More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1035 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  100 
 
 
86 aa  173  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  80.23 
 
 
86 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  73.26 
 
 
86 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  72.09 
 
 
86 aa  130  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02162  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  61.9 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1423  ferredoxin  61.9 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2533  2Fe-2S ferredoxin YfaE  61.9 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2376  2Fe-2S ferredoxin YfaE  61.9 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2616  2Fe-2S ferredoxin YfaE  61.9 
 
 
84 aa  107  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02121  hypothetical protein  61.9 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  60.47 
 
 
86 aa  107  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2506  2Fe-2S ferredoxin YfaE  60.71 
 
 
84 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2464  2Fe-2S ferredoxin YfaE  60.71 
 
 
84 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  60.71 
 
 
84 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2623  2Fe-2S ferredoxin YfaE  60.71 
 
 
84 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.123357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2519  2Fe-2S ferredoxin YfaE  60.71 
 
 
84 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460389 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3370  2Fe-2S ferredoxin YfaE  60.71 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  60.71 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.100794 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2387  2Fe-2S ferredoxin YfaE  60.71 
 
 
84 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1315  2Fe-2S ferredoxin YfaE  57.83 
 
 
85 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  57.83 
 
 
85 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  57.83 
 
 
85 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2803  2Fe-2S ferredoxin YfaE  54.76 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697891  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  48.75 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1914  ferredoxin  51.39 
 
 
136 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318435  hitchhiker  0.0000000631262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2064  ferredoxin  51.39 
 
 
136 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103253  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2409  ferredoxin  50 
 
 
163 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000581579  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0384  iron-sulfur cluster binding protein  57.53 
 
 
88 aa  90.1  1e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  51.39 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2075  ferredoxin  51.39 
 
 
151 aa  88.2  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000572229  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  48.61 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2057  ferredoxin  48.61 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2053  ferredoxin  48.61 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262921  unclonable  0.00000000000106292 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2062  ferredoxin  48.61 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2301  ferredoxin  47.22 
 
 
125 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12598  normal  0.0821826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2308  ferredoxin  50 
 
 
116 aa  83.6  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  hitchhiker  0.0000241513 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1944  ferredoxin  45.83 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.241389  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2135  ferredoxin  48.61 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  44.44 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1726  iron-sulfur cluster-binding protein  48.61 
 
 
117 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.347237  hitchhiker  0.00725733 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0962  ferredoxin, 2Fe-2S type  48.84 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000314737  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  49.4 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  43.59 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2475  ferredoxin  47.76 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0117  2Fe-2S-binding domain-containing protein  45.45 
 
 
74 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.781122  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  40.28 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  39.02 
 
 
590 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  41.03 
 
 
711 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1108  ferredoxin  46.27 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3505  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 
291 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1269  ferrodoxin  41.89 
 
 
86 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000193504  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1772  putative ferredoxin  47.62 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0325703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2998  ferredoxin  41.33 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003107  ferredoxin  37.97 
 
 
93 aa  62.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000688265  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1116  ferredoxin  41.89 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.0940812 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0873  putative iron-sulfur cluster-binding protein  35 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0202831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02735  hypothetical protein  35.44 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4191  ferredoxin  39.13 
 
 
74 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.661673  normal  0.663207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  34.57 
 
 
588 aa  60.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.29 
 
 
353 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  41.18 
 
 
691 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.71 
 
 
690 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  33.33 
 
 
586 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1579  ferredoxin  39.19 
 
 
85 aa  58.2  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0150219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  37.04 
 
 
581 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.71 
 
 
687 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.9 
 
 
713 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  40 
 
 
367 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.89 
 
 
445 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.99 
 
 
689 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  32.1 
 
 
586 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.38 
 
 
675 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.73 
 
 
700 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.03 
 
 
692 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.03 
 
 
692 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  37.65 
 
 
369 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  37.65 
 
 
369 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.29 
 
 
687 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.62 
 
 
686 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  37.65 
 
 
369 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  37.65 
 
 
369 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  39.24 
 
 
367 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  38.75 
 
 
369 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.75 
 
 
370 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.75 
 
 
370 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1691  oxidoreductase FAD-binding region  35.96 
 
 
327 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 
596 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  39.29 
 
 
676 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  37.33 
 
 
369 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2319  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.71 
 
 
330 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0219052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  37.33 
 
 
369 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  37.33 
 
 
369 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  36.47 
 
 
369 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  37.33 
 
 
369 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  37.33 
 
 
369 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  37.33 
 
 
369 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2218  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.71 
 
 
324 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129859  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2326  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.71 
 
 
324 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0217103 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  37.33 
 
 
369 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  38.37 
 
 
367 aa  53.9  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>