More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1101 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  100 
 
 
86 aa  175  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  97.67 
 
 
86 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  73.26 
 
 
86 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  73.26 
 
 
86 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  63.95 
 
 
86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 
85 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1315  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 
85 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 
85 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02162  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  59.26 
 
 
84 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1423  ferredoxin  59.26 
 
 
84 aa  104  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2533  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 
84 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2376  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 
84 aa  104  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02121  hypothetical protein  59.26 
 
 
84 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2616  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 
84 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 
84 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.100794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3370  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 
84 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2519  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 
84 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 
84 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2506  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 
84 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2623  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 
84 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.123357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2464  2Fe-2S ferredoxin YfaE  59.26 
 
 
84 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2387  2Fe-2S ferredoxin YfaE  58.02 
 
 
84 aa  100  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2803  2Fe-2S ferredoxin YfaE  55.56 
 
 
84 aa  98.2  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697891  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0384  iron-sulfur cluster binding protein  53.42 
 
 
88 aa  89  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  50.63 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0962  ferredoxin, 2Fe-2S type  55.56 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000314737  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2409  ferredoxin  48.44 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000581579  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  48.44 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1914  ferredoxin  51.56 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318435  hitchhiker  0.0000000631262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2064  ferredoxin  51.56 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103253  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  51.56 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2075  ferredoxin  48.44 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000572229  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2308  ferredoxin  50 
 
 
116 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  hitchhiker  0.0000241513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2057  ferredoxin  48.44 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2053  ferredoxin  48.44 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262921  unclonable  0.00000000000106292 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  50 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2135  ferredoxin  46.88 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  43.75 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2062  ferredoxin  45.31 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  49.28 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  44 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2301  ferredoxin  43.75 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12598  normal  0.0821826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1944  ferredoxin  42.03 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.241389  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1726  iron-sulfur cluster-binding protein  45.31 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.347237  hitchhiker  0.00725733 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0117  2Fe-2S-binding domain-containing protein  46.03 
 
 
74 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.781122  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  43.42 
 
 
711 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1269  ferrodoxin  48.72 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000193504  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1116  ferredoxin  48.72 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.0940812 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2475  ferredoxin  48.39 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  35.29 
 
 
588 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4191  ferredoxin  42.03 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.661673  normal  0.663207 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1579  ferredoxin  45.45 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0150219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  44.12 
 
 
691 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.12 
 
 
690 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2998  ferredoxin  43.66 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  34.12 
 
 
586 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.76 
 
 
353 aa  62.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1772  putative ferredoxin  44.44 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0325703  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1108  ferredoxin  43.28 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  42.37 
 
 
676 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  44.64 
 
 
675 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0873  putative iron-sulfur cluster-binding protein  38.24 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0202831  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003107  ferredoxin  40.3 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000688265  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.29 
 
 
687 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.37 
 
 
686 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02735  hypothetical protein  40.3 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.68 
 
 
687 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1691  oxidoreductase FAD-binding region  34.52 
 
 
327 aa  57.4  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  32.94 
 
 
586 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3505  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
291 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  34.12 
 
 
596 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
343 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
343 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
343 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
343 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
343 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
343 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
343 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
343 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.52 
 
 
329 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.158036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.68 
 
 
681 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2896  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.52 
 
 
329 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00679398  normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3052  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.52 
 
 
329 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  34.15 
 
 
590 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
343 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.72 
 
 
343 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.76 
 
 
348 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.62 
 
 
320 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.72 
 
 
343 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.72 
 
 
343 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  41.79 
 
 
322 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.72 
 
 
343 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.72 
 
 
343 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.72 
 
 
343 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.72 
 
 
343 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.09 
 
 
341 aa  53.9  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  38.75 
 
 
369 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.75 
 
 
370 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.75 
 
 
370 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  40.3 
 
 
323 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>