylglutamate synthase  68.49 
 
 
451 aa  653    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676607  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1751  N-acetylglutamate synthase  86.49 
 
 
458 aa  790    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2174  N-acetylglutamate synthase  86.27 
 
 
459 aa  787    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2260  N-acetylglutamate synthase  86.49 
 
 
458 aa  790    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437606  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2066  N-acetylglutamate synthase  68.54 
 
 
477 aa  670    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216561  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2777  N-acetylglutamate synthase  86.49 
 
 
458 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5465  N-acetylglutamate synthase  86.71 
 
 
459 aa  788    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2623  N-acetylglutamate synthase  94.16 
 
 
462 aa  833    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2643  N-acetylglutamate synthase  86.49 
 
 
458 aa  790    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593428  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1115  N-acetylglutamate synthase  86.09 
 
 
459 aa  787    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383123  normal  0.718299 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2066  N-acetylglutamate synthase  86.93 
 
 
459 aa  792    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1078  N-acetylglutamate synthase  66.96 
 
 
465 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1837  N-acetylglutamate synthase  86.93 
 
 
458 aa  792    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148151  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2699  N-acetylglutamate synthase  86.49 
 
 
458 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1532  N-acetylglutamate synthase  86.49 
 
 
458 aa  790    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.392031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1512  N-acetylglutamate synthase  93.72 
 
 
462 aa  832    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.374367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1489  N-acetylglutamate synthase  100 
 
 
459 aa  930    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00249644  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1170  N-acetylglutamate synthase  67.26 
 
 
465 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2070  N-acetylglutamate synthase  67.78 
 
 
478 aa  658    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5921  N-acetylglutamate synthase  86.27 
 
 
459 aa  787    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2193  N-acetylglutamate synthase  86.49 
 
 
459 aa  786    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533662  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2156  N-acetylglutamate synthase  86.27 
 
 
459 aa  787    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.67226  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3059  N-acetylglutamate synthase  86.49 
 
 
458 aa  790    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1373  N-acetylglutamate synthase  64.07 
 
 
446 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2397  N-acetylglutamate synthase  61.14 
 
 
449 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.989062  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2228  N-acetylglutamate synthase  62.47 
 
 
446 aa  561  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2177  N-acetylglutamate synthase  59.77 
 
 
450 aa  560  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2105  N-acetylglutamate synthase  61.59 
 
 
451 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350775  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2722  N-acetylglutamate synthase  60.23 
 
 
448 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4573  N-acetylglutamate synthase  59.77 
 
 
448 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447777  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2327  N-acetylglutamate synthase  60.23 
 
 
448 aa  549  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2553  N-acetylglutamate synthase  58.64 
 
 
448 aa  551  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0145729  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0871  N-acetylglutamate synthase  60.09 
 
 
448 aa  549  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1530  N-acetylglutamate synthase  60 
 
 
448 aa  548  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1262  N-acetylglutamate synthase  59.34 
 
 
454 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0481247  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0688  N-acetylglutamate synthase  58.33 
 
 
454 aa  524  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.127329  normal  0.447208 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2252  XRE family transcriptional regulator  51.92 
 
 
476 aa  471  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000906633  unclonable  0.000000183294 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1522  N-acetylglutamate synthase  53.81 
 
 
438 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0572  N-acetylglutamate synthase  52.56 
 
 
447 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0380  N-acetylglutamate synthase  52.95 
 
 
442 aa  462  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3584  N-acetylglutamate synthase  51.85 
 
 
439 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.591835 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0154  N-acetylglutamate synthase  52.4 
 
 
442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2013  N-acetylglutamate synthase  51.51 
 
 
460 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2084  N-acetylglutamate synthase  51.28 
 
 
448 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.212235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0977  N-acetylglutamate synthase  47.73 
 
 
436 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02666  N-acetylglutamate synthase  45.66 
 
 
443 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.939553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0873  amino-acid N-acetyltransferase  45.66 
 
