209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2475 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2475  ferredoxin  100 
 
 		 90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1315  2Fe-2S ferredoxin YfaE  52.86 
 
 		 85 aa  87  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  52.86 
 
 		 85 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  52.86 
 
 		 85 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02162  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  53.85 
 
 		 84 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1423  ferredoxin  53.85 
 
 		 84 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02121  hypothetical protein  53.85 
 
 		 84 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2533  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.85 
 
 		 84 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2616  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.85 
 
 		 84 aa  84.3  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2376  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.85 
 
 		 84 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0384  iron-sulfur cluster binding protein  44.05 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3370  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.85 
 
 		 84 aa  84  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.85 
 
 		 84 aa  84  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.100794 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2387  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.85 
 
 		 84 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2623  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.85 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.123357 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.85 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2506  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.85 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2464  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.85 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2519  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.85 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460389 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  63.49 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  53.03 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2803  2Fe-2S ferredoxin YfaE  50.77 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697891  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  56.45 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  50 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  47.76 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  48.39 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  46.88 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  46.77 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2135  ferredoxin  44.62 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2075  ferredoxin  48.28 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000572229  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1108  ferredoxin  40.24 
 
 		 83 aa  62  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1914  ferredoxin  46.55 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318435  hitchhiker  0.0000000631262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2064  ferredoxin  46.55 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103253  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  46.55 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0117  2Fe-2S-binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.781122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0873  putative iron-sulfur cluster-binding protein  41.18 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0202831  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  44.83 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1726  iron-sulfur cluster-binding protein  43.1 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.347237  hitchhiker  0.00725733 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1579  ferredoxin  40.79 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1269  ferrodoxin  43.66 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000193504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0962  ferredoxin, 2Fe-2S type  41.1 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000314737  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  43.1 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1116  ferredoxin  43.66 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.0940812 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2409  ferredoxin  44.83 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000581579  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  43.4 
 
 		 586 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2053  ferredoxin  40.62 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262921  unclonable  0.00000000000106292 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2057  ferredoxin  40.62 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  40.62 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2308  ferredoxin  39.06 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  hitchhiker  0.0000241513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2062  ferredoxin  38.71 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1772  putative ferredoxin  46.3 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0325703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003107  ferredoxin  36.23 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000688265  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02735  hypothetical protein  36.23 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2301  ferredoxin  41.38 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12598  normal  0.0821826 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1691  oxidoreductase FAD-binding region  39.71 
 
 		 327 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1944  ferredoxin  39.06 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.241389  normal  0.0118299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  45.9 
 
 		 369 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  45.9 
 
 		 369 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3505  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 		 291 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  45.9 
 
 		 369 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  45.9 
 
 		 369 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  45.9 
 
 		 369 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  45.9 
 
 		 369 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  45.9 
 
 		 369 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  35.38 
 
 		 711 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  45.9 
 
 		 369 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.29 
 
 		 687 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  35.48 
 
 		 588 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  44.26 
 
 		 369 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.29 
 
 		 690 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  42.31 
 
 		 581 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.55 
 
 		 353 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  41.94 
 
 		 369 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  41.94 
 
 		 369 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  41.94 
 
 		 369 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  41.94 
 
 		 369 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  41.94 
 
 		 369 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 370 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  42.62 
 
 		 369 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.62 
 
 		 329 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.158036  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.51 
 
 		 445 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.71 
 
 		 681 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2896  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.62 
 
 		 329 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00679398  normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 370 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3052  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.62 
 
 		 329 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  39.13 
 
 		 367 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2998  ferredoxin  45 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4191  ferredoxin  41.07 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.661673  normal  0.663207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  41.86 
 
 		 676 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  35.14 
 
 		 590 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  41.94 
 
 		 371 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0209  ferredoxin  42.11 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0772  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.31 
 
 		 321 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.5 
 
 		 686 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.21 
 
 		 354 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  34.55 
 
 		 678 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.55 
 
 		 675 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3352  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.76 
 
 		 358 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.55 
 
 		 678 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.55 
 
 		 678 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>