More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0477 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0477  ferredoxin  100 
 
 		 385 aa  778    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4341  ferredoxin  57.61 
 
 		 379 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  60.11 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  55.92 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  58.31 
 
 		 351 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  55.92 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  55.92 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12789  oxidoreductase  43.68 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.315864  normal  0.803284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  43.42 
 
 		 657 aa  246  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  40.82 
 
 		 333 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  40.82 
 
 		 333 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  42.9 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  39.39 
 
 		 774 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  42.06 
 
 		 315 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  41.64 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  38.73 
 
 		 788 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  37.38 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  38.76 
 
 		 319 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.36 
 
 		 318 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  40.66 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  41.1 
 
 		 315 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  41.1 
 
 		 315 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  41.1 
 
 		 315 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  39.81 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  40.89 
 
 		 321 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  40.89 
 
 		 321 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  40.89 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  41.64 
 
 		 784 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  35.34 
 
 		 782 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.69 
 
 		 783 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  38.85 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  36.44 
 
 		 780 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  38.44 
 
 		 316 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  38.44 
 
 		 316 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  39.51 
 
 		 784 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  39.51 
 
 		 784 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  39.51 
 
 		 784 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  35.91 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  39.51 
 
 		 784 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  39.51 
 
 		 784 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  39.1 
 
 		 321 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  39.51 
 
 		 784 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  39.2 
 
 		 784 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  37.46 
 
 		 319 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  38.69 
 
 		 794 aa  189  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  38.01 
 
 		 775 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  35.77 
 
 		 788 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  37.19 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  38.94 
 
 		 783 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  36.72 
 
 		 754 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  38.3 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  38.56 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  38.54 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  35.83 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  36.87 
 
 		 323 aa  177  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  34.36 
 
 		 351 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.65 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  34.52 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  37.12 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  34.95 
 
 		 322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  34.27 
 
 		 320 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  34.49 
 
 		 588 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  34.38 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  37.33 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  35.29 
 
 		 769 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  33.56 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  33.95 
 
 		 319 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  35.58 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  31.94 
 
 		 321 aa  170  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  38.96 
 
 		 319 aa  170  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  34.63 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  34.97 
 
 		 320 aa  169  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  34.71 
 
 		 324 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.91 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3939  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase / oxidoreductase, NAD-dependent  33.23 
 
 		 558 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  36.48 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  36.01 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  33.66 
 
 		 316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  33.64 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  36.22 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  32.82 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  35.85 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  35.71 
 
 		 317 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  31.92 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  36.86 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.85 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  32.26 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  34.19 
 
 		 321 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  34.19 
 
 		 321 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  35.31 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  33.87 
 
 		 321 aa  163  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  34.19 
 
 		 321 aa  163  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  33.33 
 
 		 316 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  35.56 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  33.87 
 
 		 321 aa  163  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  33.12 
 
 		 319 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  34.19 
 
 		 321 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.87 
 
 		 321 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  33.33 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  35.37 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>