More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2919 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  100 
 
 
368 aa  729    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  100 
 
 
368 aa  729    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  100 
 
 
368 aa  729    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  67.49 
 
 
365 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  65.82 
 
 
351 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0477  ferredoxin  55.92 
 
 
385 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4341  ferredoxin  54.25 
 
 
379 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12789  oxidoreductase  49.2 
 
 
363 aa  257  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.315864  normal  0.803284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  45.59 
 
 
328 aa  245  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  46.53 
 
 
333 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  43.99 
 
 
315 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  46.1 
 
 
315 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  46.1 
 
 
315 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  46.1 
 
 
315 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  41.88 
 
 
319 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.69 
 
 
318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  44.62 
 
 
657 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  44.55 
 
 
331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  42.81 
 
 
316 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  42.81 
 
 
316 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  41.23 
 
 
333 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  46.23 
 
 
774 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  41.23 
 
 
333 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  43.38 
 
 
321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  42.14 
 
 
321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  43.38 
 
 
321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  43.08 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  42.46 
 
 
321 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  42.15 
 
 
321 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  39.51 
 
 
788 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  44.16 
 
 
784 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  44.16 
 
 
784 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  44.16 
 
 
784 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  44.16 
 
 
784 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  44.16 
 
 
784 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  44.16 
 
 
784 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  44.48 
 
 
783 aa  205  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  43.83 
 
 
784 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  41.46 
 
 
782 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  38.87 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  37.82 
 
 
788 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  38.28 
 
 
320 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.76 
 
 
783 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  37.62 
 
 
780 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  41.25 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  39.01 
 
 
322 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.85 
 
 
321 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  42.21 
 
 
784 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  37.95 
 
 
337 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  41.12 
 
 
754 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  39.88 
 
 
319 aa  193  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  39.5 
 
 
323 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  37.96 
 
 
318 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.61 
 
 
316 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  39.32 
 
 
322 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  42.07 
 
 
317 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  41.23 
 
 
794 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  39.62 
 
 
318 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.67 
 
 
317 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  43.33 
 
 
775 aa  186  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  39.06 
 
 
316 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  39.27 
 
 
316 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  37.42 
 
 
319 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  39.08 
 
 
320 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  39.13 
 
 
321 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  38.46 
 
 
316 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  40.18 
 
 
325 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  39.74 
 
 
318 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  38.39 
 
 
317 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  40.37 
 
 
319 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  38.51 
 
 
316 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  32.93 
 
 
330 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  36.36 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.85 
 
 
315 aa  179  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.34 
 
 
322 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.73 
 
 
316 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  36.57 
 
 
321 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  38.54 
 
 
320 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.58 
 
 
313 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  37.5 
 
 
323 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  38.98 
 
 
769 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  36.91 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  35.89 
 
 
588 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  36.92 
 
 
321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  36.31 
 
 
321 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  37.74 
 
 
323 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  36.89 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  40.26 
 
 
330 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  38.06 
 
 
319 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  37.42 
 
 
319 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  37.5 
 
 
324 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  36.81 
 
 
322 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  35.17 
 
 
320 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  35.17 
 
 
320 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  35.08 
 
 
319 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  34.71 
 
 
321 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.69 
 
 
320 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  37.42 
 
 
325 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  36.13 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  36.13 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>