More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1665 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  100 
 
 		 334 aa  689    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  66.27 
 
 		 341 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2272  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  66.27 
 
 		 335 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2372  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  65.37 
 
 		 335 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1706  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  66.17 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2702  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  65.66 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2618  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  65.66 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1590  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  65.66 
 
 		 352 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  57.19 
 
 		 322 aa  391  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843947 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  56.89 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  56.89 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  56.89 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  56.59 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  56.89 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  56.89 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  56.59 
 
 		 322 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  56.59 
 
 		 322 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  54.79 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  54.79 
 
 		 323 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  54.79 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  55.39 
 
 		 322 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  54.49 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  54.49 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.28 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  39.26 
 
 		 356 aa  216  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.76 
 
 		 376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.06 
 
 		 380 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.09 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.18 
 
 		 380 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.55 
 
 		 388 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.57 
 
 		 387 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.33 
 
 		 367 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  34.89 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.28 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  34.12 
 
 		 364 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.53 
 
 		 403 aa  189  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  33.23 
 
 		 365 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.53 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.84 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  30.72 
 
 		 368 aa  176  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  31.86 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.86 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.86 
 
 		 380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.38 
 
 		 382 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.38 
 
 		 382 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.27 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.27 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.27 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.27 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  30.79 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.09 
 
 		 382 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  31.09 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  30.14 
 
 		 372 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  31.01 
 
 		 372 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.2 
 
 		 386 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  32.73 
 
 		 362 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.14 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.5 
 
 		 382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  29.33 
 
 		 366 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  29.33 
 
 		 366 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  30.63 
 
 		 358 aa  165  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  32.05 
 
 		 379 aa  165  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  29.69 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.48 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  30.7 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  31.38 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  34.23 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  30.5 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.5 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.52 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.52 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.3 
 
 		 375 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.69 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.07 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.7 
 
 		 396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.23 
 
 		 366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.52 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.85 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  29.91 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.99 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.91 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  28.7 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  31.48 
 
 		 394 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  31.93 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.03 
 
 		 385 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  28.74 
 
 		 585 aa  152  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29 
 
 		 363 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  28.91 
 
 		 355 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.6 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  27.3 
 
 		 418 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  28.09 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  30.29 
 
 		 605 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.06 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  28.53 
 
 		 627 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.58 
 
 		 585 aa  135  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  29.39 
 
 		 364 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  32.65 
 
 		 360 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  30.41 
 
 		 380 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  30.84 
 
 		 605 aa  133  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  32.09 
 
 		 379 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>