More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2588 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  100 
 
 
405 aa  817    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  100 
 
 
405 aa  817    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4150  cytochrome P450  82.63 
 
 
408 aa  668    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  48.45 
 
 
405 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1782  cytochrome P450  47.49 
 
 
418 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1829  cytochrome P450  47.49 
 
 
418 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1764  cytochrome P450  47.49 
 
 
418 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  45.36 
 
 
404 aa  334  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6889  cytochrome P450  44.2 
 
 
414 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0364  cytochrome P450  42.61 
 
 
413 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5387  cytochrome P450  39.21 
 
 
418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.659302  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  41.79 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  34.97 
 
 
405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0599  cytochrome P450  35.62 
 
 
425 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00925226  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0631  cytochrome P450  33.73 
 
 
427 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0693761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  38.63 
 
 
388 aa  225  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.59 
 
 
411 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  35.24 
 
 
398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  33.07 
 
 
380 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  35.25 
 
 
399 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  34 
 
 
417 aa  210  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1912  cytochrome P450  32.96 
 
 
426 aa  209  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.997168  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.01 
 
 
411 aa  209  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  33.59 
 
 
408 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  37.16 
 
 
395 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  35.1 
 
 
390 aa  206  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  34.31 
 
 
402 aa  206  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  33.7 
 
 
411 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  33.09 
 
 
418 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  37.03 
 
 
411 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  33.43 
 
 
411 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  33.43 
 
 
411 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  36.23 
 
 
398 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  37.27 
 
 
408 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  36.08 
 
 
411 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  33.83 
 
 
402 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  36.39 
 
 
411 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  36.08 
 
 
411 aa  202  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  33.15 
 
 
411 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  35.76 
 
 
411 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  35.76 
 
 
411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  34.2 
 
 
419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  36.63 
 
 
398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  35.79 
 
 
412 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.8 
 
 
401 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  34.89 
 
 
418 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  35.25 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  32.84 
 
 
405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  33.16 
 
 
420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  36.08 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  35.5 
 
 
395 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  35 
 
 
406 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.76 
 
 
420 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.24 
 
 
407 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0622  cytochrome P450  36.1 
 
 
415 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  32.83 
 
 
417 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  34.59 
 
 
398 aa  196  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  36.34 
 
 
404 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  32.97 
 
 
418 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  32.65 
 
 
401 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  33.42 
 
 
427 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  33.42 
 
 
427 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  36.28 
 
 
418 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  34.75 
 
 
392 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  35.66 
 
 
410 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  33.42 
 
 
427 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  35.96 
 
 
395 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  36.05 
 
 
404 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  36.05 
 
 
404 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  34.09 
 
 
433 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  31.98 
 
 
411 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  35.93 
 
 
394 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  35.04 
 
 
398 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  32.94 
 
 
410 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  34.75 
 
 
401 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  34.6 
 
 
395 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  34.99 
 
 
427 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  34.99 
 
 
427 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  31.69 
 
 
408 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  34.99 
 
 
427 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  35.79 
 
 
428 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  33.52 
 
 
387 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  35.7 
 
 
395 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  34.45 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  31.74 
 
 
406 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  37.47 
 
 
398 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  32.41 
 
 
409 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.5 
 
 
426 aa  189  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  31.71 
 
 
404 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  36.11 
 
 
402 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  36.11 
 
 
402 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  36.59 
 
 
419 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  34.97 
 
 
413 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  37.24 
 
 
414 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3290  cytochrome P450  32.7 
 
 
417 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121591  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  30 
 
 
407 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3970  cytochrome P450  33.61 
 
 
436 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  33.77 
 
 
395 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4948  cytochrome P450  36.11 
 
 
402 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  34.68 
 
 
408 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>