More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1590 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1590  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  100 
 
 
352 aa  735    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2702  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  100 
 
 
340 aa  709    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2618  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  100 
 
 
340 aa  709    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  68.33 
 
 
341 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1706  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  69.14 
 
 
347 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2372  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  68.37 
 
 
335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2272  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  68.67 
 
 
335 aa  441  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  65.66 
 
 
334 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  59.52 
 
 
322 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  59.52 
 
 
322 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  59.52 
 
 
322 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  59.52 
 
 
322 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  59.52 
 
 
322 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  59.52 
 
 
322 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  59.21 
 
 
322 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  58.91 
 
 
322 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  58.91 
 
 
322 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  57.4 
 
 
323 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  57.7 
 
 
323 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  57.4 
 
 
323 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  57.7 
 
 
323 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  57.7 
 
 
323 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  57.7 
 
 
322 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.43 
 
 
403 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.1 
 
 
387 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.72 
 
 
371 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.5 
 
 
376 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.62 
 
 
388 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.5 
 
 
380 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.43 
 
 
406 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.5 
 
 
380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.35 
 
 
374 aa  179  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.13 
 
 
367 aa  176  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.55 
 
 
361 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  32.92 
 
 
325 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.75 
 
 
407 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  31.63 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  30.3 
 
 
351 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  29.38 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  28.41 
 
 
372 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  32.05 
 
 
356 aa  159  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  28.23 
 
 
368 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  30.03 
 
 
364 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.72 
 
 
383 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.51 
 
 
363 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  27.99 
 
 
365 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.29 
 
 
382 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.29 
 
 
382 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.2 
 
 
382 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.99 
 
 
382 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  28.99 
 
 
382 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.99 
 
 
382 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  28.99 
 
 
382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.45 
 
 
386 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.69 
 
 
385 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  26.76 
 
 
366 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  26.76 
 
 
366 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  28.99 
 
 
382 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  27.04 
 
 
670 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.23 
 
 
699 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.73 
 
 
367 aa  142  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.28 
 
 
352 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  28.49 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  29.25 
 
 
379 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.49 
 
 
380 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.49 
 
 
380 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  28.27 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.41 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.81 
 
 
396 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  26.3 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.37 
 
 
414 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  27.89 
 
 
380 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  27.89 
 
 
380 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  27.89 
 
 
380 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  27.89 
 
 
381 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  26.65 
 
 
597 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  26.84 
 
 
627 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.9 
 
 
366 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.61 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.61 
 
 
366 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.61 
 
 
390 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  26.01 
 
 
366 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.74 
 
 
342 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.39 
 
 
669 aa  136  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.76 
 
 
702 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.07 
 
 
381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  26.18 
 
 
379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  25.83 
 
 
418 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  27.49 
 
 
585 aa  133  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.32 
 
 
375 aa  133  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  29.67 
 
 
381 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.15 
 
 
688 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  25.44 
 
 
366 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  31.48 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.39 
 
 
677 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.73 
 
 
375 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  27.14 
 
 
625 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  27.25 
 
 
358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  25.61 
 
 
349 aa  129  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2893  ferredoxin  29.03 
 
 
347 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200106  normal  0.439628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>