120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1456 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1456  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471976  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1157  MOSC domain containing protein  58.87 
 
 		 285 aa  346  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1005  MOSC domain protein beta barrel domain protein  58.51 
 
 		 285 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0446745  normal  0.3827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0697  MOSC domain-containing protein  49.29 
 
 		 283 aa  265  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.722913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  38.18 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0141  MOSC domain containing protein  37.78 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  36.71 
 
 		 371 aa  168  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2174  MOSC domain-containing protein  36.24 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.160462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  34.55 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3078  MOSC domain containing protein  39.45 
 
 		 287 aa  165  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.558728 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  35.97 
 
 		 369 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0195  MOSC domain containing protein  39.71 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  35.61 
 
 		 369 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  35.61 
 
 		 369 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  37 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  35.64 
 
 		 369 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  35.64 
 
 		 369 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  35.64 
 
 		 369 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  35.64 
 
 		 369 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  35.64 
 
 		 369 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  35.25 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  36.59 
 
 		 369 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  35.27 
 
 		 367 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  36.59 
 
 		 369 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  36.59 
 
 		 369 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  35.64 
 
 		 367 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  35.64 
 
 		 367 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  36.59 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  32.96 
 
 		 366 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  36.59 
 
 		 369 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  35.27 
 
 		 367 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.94 
 
 		 370 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.94 
 
 		 370 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  33.94 
 
 		 369 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  35.66 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  37.41 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  33.45 
 
 		 605 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4133  MOSC domain containing protein  37.25 
 
 		 293 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0270  MOSC domain-containing protein  36.43 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184524 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  34.18 
 
 		 605 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  38.1 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2402  MOSC domain-containing protein  35.47 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  36.36 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  32.97 
 
 		 662 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1762  uncharacterized Fe-S protein  37.99 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553736 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4117  MOSC-like beta barrel  37.55 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4249  MOSC domain-containing protein  37.55 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270492  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1980  MOSC domain protein beta barrel domain protein  34.98 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.446271  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  36.73 
 
 		 269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3673  MOSC domain-containing protein  37.45 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614742  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  36.82 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  36.2 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4341  MOSC domain-containing protein  36.68 
 
 		 314 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3619  MOSC domain-containing protein  36.46 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2929  MOSC domain protein beta barrel domain protein  36.46 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2279  MOSC domain-containing protein  34.22 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0954  mosc domain-containing protein  34.22 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0292187  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0886  MOSC domain-containing protein  36.05 
 
 		 289 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0982763  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1125  MOSC domain-containing protein  34.22 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  36.23 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1002  MOSC domain-containing protein  35.48 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  36.23 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1722  MOSC domain-containing protein  35.65 
 
 		 416 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0687765  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0465  MOSC domain-containing protein  33.94 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  35.87 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3268  MOSC domain-containing protein  36.24 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545549 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1041  mosc domain-containing protein  33.84 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1533  MOSC domain-containing protein  34.24 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134662 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  33.93 
 
 		 616 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  35.38 
 
 		 268 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  34.73 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  35.38 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7473  hypothetical protein  32.47 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427254 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  30.91 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3365  MOSC domain-containing protein  34.09 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1126  MOSC-like beta barrel  34.28 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  31.25 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  33.88 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2217  hypothetical protein  32.62 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704942  hitchhiker  0.00711608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3776  MOSC domain-containing protein  33.09 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1596  MOSC domain-containing protein  30.11 
 
 		 264 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  30.8 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4642  MOSC domain protein beta barrel domain protein  31.84 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03942  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08160)  28.26 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4182  MOSC domain containing protein  32.26 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18206  predicted protein  26.96 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.602779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  30.07 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1825  MOSC domain containing protein  28.31 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1499  MOSC domain-containing protein  33.03 
 
 		 259 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0116  MOSC domain-containing protein  33.03 
 
 		 245 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01637  Molybdenum cofactor sulfurase (MoCo sulfurase)(MOS)(EC 4.4.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9UV64]  26.72 
 
 		 839 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46641  predicted protein  26.07 
 
 		 1036 aa  69.7  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335573  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  27.85 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1030  MOSC domain protein beta barrel domain protein  26.78 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  26.16 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0385  MOSC domain containing protein  26.41 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0376  MOSC domain containing protein  26.41 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  25.21 
 
 		 259 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  28.25 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  25.72 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>