144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1671 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  100 
 
 		 267 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  92.13 
 
 		 267 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  92.13 
 
 		 267 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  82.02 
 
 		 267 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  64.66 
 
 		 269 aa  344  8e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  63.16 
 
 		 269 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  62.64 
 
 		 268 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  64.55 
 
 		 268 aa  323  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  59.25 
 
 		 268 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  63.43 
 
 		 268 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  42.54 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3078  MOSC domain containing protein  43.53 
 
 		 287 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.558728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  40.07 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  37.74 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0141  MOSC domain containing protein  38.76 
 
 		 263 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2174  MOSC domain-containing protein  40.15 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.160462 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  42.48 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  41.85 
 
 		 616 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2402  MOSC domain-containing protein  42.12 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  38.06 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  38.58 
 
 		 605 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4133  MOSC domain containing protein  36.57 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  40.52 
 
 		 662 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  37.59 
 
 		 605 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  39.19 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  37.31 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  35.64 
 
 		 367 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  38.72 
 
 		 371 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  38.6 
 
 		 367 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0195  MOSC domain containing protein  40.89 
 
 		 266 aa  152  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  38.06 
 
 		 369 aa  151  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  37.69 
 
 		 369 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  38.06 
 
 		 369 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  36.23 
 
 		 369 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  36.23 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  35.87 
 
 		 369 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  36.23 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  38.06 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  38.06 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1596  MOSC domain-containing protein  32.56 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  38.06 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  38.06 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  38.06 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  35.87 
 
 		 369 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  37.31 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.23 
 
 		 370 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.23 
 
 		 370 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  36.23 
 
 		 369 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  36.16 
 
 		 367 aa  145  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1980  MOSC domain protein beta barrel domain protein  37.28 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.446271  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  38.87 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3776  MOSC domain-containing protein  34.2 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  35.21 
 
 		 367 aa  142  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4182  MOSC domain containing protein  39.49 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1762  uncharacterized Fe-S protein  35.94 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553736 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1456  hypothetical protein  36.82 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471976  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0697  MOSC domain-containing protein  36.5 
 
 		 283 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.722913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1157  MOSC domain containing protein  35.38 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0270  MOSC domain-containing protein  35.51 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184524 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4117  MOSC-like beta barrel  36.3 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4249  MOSC domain-containing protein  36.3 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270492  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4341  MOSC domain-containing protein  36.24 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3268  MOSC domain-containing protein  36.3 
 
 		 288 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1005  MOSC domain protein beta barrel domain protein  35.02 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0446745  normal  0.3827 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1722  MOSC domain-containing protein  34.98 
 
 		 416 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0687765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1825  MOSC domain containing protein  32.53 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  36.26 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3673  MOSC domain-containing protein  35.23 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614742  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1041  mosc domain-containing protein  35.34 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1002  MOSC domain-containing protein  38.85 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  36.5 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2279  MOSC domain-containing protein  35.34 
 
 		 289 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0954  mosc domain-containing protein  35.34 
 
 		 289 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0292187  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1125  MOSC domain-containing protein  35.34 
 
 		 289 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  35.88 
 
 		 283 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7473  hypothetical protein  32.34 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2217  hypothetical protein  36.75 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704942  hitchhiker  0.00711608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0886  MOSC domain-containing protein  35.77 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0982763  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0465  MOSC domain-containing protein  36.56 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2929  MOSC domain protein beta barrel domain protein  37.18 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3619  MOSC domain-containing protein  37.18 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1533  MOSC domain-containing protein  33.7 
 
 		 288 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134662 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1126  MOSC-like beta barrel  35.45 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  34.31 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4642  MOSC domain protein beta barrel domain protein  33.33 
 
 		 311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3365  MOSC domain-containing protein  32.09 
 
 		 302 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0116  MOSC domain-containing protein  35.27 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1499  MOSC domain-containing protein  35.27 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03942  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08160)  25.63 
 
 		 367 aa  99.4  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18206  predicted protein  28.66 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.602779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46641  predicted protein  26.09 
 
 		 1036 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335573  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5683  MOSC domain-containing protein  30.56 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5304  MOSC domain-containing protein  28.97 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5393  MOSC domain-containing protein  28.97 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  28.73 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  29.1 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  32.47 
 
 		 253 aa  72  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  26.79 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  29.23 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  24.04 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>