More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2173 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  98.37 
 
 		 369 aa  754    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  98.37 
 
 		 369 aa  754    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  86.38 
 
 		 369 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  98.1 
 
 		 369 aa  755    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  100 
 
 		 369 aa  767    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  86.38 
 
 		 369 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  98.92 
 
 		 369 aa  759    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  98.37 
 
 		 369 aa  754    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  98.37 
 
 		 369 aa  754    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  98.1 
 
 		 369 aa  754    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  86.1 
 
 		 369 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  86.92 
 
 		 369 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  98.37 
 
 		 369 aa  754    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  86.65 
 
 		 369 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  79.67 
 
 		 371 aa  629  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  69.21 
 
 		 367 aa  560  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  69.29 
 
 		 369 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  69.13 
 
 		 370 aa  548  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  69.13 
 
 		 370 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  65.68 
 
 		 367 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  64.85 
 
 		 367 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  64.03 
 
 		 367 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  61.85 
 
 		 367 aa  488  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  41.51 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  39.73 
 
 		 366 aa  276  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  44.98 
 
 		 662 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  44.65 
 
 		 605 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2174  MOSC domain-containing protein  43.38 
 
 		 280 aa  232  9e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.160462 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  44.07 
 
 		 605 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  41.59 
 
 		 616 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  41.57 
 
 		 266 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  40.52 
 
 		 268 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  37.22 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3078  MOSC domain containing protein  36.55 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.558728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  36.78 
 
 		 265 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0697  MOSC domain-containing protein  36.14 
 
 		 283 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.722913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  39.03 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1456  hypothetical protein  35.25 
 
 		 283 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471976  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  38.81 
 
 		 267 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  38.81 
 
 		 267 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  37.22 
 
 		 267 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  35.97 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  37.55 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0195  MOSC domain containing protein  36.03 
 
 		 266 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  37.92 
 
 		 268 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0141  MOSC domain containing protein  34.46 
 
 		 263 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  35.56 
 
 		 269 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1825  MOSC domain containing protein  32.83 
 
 		 276 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3776  MOSC domain-containing protein  33.21 
 
 		 275 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  37.31 
 
 		 267 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4133  MOSC domain containing protein  36.05 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1596  MOSC domain-containing protein  33.85 
 
 		 264 aa  146  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1157  MOSC domain containing protein  36 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1005  MOSC domain protein beta barrel domain protein  34.91 
 
 		 285 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0446745  normal  0.3827 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2402  MOSC domain-containing protein  33.56 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  32.62 
 
 		 291 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1980  MOSC domain protein beta barrel domain protein  34.03 
 
 		 291 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.446271  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2929  MOSC domain protein beta barrel domain protein  34.78 
 
 		 289 aa  133  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3619  MOSC domain-containing protein  34.78 
 
 		 289 aa  133  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0886  MOSC domain-containing protein  34.55 
 
 		 289 aa  132  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0982763  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  34.32 
 
 		 283 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4117  MOSC-like beta barrel  33.81 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3268  MOSC domain-containing protein  33.45 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545549 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4249  MOSC domain-containing protein  33.81 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270492  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7473  hypothetical protein  33.61 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2217  hypothetical protein  32.75 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704942  hitchhiker  0.00711608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0465  MOSC domain-containing protein  30.66 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4642  MOSC domain protein beta barrel domain protein  30.88 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  32.1 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0270  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1762  uncharacterized Fe-S protein  31.67 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553736 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1722  MOSC domain-containing protein  31.23 
 
 		 416 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0687765  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2279  MOSC domain-containing protein  30.14 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  32.01 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0954  mosc domain-containing protein  30.14 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0292187  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03942  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08160)  28.4 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1125  MOSC domain-containing protein  30.14 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1126  MOSC-like beta barrel  30.36 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1041  mosc domain-containing protein  29.79 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3673  MOSC domain-containing protein  31.91 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614742  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3365  MOSC domain-containing protein  30.25 
 
 		 302 aa  110  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1002  MOSC domain-containing protein  33.57 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4341  MOSC domain-containing protein  32.34 
 
 		 314 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  31.49 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4182  MOSC domain containing protein  32.5 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1533  MOSC domain-containing protein  30.12 
 
 		 288 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134662 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18206  predicted protein  29.79 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.602779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  29.63 
 
 		 264 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0116  MOSC domain-containing protein  33.14 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1499  MOSC domain-containing protein  33.14 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46641  predicted protein  25.96 
 
 		 1036 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335573  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06729  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05900)  31.21 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  25.56 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2326  iron-sulfur cluster-binding protein  47.76 
 
 		 106 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0998711  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  26.16 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2319  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  42.03 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0219052 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2218  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  42.03 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129859  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2326  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  42.03 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0217103 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10746  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G07820)  32.48 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.673358  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  39.73 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>