115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7473 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7473  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427254 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4341  MOSC domain-containing protein  39.24 
 
 
314 aa  191  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1762  uncharacterized Fe-S protein  37.06 
 
 
288 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553736 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4117  MOSC-like beta barrel  37.76 
 
 
288 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4249  MOSC domain-containing protein  37.76 
 
 
288 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270492  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3268  MOSC domain-containing protein  38.11 
 
 
288 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.545549 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1722  MOSC domain-containing protein  38.33 
 
 
416 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0687765  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1980  MOSC domain protein beta barrel domain protein  37.72 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.446271  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3673  MOSC domain-containing protein  34.97 
 
 
288 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614742  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0270  MOSC domain-containing protein  38.97 
 
 
290 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184524 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0886  MOSC domain-containing protein  38.49 
 
 
289 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0982763  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3619  MOSC domain-containing protein  37.77 
 
 
289 aa  175  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2929  MOSC domain protein beta barrel domain protein  37.77 
 
 
289 aa  175  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1041  mosc domain-containing protein  36.59 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2279  MOSC domain-containing protein  36.59 
 
 
289 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  39.11 
 
 
283 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0954  mosc domain-containing protein  36.59 
 
 
289 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0292187  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1125  MOSC domain-containing protein  36.59 
 
 
289 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2217  hypothetical protein  37.37 
 
 
291 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704942  hitchhiker  0.00711608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0195  MOSC domain containing protein  37.55 
 
 
266 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  36.11 
 
 
267 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0465  MOSC domain-containing protein  36.69 
 
 
290 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0141  MOSC domain containing protein  36.73 
 
 
263 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1126  MOSC-like beta barrel  36.17 
 
 
301 aa  158  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4642  MOSC domain protein beta barrel domain protein  35.27 
 
 
311 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  34.66 
 
 
367 aa  148  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3365  MOSC domain-containing protein  36.04 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1533  MOSC domain-containing protein  36.65 
 
 
288 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.134662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  36.25 
 
 
265 aa  145  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  36.06 
 
 
268 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  33.07 
 
 
369 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  36.92 
 
 
291 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3078  MOSC domain containing protein  32.61 
 
 
287 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.558728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  35.45 
 
 
271 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.67 
 
 
370 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.67 
 
 
370 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  30.12 
 
 
366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  33.2 
 
 
367 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  34.57 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  32.02 
 
 
367 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  31.62 
 
 
367 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  34.1 
 
 
269 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4182  MOSC domain containing protein  34.89 
 
 
290 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440376  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  32.12 
 
 
269 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  32.71 
 
 
367 aa  132  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4133  MOSC domain containing protein  32.21 
 
 
293 aa  132  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  33.58 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  32.34 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  33.46 
 
 
272 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  32.93 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  32.34 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2402  MOSC domain-containing protein  34.24 
 
 
289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1456  hypothetical protein  32.47 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2174  MOSC domain-containing protein  29.58 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.160462 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  33.61 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  33.61 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1005  MOSC domain protein beta barrel domain protein  34.02 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0446745  normal  0.3827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1157  MOSC domain containing protein  32.79 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  33.61 
 
 
369 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  33.61 
 
 
369 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  33.61 
 
 
369 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  33.61 
 
 
369 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  33.61 
 
 
369 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  33.2 
 
 
369 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  33.61 
 
 
369 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1825  MOSC domain containing protein  29.96 
 
 
276 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013397  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  34.02 
 
 
369 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  34.02 
 
 
369 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  31.2 
 
 
267 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  34.02 
 
 
369 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  29.74 
 
 
266 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0116  MOSC domain-containing protein  33.74 
 
 
245 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1499  MOSC domain-containing protein  33.61 
 
 
259 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  33.61 
 
 
369 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  34.02 
 
 
369 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  31.43 
 
 
390 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  31.3 
 
 
616 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1596  MOSC domain-containing protein  29.39 
 
 
264 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  32.53 
 
 
268 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3776  MOSC domain-containing protein  32.81 
 
 
275 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  33.61 
 
 
371 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  32.16 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  27.88 
 
 
605 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1002  MOSC domain-containing protein  30.94 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  29.59 
 
 
662 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  28.62 
 
 
605 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0697  MOSC domain-containing protein  30.92 
 
 
283 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.722913  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  29.57 
 
 
264 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03942  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08160)  26.55 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18206  predicted protein  27.54 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.602779  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46641  predicted protein  24.63 
 
 
1036 aa  77  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335573  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01637  Molybdenum cofactor sulfurase (MoCo sulfurase)(MOS)(EC 4.4.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9UV64]  24.21 
 
 
839 aa  72.4  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  25.45 
 
 
215 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  25.35 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0385  MOSC domain containing protein  24.48 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0376  MOSC domain containing protein  24.48 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10746  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G07820)  31.71 
 
 
419 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.673358  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  24.57 
 
 
233 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  24.56 
 
 
267 aa  52  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06729  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05900)  38.89 
 
 
478 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>