 
443 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3044  N-acetylglutamate synthase  45.66 
 
 
443 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2965  N-acetylglutamate synthase  45.89 
 
 
443 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.80689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0897  N-acetylglutamate synthase  45.66 
 
 
443 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.763096  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3261  N-acetylglutamate synthase  46.33 
 
 
443 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4083  N-acetylglutamate synthase  45.43 
 
 
443 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2964  N-acetylglutamate synthase  45.66 
 
 
443 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3138  N-acetylglutamate synthase  45.66 
 
 
443 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1045  N-acetylglutamate synthase  46.56 
 
 
441 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02627  hypothetical protein  45.66 
 
 
443 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0354  N-acetylglutamate synthase  49.65 
 
 
432 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0993  N-acetylglutamate synthase  46.56 
 
 
441 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3229  N-acetylglutamate synthase  46.56 
 
 
441 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.781275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04920  N-acetylglutamate synthase  49.88 
 
 
432 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651162  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3155  N-acetylglutamate synthase  45.21 
 
 
443 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3138  N-acetylglutamate synthase  45.21 
 
 
443 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0278  N-acetylglutamate synthase  49.53 
 
 
432 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0919  N-acetylglutamate synthase  46.1 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3812  N-acetylglutamate synthase  46.33 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119295  hitchhiker  0.000651778 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3385  N-acetylglutamate synthase  45.64 
 
 
441 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3318  N-acetylglutamate synthase  45.21 
 
 
443 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5419  N-acetylglutamate synthase  49.42 
 
 
432 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3218  N-acetylglutamate synthase  45.21 
 
 
443 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3204  N-acetylglutamate synthase  45.21 
 
 
443 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0363  N-acetylglutamate synthase  50.23 
 
 
444 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00936818  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5185  N-acetylglutamate synthase  49.42 
 
 
432 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610315  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0324  N-acetylglutamate synthase  48.06 
 
 
448 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5245  N-acetylglutamate synthase  49.65 
 
 
432 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.987249  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5092  N-acetylglutamate synthase  49.42 
 
 
432 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4558  N-acetylglutamate synthase  47.48 
 
 
439 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108665  hitchhiker  0.0000557237 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0330  N-acetylglutamate synthase  46.9 
 
 
440 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000023217  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1103  N-acetylglutamate synthase  46.91 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.540979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4245  N-acetylglutamate synthase  46.64 
 
 
445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0254  N-acetylglutamate synthase  48.61 
 
 
432 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3834  N-acetylglutamate synthase  46.79 
 
 
440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0465  N-acetylglutamate synthase  45.75 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000881657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3189  N-acetylglutamate synthase  45.41 
 
 
441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0533084  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  48.15 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0465  N-acetylglutamate synthase  43.39 
 
 
436 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.135467  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0379  N-acetylglutamate synthase  45.52 
 
 
439 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0107482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0388  N-acetylglutamate synthase  46.82 
 
 
439 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0404545  hitchhiker  0.000000193555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0405  N-acetylglutamate synthase  45.52 
 
 
439 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104668  hitchhiker  0.00000000018898 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0391  N-acetylglutamate synthase  45.52 
 
 
439 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00634801  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3005  N-acetylglutamate synthase  45.18 
 
 
441 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3478  N-acetylglutamate synthase  46.79 
 
 
440 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2405  N-acetylglutamate synthase  47.8 
 
 
440 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0872  N-acetylglutamate synthase  44.92 
 
 
444 aa  405  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3594  N-acetylglutamate synthase  45.71 
 
 
445 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40133  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0362  N-acetylglutamate synthase  45.71 
 
 
445 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0380  N-acetylglutamate synthase  45.52 
 
 
439 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000181036  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3767  N-acetylglutamate synthase  45.94 
 
 
445 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.078519  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2089  N-acetylglutamate synthase  47.56 
 
 
440 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2046  N-acetylglutamate synthase  47.95 
 
 
444 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.398173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3825  N-acetylglutamate synthase  45.29 
 
 
439 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>