278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1772 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1772  putative ferredoxin  100 
 
 		 91 aa  189  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0325703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0873  putative iron-sulfur cluster-binding protein  52.81 
 
 		 92 aa  102  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0202831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02735  hypothetical protein  46.07 
 
 		 92 aa  98.2  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003107  ferredoxin  45.45 
 
 		 93 aa  93.6  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000688265  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1225  ferredoxin  51.52 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0962  ferredoxin, 2Fe-2S type  46.43 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000314737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2387  2Fe-2S ferredoxin YfaE  49.23 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  52.38 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2519  2Fe-2S ferredoxin YfaE  52.38 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2623  2Fe-2S ferredoxin YfaE  52.38 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.123357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2464  2Fe-2S ferredoxin YfaE  52.38 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2506  2Fe-2S ferredoxin YfaE  52.38 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02121  hypothetical protein  42.5 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02162  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  42.5 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1423  ferredoxin  42.5 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2616  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.5 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2533  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.5 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3370  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.5 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1415  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.5 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.100794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2376  2Fe-2S ferredoxin YfaE  42.5 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02127  iron-sulfur cluster-binding protein  41.77 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2803  2Fe-2S ferredoxin YfaE  47.14 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.697891  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1108  ferredoxin  41.27 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0117  2Fe-2S-binding domain-containing protein  43.94 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.781122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2135  ferredoxin  44.16 
 
 		 133 aa  67  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  40 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2308  ferredoxin  43.06 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  hitchhiker  0.0000241513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3505  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 		 291 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2301  ferredoxin  40 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12598  normal  0.0821826 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3215  2Fe-2S ferredoxin YfaE  46.03 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2850  2Fe-2S ferredoxin YfaE  47.62 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.880314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1954  ferredoxin  40 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0153263  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2771  2Fe-2S ferredoxin YfaE  47.62 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1315  2Fe-2S ferredoxin YfaE  47.62 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1035  2Fe-2S ferredoxin YfaE  47.62 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3023  2Fe-2S ferredoxin YfaE  47.69 
 
 		 86 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1914  ferredoxin  40 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318435  hitchhiker  0.0000000631262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2064  ferredoxin  40 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103253  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1967  ferredoxin  40 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00081482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1101  2Fe-2S ferredoxin YfaE  44.44 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1726  iron-sulfur cluster-binding protein  41.56 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.347237  hitchhiker  0.00725733 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  38.75 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3273  2Fe-2S ferredoxin YfaE  46.77 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2409  ferredoxin  38.75 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000581579  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0384  iron-sulfur cluster binding protein  51.85 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2292  ferredoxin  38.75 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000199036  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2053  ferredoxin  38.75 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.262921  unclonable  0.00000000000106292 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2075  ferredoxin  38.75 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000572229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2057  ferredoxin  38.75 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2062  ferredoxin  39.13 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  42.19 
 
 		 711 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.57 
 
 		 412 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  52.54 
 
 		 367 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  44.3 
 
 		 367 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  50.85 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40 
 
 		 445 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1944  ferredoxin  38.96 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.241389  normal  0.0118299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  40.7 
 
 		 674 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  43.64 
 
 		 687 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2475  ferredoxin  46.3 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.64 
 
 		 687 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.68 
 
 		 390 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.31 
 
 		 678 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  44.23 
 
 		 675 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4191  ferredoxin  36.99 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.661673  normal  0.663207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.64 
 
 		 681 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3690  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32 
 
 		 468 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  36.36 
 
 		 549 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  41.18 
 
 		 590 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  32 
 
 		 467 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  41.27 
 
 		 588 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1051  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.43 
 
 		 337 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.328018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  42.31 
 
 		 678 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.31 
 
 		 678 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.23 
 
 		 686 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  42.31 
 
 		 676 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.1 
 
 		 700 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  38.03 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.79 
 
 		 689 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  40.35 
 
 		 691 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.79 
 
 		 692 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  37.88 
 
 		 586 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.79 
 
 		 692 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.31 
 
 		 690 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  45.31 
 
 		 367 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1368  ferredoxin  38.64 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  42.42 
 
 		 369 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.79 
 
 		 684 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1691  oxidoreductase FAD-binding region  35.82 
 
 		 327 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  39.68 
 
 		 596 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  42.42 
 
 		 369 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  42.42 
 
 		 369 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  42.42 
 
 		 369 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4192  ferredoxin  33.33 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  42.42 
 
 		 369 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  45.28 
 
 		 713 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2998  ferredoxin  33.78 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  42.03 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.3 
 
 		 345 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  42.03 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>