249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003107 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003107  ferredoxin  100 
 
 		 93 aa  193  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000688265  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02735  hypothetical protein  93.41 
 
 		 92 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0873  putative iron-sulfur cluster-binding protein  72.53 
 
 		 92 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0202831  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1772  putative ferredoxin  45.45 
 
 		 91 aa  93.6  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0325703  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  43.21 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1108  ferredoxin  43.94 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  48.57 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02162  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  38.27 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1423  ferredoxin  38.27 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02121  hypothetical protein  38.27 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2616  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.27 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.27 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.100794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2376  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.27 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2533  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.27 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3370  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.27 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2623  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.27 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.123357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2387  2Fe-2S ferredoxin YfaE  35.44 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2464  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.27 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.27 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2519  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.27 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2506  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.27 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  41.98 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2803  2Fe-2S ferredoxin YfaE  37.18 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697891  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.75 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1315  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.75 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  43.75 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  37.97 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0962  ferredoxin, 2Fe-2S type  40.98 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000314737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  41.79 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  38.46 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  40.3 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  37.04 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  44.07 
 
 		 711 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.55 
 
 		 445 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.86 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2062  ferredoxin  33.33 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0117  2Fe-2S-binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 74 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.781122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  41.43 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  41.43 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.44 
 
 		 678 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2135  ferredoxin  34.52 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2301  ferredoxin  30.77 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12598  normal  0.0821826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  40 
 
 		 371 aa  53.9  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  43.28 
 
 		 367 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.59 
 
 		 687 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2475  ferredoxin  36.23 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2793  putative reductase component of monooxygenase  35.8 
 
 		 365 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.44 
 
 		 687 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0384  iron-sulfur cluster binding protein  36.51 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1726  iron-sulfur cluster-binding protein  34.12 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.347237  hitchhiker  0.00725733 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1507  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.8 
 
 		 365 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  38.27 
 
 		 350 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  36.99 
 
 		 373 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  39.68 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  41.54 
 
 		 586 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 		 366 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2308  ferredoxin  38.1 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  hitchhiker  0.0000241513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  40.74 
 
 		 678 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2896  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 		 329 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00679398  normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3052  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 		 329 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.74 
 
 		 678 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 		 329 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.158036  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2409  ferredoxin  35 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000581579  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  46.15 
 
 		 675 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  38.36 
 
 		 369 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.36 
 
 		 370 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  38.1 
 
 		 136 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.36 
 
 		 370 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1914  ferredoxin  38.1 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318435  hitchhiker  0.0000000631262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2064  ferredoxin  38.1 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103253  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2998  ferredoxin  33.33 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.1 
 
 		 341 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1691  oxidoreductase FAD-binding region  37.5 
 
 		 327 aa  50.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.59 
 
 		 686 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2053  ferredoxin  35 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262921  unclonable  0.00000000000106292 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2057  ferredoxin  35 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1944  ferredoxin  31.03 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.241389  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  35.82 
 
 		 549 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  52.78 
 
 		 674 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  38.71 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4191  ferredoxin  36.11 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.661673  normal  0.663207 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.98 
 
 		 585 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  39.13 
 
 		 691 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1051  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.78 
 
 		 337 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.328018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  50 
 
 		 681 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2075  ferredoxin  37.1 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000572229  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  37.31 
 
 		 367 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  32.1 
 
 		 356 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0545  ferredoxin  32.35 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.91 
 
 		 376 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.91 
 
 		 380 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 		 467 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.33 
 
 		 363 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.62 
 
 		 336 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  40 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  30.67 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.6 
 
 		 690 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  45.24 
 
 		 353 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.46 
 
 		 676 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  36 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>