More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0687 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  62.29 
 
 		 784 aa  983    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  69.85 
 
 		 784 aa  1125    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  69.59 
 
 		 784 aa  1122    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  74.94 
 
 		 783 aa  1235    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  69.59 
 
 		 784 aa  1118    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  75.35 
 
 		 788 aa  1209    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  71.01 
 
 		 783 aa  1149    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  69.59 
 
 		 784 aa  1119    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  74.01 
 
 		 782 aa  1207    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  73.63 
 
 		 780 aa  1215    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  58.12 
 
 		 769 aa  899    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  69.59 
 
 		 784 aa  1122    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  61.24 
 
 		 788 aa  1025    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  100 
 
 		 794 aa  1627    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  69.59 
 
 		 784 aa  1122    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  62.86 
 
 		 775 aa  966    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  69.59 
 
 		 784 aa  1122    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  34.41 
 
 		 774 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  30.95 
 
 		 754 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  37.35 
 
 		 418 aa  277  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  46.82 
 
 		 320 aa  251  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  44.59 
 
 		 333 aa  250  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  44.59 
 
 		 333 aa  250  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  48.44 
 
 		 328 aa  250  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  46.15 
 
 		 316 aa  243  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  32.87 
 
 		 425 aa  243  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  44.84 
 
 		 333 aa  242  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  44.3 
 
 		 318 aa  237  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  44.59 
 
 		 316 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  41.46 
 
 		 323 aa  233  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  44.59 
 
 		 316 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  45.51 
 
 		 315 aa  233  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  44.79 
 
 		 327 aa  232  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  44.98 
 
 		 315 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  40.32 
 
 		 323 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  44.83 
 
 		 320 aa  224  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  39.06 
 
 		 322 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  39.05 
 
 		 321 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  40.06 
 
 		 321 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  41.96 
 
 		 319 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  40.06 
 
 		 321 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  40.89 
 
 		 319 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  41.82 
 
 		 320 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  42.06 
 
 		 321 aa  218  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  38.8 
 
 		 322 aa  218  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  40.25 
 
 		 321 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  44.3 
 
 		 319 aa  217  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  39.42 
 
 		 317 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  40.71 
 
 		 325 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  39.51 
 
 		 321 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  38.63 
 
 		 321 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  39.56 
 
 		 322 aa  215  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  39.87 
 
 		 1070 aa  213  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  40.06 
 
 		 330 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  38.61 
 
 		 320 aa  210  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  38.61 
 
 		 320 aa  210  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  41.03 
 
 		 326 aa  210  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  37.22 
 
 		 326 aa  209  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  37.85 
 
 		 318 aa  209  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.68 
 
 		 315 aa  208  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  38.49 
 
 		 1069 aa  207  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  43.73 
 
 		 331 aa  207  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.42 
 
 		 322 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  39.67 
 
 		 337 aa  206  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  42.17 
 
 		 330 aa  204  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  39.35 
 
 		 657 aa  204  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  37.78 
 
 		 316 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.01 
 
 		 317 aa  204  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  39.34 
 
 		 319 aa  203  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  39.32 
 
 		 325 aa  203  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  40 
 
 		 321 aa  203  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  37.14 
 
 		 316 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  39.74 
 
 		 326 aa  201  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  39.3 
 
 		 326 aa  201  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  36.83 
 
 		 316 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  38.61 
 
 		 588 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  37.76 
 
 		 323 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.75 
 
 		 317 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  36.59 
 
 		 322 aa  198  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  40.2 
 
 		 321 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  38.49 
 
 		 351 aa  197  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  38.78 
 
 		 352 aa  197  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  36.68 
 
 		 320 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  36.53 
 
 		 320 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  40.14 
 
 		 321 aa  195  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  36.79 
 
 		 334 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0477  ferredoxin  36.78 
 
 		 385 aa  193  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  35.87 
 
 		 316 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  36.71 
 
 		 321 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  38.8 
 
 		 323 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.02 
 
 		 317 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  36.39 
 
 		 321 aa  191  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  38.11 
 
 		 321 aa  191  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  39.03 
 
 		 317 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  41.29 
 
 		 368 aa  191  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  41.29 
 
 		 368 aa  191  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  41.29 
 
 		 319 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  38.01 
 
 		 344 aa  191  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  41.29 
 
 		 368 aa  191  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  32.69 
 
 		 426 aa  190  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>