More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1606 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  100 
 
 
418 aa  855    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  51.54 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  38.55 
 
 
788 aa  302  6.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  37.95 
 
 
784 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  37.59 
 
 
782 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  37.91 
 
 
784 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  37.91 
 
 
784 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  37.91 
 
 
784 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  37.91 
 
 
784 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  37.91 
 
 
784 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  37.68 
 
 
783 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  37.95 
 
 
784 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  37.83 
 
 
788 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  37.93 
 
 
784 aa  280  5e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  37.35 
 
 
794 aa  277  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  37.38 
 
 
769 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.55 
 
 
783 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  36.83 
 
 
775 aa  273  6e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  35.9 
 
 
780 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.43 
 
 
405 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2520  putative cytochrome P450  35.98 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902578  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  36.73 
 
 
417 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  36.6 
 
 
388 aa  219  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  36.46 
 
 
417 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  37.27 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  35.23 
 
 
399 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  36.88 
 
 
410 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  31.95 
 
 
380 aa  206  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  35.85 
 
 
413 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  34.24 
 
 
412 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  34.24 
 
 
411 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  32.59 
 
 
402 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  33.99 
 
 
413 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  34.96 
 
 
401 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  34 
 
 
412 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  33.09 
 
 
405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  33.09 
 
 
405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  33.69 
 
 
426 aa  199  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  33.92 
 
 
407 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  33.92 
 
 
407 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  33.92 
 
 
407 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  34.64 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  33.5 
 
 
407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  31.93 
 
 
401 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  34.02 
 
 
414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  34.07 
 
 
406 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  33.33 
 
 
402 aa  196  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4150  cytochrome P450  33.58 
 
 
408 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  35.23 
 
 
404 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  35.39 
 
 
408 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  31.12 
 
 
410 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  33.33 
 
 
392 aa  193  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  33.49 
 
 
405 aa  193  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  34.55 
 
 
395 aa  192  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  34.62 
 
 
423 aa  192  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  33.49 
 
 
405 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  35.83 
 
 
411 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  35.11 
 
 
407 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  33.83 
 
 
408 aa  190  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  32.98 
 
 
410 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  29.85 
 
 
420 aa  189  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  35.22 
 
 
394 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  32.8 
 
 
411 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  32.28 
 
 
402 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  32.21 
 
 
405 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  32.28 
 
 
402 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  32.28 
 
 
402 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  31.71 
 
 
417 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  33.76 
 
 
405 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  39.32 
 
 
417 aa  186  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  32.2 
 
 
412 aa  186  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  37.5 
 
 
419 aa  186  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  33.6 
 
 
405 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  30.67 
 
 
415 aa  186  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  32.82 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  31.73 
 
 
408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  36.23 
 
 
398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  32.88 
 
 
398 aa  183  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  31.74 
 
 
405 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  31.08 
 
 
396 aa  182  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  34.04 
 
 
404 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  28.5 
 
 
447 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  31.49 
 
 
405 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  33.06 
 
 
398 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  31.49 
 
 
405 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  36.25 
 
 
406 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  33.42 
 
 
404 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  33.42 
 
 
395 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  36.25 
 
 
406 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  36.25 
 
 
406 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  29.68 
 
 
414 aa  180  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  32.29 
 
 
398 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  30.97 
 
 
402 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  30.59 
 
 
411 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4491  cytochrome P450  30.17 
 
 
421 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  32.98 
 
 
403 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  31.16 
 
 
401 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  33.33 
 
 
416 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  33.33 
 
 
407 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  33.06 
 
 
398 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>