218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2301 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2301  ferredoxin  100 
 
 		 125 aa  257  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12598  normal  0.0821826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2308  ferredoxin  76.24 
 
 		 116 aa  156  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  hitchhiker  0.0000241513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2062  ferredoxin  61.54 
 
 		 136 aa  150  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1944  ferredoxin  75.82 
 
 		 126 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.241389  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  59.66 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2135  ferredoxin  68.37 
 
 		 133 aa  146  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1914  ferredoxin  57.26 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318435  hitchhiker  0.0000000631262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2064  ferredoxin  57.26 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103253  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  57.26 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1726  iron-sulfur cluster-binding protein  72.22 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.347237  hitchhiker  0.00725733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2409  ferredoxin  66.67 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000581579  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2075  ferredoxin  65.62 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000572229  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2053  ferredoxin  66.67 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262921  unclonable  0.00000000000106292 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2057  ferredoxin  66.67 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  65.59 
 
 		 140 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  59.41 
 
 		 137 aa  135  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  47.22 
 
 		 86 aa  83.6  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  47.22 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2623  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.44 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.123357 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.44 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2506  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.44 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2464  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.44 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2803  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.5 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697891  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2519  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.44 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460389 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.44 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.100794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3370  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.44 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2387  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.44 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02162  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  43.06 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1423  ferredoxin  43.06 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02121  hypothetical protein  43.06 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2616  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.06 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2376  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.06 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2533  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.06 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  45.31 
 
 		 86 aa  72  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.75 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  43.06 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.65 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  42.86 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0384  iron-sulfur cluster binding protein  44.78 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1772  putative ferredoxin  40 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0325703  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1315  2Fe-2S ferredoxin YfaE  39.06 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  39.06 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  39.06 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4191  ferredoxin  42.19 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.661673  normal  0.663207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  37.5 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  42.37 
 
 		 711 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0962  ferredoxin, 2Fe-2S type  41.27 
 
 		 85 aa  57  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000314737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3505  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 		 291 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003107  ferredoxin  30.77 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000688265  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.38 
 
 		 690 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02735  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0117  2Fe-2S-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.781122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2998  ferredoxin  33.33 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.03 
 
 		 412 aa  52.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2475  ferredoxin  41.38 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  39.06 
 
 		 588 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  33.8 
 
 		 549 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  38.89 
 
 		 322 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.14 
 
 		 353 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0873  putative iron-sulfur cluster-binding protein  36.36 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0202831  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1116  ferredoxin  39.68 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.0940812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.14 
 
 		 687 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.71 
 
 		 686 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.27 
 
 		 390 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1108  ferredoxin  36.51 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1269  ferrodoxin  38.1 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000193504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  41.07 
 
 		 676 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  46.97 
 
 		 323 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  46.97 
 
 		 323 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  46.97 
 
 		 323 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  46.97 
 
 		 323 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  46.97 
 
 		 323 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.67 
 
 		 700 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  29.87 
 
 		 691 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  40.91 
 
 		 616 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4160  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33 
 
 		 962 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.312376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.91 
 
 		 687 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  41.67 
 
 		 322 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  41.67 
 
 		 322 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  41.67 
 
 		 322 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  41.67 
 
 		 322 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  38.71 
 
 		 341 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.14 
 
 		 713 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  45.45 
 
 		 322 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  41.67 
 
 		 322 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  41.67 
 
 		 322 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  41.67 
 
 		 322 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  45.45 
 
 		 322 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0545  ferredoxin  31.71 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  34.29 
 
 		 581 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3188  ferredoxin  30.3 
 
 		 588 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.09 
 
 		 346 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  36.71 
 
 		 367 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.82 
 
 		 675 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.71 
 
 		 691 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  37.35 
 
 		 371 aa  47.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.51 
 
 		 689 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.1 
 
 		 692 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.1 
 
 		 692 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 		 363 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>