More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1706 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  93.82 
 
 		 341 aa  669    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1706  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  100 
 
 		 347 aa  718    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2372  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  73.35 
 
 		 335 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2272  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  72.62 
 
 		 335 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1590  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  69.14 
 
 		 352 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2618  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  69.14 
 
 		 340 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2702  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  69.14 
 
 		 340 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  66.17 
 
 		 334 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  62.87 
 
 		 322 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843947 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  62.57 
 
 		 322 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  62.57 
 
 		 322 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  62.57 
 
 		 322 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  62.57 
 
 		 322 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  62.57 
 
 		 322 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  62.57 
 
 		 322 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  62.28 
 
 		 322 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  61.98 
 
 		 322 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  60.78 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  60.18 
 
 		 323 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  60.18 
 
 		 323 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  59.88 
 
 		 323 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  59.58 
 
 		 323 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  59.58 
 
 		 323 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.42 
 
 		 380 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.64 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  34.92 
 
 		 365 aa  192  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.61 
 
 		 380 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.33 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.16 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.54 
 
 		 406 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.44 
 
 		 387 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.24 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.08 
 
 		 367 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  32.61 
 
 		 325 aa  182  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.59 
 
 		 403 aa  182  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.15 
 
 		 371 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.96 
 
 		 407 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  31.6 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  34.77 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  30.33 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  30.66 
 
 		 372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  30.77 
 
 		 364 aa  162  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  29.8 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.58 
 
 		 382 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.58 
 
 		 382 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  30.39 
 
 		 627 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.98 
 
 		 380 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  31.98 
 
 		 381 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.74 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  30.99 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.98 
 
 		 380 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.69 
 
 		 380 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.69 
 
 		 380 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.69 
 
 		 380 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.69 
 
 		 381 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.16 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  32.16 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.16 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.52 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.29 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.14 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  27.78 
 
 		 366 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  27.78 
 
 		 366 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  28.49 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.36 
 
 		 396 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  30.99 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  28.34 
 
 		 597 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  30.61 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  29.74 
 
 		 379 aa  149  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  30.75 
 
 		 362 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.65 
 
 		 375 aa  149  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  30.27 
 
 		 625 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.41 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  28.21 
 
 		 670 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.86 
 
 		 385 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  28.99 
 
 		 366 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.73 
 
 		 669 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.65 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.33 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.81 
 
 		 585 aa  142  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.26 
 
 		 383 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.62 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.15 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  28.49 
 
 		 366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.15 
 
 		 366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.71 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.37 
 
 		 702 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.27 
 
 		 368 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  28.69 
 
 		 585 aa  139  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  29.05 
 
 		 358 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  31.74 
 
 		 381 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.86 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.05 
 
 		 688 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.46 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.34 
 
 		 352 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.45 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  27.49 
 
 		 355 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.72 
 
 		 677 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  27.63 
 
 		 348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  30.91 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>